【摘要】：目的構建Alport綜合征(AS)與正常對照者(NC)誘導多能干細胞(i PSCs)新核糖核苷酸(novel microRNA)差異性表達譜,分析其靶基因功能。方法采用前期工作成功從尿腎狀桿細胞誘導成的i PSCs,運用高通量測序平臺獲得AS與NC的差異性表達譜,使用靶基因預測軟件Target Scan進行靶基因預測,靶基因與參考基因比較后,在候選靶基因找到顯著富集的GO條目及KEGG通路。結果在AS與NC中發(fā)現49個有意義的差異性表達novel microRNAs,其中33個表達上調,16個表達下調。在GO靶基因富集分析中,靶基因主要富集于生物調節(jié)、生物新陳代謝、細胞組成、細胞信號傳導、酶催化反應、分子轉運等過程。在KEGG通路分析中,靶基因主要參與代謝通路、嘌呤代謝、癌癥轉錄調節(jié)等過程。結論來源于AS與NC的i PSCs存在較大的差異性表達novel microRNA,其靶基因在分子功能、細胞組成、生物過程起著重要作用。這些差異性表達的novel mciroRNAs與靶基因可能是AS發(fā)病機制的潛在位點。
[Abstract]:Objective to construct the differentially expressed (novel microRNA) profile of (i PSCs) new ribonucleotide in multipotent stem cells induced by (NC) in Alport syndrome (AS) and normal controls, and to analyze its target gene function. Methods the differentially expressed profiles of AS and NC were obtained by using high-throughput sequencing platform and the target gene prediction software (Target Scan) was used to predict the target gene, and the target gene was compared with the reference gene. Significant enrichment of GO entries and KEGG pathways were found in candidate target genes. Results 49 differentially expressed novel microRNAs, were found in AS and NC, of which 33 were up-regulated and 16 down-regulated. In the enrichment analysis of GO target genes, the target genes are mainly concentrated in the processes of biological regulation, biological metabolism, cell composition, cell signal transduction, enzymatic catalytic reaction, molecular transport and so on. In the analysis of KEGG pathway, target genes are involved in metabolic pathway, purine metabolism and cancer transcriptional regulation. Conclusion I PSCs derived from AS and NC has a great difference in the expression of novel microRNA,. The target gene plays an important role in molecular function, cell composition and biological process. These differentially expressed novel mciroRNAs and target genes may be potential sites for the pathogenesis of AS.
【作者單位】： 暨南大學第二臨床學院;深圳市人民醫(yī)院臨床醫(yī)學研究中心;
【基金】：廣東省深圳市科技計劃(JXY20140416122812045)
【分類號】：R692.3

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本文編號：2290701