【摘要】：目的構(gòu)建Alport綜合征(AS)與正常對(duì)照者(NC)誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(i PSCs)新核糖核苷酸(novel microRNA)差異性表達(dá)譜,分析其靶基因功能。方法采用前期工作成功從尿腎狀桿細(xì)胞誘導(dǎo)成的i PSCs,運(yùn)用高通量測(cè)序平臺(tái)獲得AS與NC的差異性表達(dá)譜,使用靶基因預(yù)測(cè)軟件Target Scan進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),靶基因與參考基因比較后,在候選靶基因找到顯著富集的GO條目及KEGG通路。結(jié)果在AS與NC中發(fā)現(xiàn)49個(gè)有意義的差異性表達(dá)novel microRNAs,其中33個(gè)表達(dá)上調(diào),16個(gè)表達(dá)下調(diào)。在GO靶基因富集分析中,靶基因主要富集于生物調(diào)節(jié)、生物新陳代謝、細(xì)胞組成、細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)、酶催化反應(yīng)、分子轉(zhuǎn)運(yùn)等過(guò)程。在KEGG通路分析中,靶基因主要參與代謝通路、嘌呤代謝、癌癥轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)等過(guò)程。結(jié)論來(lái)源于AS與NC的i PSCs存在較大的差異性表達(dá)novel microRNA,其靶基因在分子功能、細(xì)胞組成、生物過(guò)程起著重要作用。這些差異性表達(dá)的novel mciroRNAs與靶基因可能是AS發(fā)病機(jī)制的潛在位點(diǎn)。
[Abstract]:Objective to construct the differentially expressed (novel microRNA) profile of (i PSCs) new ribonucleotide in multipotent stem cells induced by (NC) in Alport syndrome (AS) and normal controls, and to analyze its target gene function. Methods the differentially expressed profiles of AS and NC were obtained by using high-throughput sequencing platform and the target gene prediction software (Target Scan) was used to predict the target gene, and the target gene was compared with the reference gene. Significant enrichment of GO entries and KEGG pathways were found in candidate target genes. Results 49 differentially expressed novel microRNAs, were found in AS and NC, of which 33 were up-regulated and 16 down-regulated. In the enrichment analysis of GO target genes, the target genes are mainly concentrated in the processes of biological regulation, biological metabolism, cell composition, cell signal transduction, enzymatic catalytic reaction, molecular transport and so on. In the analysis of KEGG pathway, target genes are involved in metabolic pathway, purine metabolism and cancer transcriptional regulation. Conclusion I PSCs derived from AS and NC has a great difference in the expression of novel microRNA,. The target gene plays an important role in molecular function, cell composition and biological process. These differentially expressed novel mciroRNAs and target genes may be potential sites for the pathogenesis of AS.
【作者單位】： 暨南大學(xué)第二臨床學(xué)院;深圳市人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究中心;
【基金】：廣東省深圳市科技計(jì)劃(JXY20140416122812045)
【分類號(hào)】：R692.3

【參考文獻(xiàn)】

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1 尹曉玲;周艷梅;鄒敏書;王嘉;劉桐林;唐錦輝;仇麗茹;陳瑜;袁惠卿;周建華;;62例兒童Alport綜合征臨床和病理特點(diǎn)[J];臨床兒科雜志;2013年12期

2 陳楠;;重視遺傳性腎臟疾病的篩查與診治[J];中國(guó)實(shí)用內(nèi)科雜志;2014年03期

3 李玉峰;衛(wèi)敏江;吳偉嵐;陳慧敏;沈加;董瑜;金晶;;兒童腎活檢977例病理及臨床分析[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2014年03期

4 王勇;厲泉;陳善良;王東;于建民;李敏;劉天起;;microRNA-133對(duì)終末期擴(kuò)張型心肌病心肌纖維化調(diào)控的作用[J];山東大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2015年05期

【共引文獻(xiàn)】

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3 黃勇;曹式麗;;中醫(yī)治未病思想在尿酸性腎病防治中的應(yīng)用[J];陜西中醫(yī);2014年05期

4 陳楠;王朝暉;;如何開(kāi)展遺傳性腎臟疾病的篩查[J];上海醫(yī)學(xué);2014年05期

5 李戈;楊程顯;李煜生;;膠原蛋白IV的生物學(xué)特性研究進(jìn)展[J];生命科學(xué);2014年09期

6 喻祥琪;黃建溶;林小聰;陳文標(biāo);戴勇;;基于誘導(dǎo)多潛能干細(xì)胞Alport綜合征的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J];中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué);2015年02期

7 張軍峰;;紫癜性腎炎病理類型與臨床特征的相關(guān)性研究[J];臨床合理用藥雜志;2015年17期

8 焦劍;車樹(shù)強(qiáng);趙亞;王瑩;范軍;馬麗;;清血湯聯(lián)合別嘌醇治療腎性高尿酸血癥的臨床療效觀察[J];天津中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2015年03期

9 宛彥;程琳;王曉云;徐明彤;嚴(yán)勵(lì);;血管緊張素Ⅱ?qū)π∈笠葝uβ細(xì)胞miR-375表達(dá)的影響[J];山東醫(yī)藥;2015年24期

10 陳文標(biāo);黃建溶;彭武建;林小聰;戴勇;;基于誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的Alport綜合征差異性表達(dá)小核糖核酸的生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2014年07期

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1 薛燕婷;尿液分離細(xì)胞來(lái)源非整合人誘導(dǎo)多能干細(xì)胞庫(kù)的建立[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2013年

2 歐明林;石骨癥發(fā)病的分子機(jī)制研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年

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1 高曉婷;腹膜透析患者血尿酸、同型半胱氨酸和超敏C反應(yīng)蛋白的變化及其意義[D];河北醫(yī)科大學(xué);2013年

2 王斯;特發(fā)性膜性腎病患者腎組織中SOD2的表達(dá)及意義[D];河北醫(yī)科大學(xué);2014年

3 張坤;人誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞體外誘導(dǎo)分化為造血干/祖細(xì)胞及低氧對(duì)分化過(guò)程的影響[D];濟(jì)南大學(xué);2014年

4 宣艷艷;尿蛋白陰性的2型糖尿病患者中高尿酸血癥和腎功能減退的關(guān)系[D];浙江大學(xué);2015年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 王芳,丁潔,俞禮霞,楊霽云;檢測(cè)皮膚成纖維細(xì)胞cDNA確定Alport綜合征COL4A5基因突變[J];北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2002年03期

2 黨西強(qiáng);易著文;何小解;吳小川;曹艷;莫雙紅;何慶南;關(guān)鳳軍;黃丹琳;;1316例小兒腎臟病臨床與病理分布特點(diǎn)[J];中國(guó)當(dāng)代兒科雜志;2007年02期

3 Wenwen Jia;Wen Chen;Jiuhong Kang;;The Functions of MicroRNAs and Long Non-coding RNAs in Embryonic and Induced Pluripotent Stem Cells[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2013年05期

4 盧宏柱;樊啟紅;周建華;;Alport綜合征29例臨床與病理分析[J];長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)醫(yī)學(xué)卷;2010年01期

5 王芳 ,丁潔 ,俞禮霞 ,楊霽云;中國(guó)Alport綜合征臨床特征[J];臨床兒科雜志;2003年10期

6 何旭;劉光陵;夏正坤;任獻(xiàn)國(guó);高遠(yuǎn)賦;樊忠民;付元鳳;伏潔;高春林;茅松;陳蓉;;兒童Alport綜合征30例腎臟和皮膚Ⅳ膠原分布特點(diǎn)[J];臨床兒科雜志;2009年04期

7 馬捷,張?zhí)┖?周曉軍,陸珍鳳,孫桂勤;小兒Alport綜合征的臨床病理分析[J];臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志;2001年06期

8 李運(yùn)泉;王慧深;;兒童高血壓[J];嶺南心血管病雜志;2011年S1期

9 陳彥;丁潔;黃建萍;;Ⅳ型膠原間接免疫熒光檢測(cè)在診斷不同遺傳型Alport綜合征中的應(yīng)用[J];實(shí)用兒科臨床雜志;2007年17期

10 陳惠萍,曾彩虹,胡偉新,王慶文,俞雨生,姚小丹,唐政,王建平,朱茂艷,周虹,劉紅,劉志紅,黎磊石;10594例腎活檢病理資料分析[J];腎臟病與透析腎移植雜志;2000年06期

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2 張義;李龍;岳信;田夫;;miRNA與腫瘤的研究進(jìn)展[J];長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版);2013年36期

3 ;[J];;年期

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1 汪乃}，

本文編號(hào)：2290701