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Apoe -/- 小鼠動(dòng)脈粥樣硬化差異基因及精制血府膠囊早期干預(yù)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-15 19:22
  實(shí)驗(yàn)一不同周齡Apoe-/-基因敲除小鼠動(dòng)脈粥樣硬化炎癥差異基因的演變目的:利用Agilent表達(dá)譜基因芯片篩查Apoe-/-基因敲除小鼠在10周齡、15周齡、25周齡不同時(shí)段差異基因的表達(dá)譜變化,并對(duì)篩選出的顯著變化的差異(炎癥)基因白細(xì)胞介素-12 α (IL-12α)、干擾素(Ifng)、基質(zhì)金屬蛋白酶-12(MMP12)、生長(zhǎng)分化因子-15(GDF-15)、白細(xì)胞介素-1β (IL-1β)進(jìn)行驗(yàn)證和演變分析。方法:60只Apoe-/-小鼠,雄性,隨機(jī)分為3組,每組20只。分別設(shè)定10周齡為動(dòng)脈粥樣硬化(AS)的初期組、15周齡為AS早期組、25周齡為AS晚期組。相同遺傳背景C57BL/6J野生型小鼠作為空白對(duì)照組(25周齡)。小鼠正常飲食飲水,在小鼠對(duì)應(yīng)周齡時(shí)麻醉后處死,取血及分離主動(dòng)脈弓,液氮保存。(1)不同周齡的差異基因篩選,提取總RNA檢驗(yàn)合格,反轉(zhuǎn)錄成雙鏈cDNA,再進(jìn)一步合成用Cyanine-3-CTP(Cy3)標(biāo)記的cRNA。標(biāo)記好的cRNA和芯片雜交,洗脫后利用Agilent掃描儀掃描得到原始圖像。采用Feature Extraction軟件處理原始圖像提取原始數(shù)... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

Apoe -/- 小鼠動(dòng)脈粥樣硬化差異基因及精制血府膠囊早期干預(yù)研究


10w,15}r,25w與對(duì)照組相比上調(diào)及下調(diào)基因數(shù)

對(duì)照組,中共,異基因


15w?VS對(duì)照組的差異基因,扣掉lOw?VS對(duì)照組、巧W?VS對(duì)54照組的差異基因??25w?VS對(duì)照組的差異基因,扣掉lOw?VS對(duì)照組、15w?VS對(duì)59照組的差異基因??lOw?VS對(duì)照組與15w?VS對(duì)照組中共有的差異基因,扣掉25w?VS?19對(duì)照組中的差異基因??lOwvs對(duì)照狙與25w?VS對(duì)照組中共有的差異基因,扣掉15wvs?34對(duì)照組中的差異基因??15WVS對(duì)照組與25w?VS對(duì)照組中共有的差異基因,扣掉lOw?VS?11對(duì)照組中的差異基因??lOw?VS對(duì)照組、1日W?VS對(duì)照狙、25w?VS對(duì)照組中共有的的差18異基因??

基因差異,火山,組間,基因


Apoe?/小鼠動(dòng)脈粥樣硬化差異基因及精制血府膠免早期干巧研系??2.2.3差異基因火山圖分布結(jié)果:??將比較所產(chǎn)生的差異表達(dá)情況反映到火山圖中,X軸是差異倍數(shù)為底取對(duì)??數(shù)的值,Y軸是p-value值為底取負(fù)對(duì)數(shù)的值。在設(shè)生物學(xué)重復(fù)的情況下(即??使用統(tǒng)計(jì)分析法分析差異表達(dá))將給出火山圖。其中灰色的點(diǎn)表示Fold絕對(duì)值小??于2,?P值>0.05的基因。紅色點(diǎn):Fold絕對(duì)值大于或等于2,且P《0.?05的基因,??這些基因?yàn)轱@著性差異基因?桑讖膱D中直觀的看出相對(duì)于其他組間比較,lOw??與15w相比顯著差異基因最少。而與對(duì)照組相比,各組顯著差異基因數(shù)量較大。??


本文編號(hào):2979377

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