實(shí)驗(yàn)一不同周齡Apoe-/-基因敲除小鼠動(dòng)脈粥樣硬化炎癥差異基因的演變目的：利用Agilent表達(dá)譜基因芯片篩查Apoe-/-基因敲除小鼠在10周齡、15周齡、25周齡不同時(shí)段差異基因的表達(dá)譜變化,并對(duì)篩選出的顯著變化的差異（炎癥）基因白細(xì)胞介素-12 α （IL-12α）、干擾素（Ifng）、基質(zhì)金屬蛋白酶-12（MMP12）、生長分化因子-15（GDF-15）、白細(xì)胞介素-1β （IL-1β）進(jìn)行驗(yàn)證和演變分析。方法：60只Apoe-/-小鼠,雄性,隨機(jī)分為3組,每組20只。分別設(shè)定10周齡為動(dòng)脈粥樣硬化（AS）的初期組、15周齡為AS早期組、25周齡為AS晚期組。相同遺傳背景C57BL/6J野生型小鼠作為空白對(duì)照組（25周齡）。小鼠正常飲食飲水,在小鼠對(duì)應(yīng)周齡時(shí)麻醉后處死,取血及分離主動(dòng)脈弓,液氮保存。（1）不同周齡的差異基因篩選,提取總RNA檢驗(yàn)合格,反轉(zhuǎn)錄成雙鏈cDNA,再進(jìn)一步合成用Cyanine-3-CTP（Cy3）標(biāo)記的cRNA。標(biāo)記好的cRNA和芯片雜交,洗脫后利用Agilent掃描儀掃描得到原始圖像。采用Feature Extraction軟件處理原始圖像提取原始數(shù)... 

【文章來源】：中國中醫(yī)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

10w,15}r,25w與對(duì)照組相比上調(diào)及下調(diào)基因數(shù)

１５ｗ?ＶＳ對(duì)照組的差異基因，扣掉ｌＯｗ?ＶＳ對(duì)照組、巧Ｗ?ＶＳ對(duì)５４照組的差異基因??２５ｗ?ＶＳ對(duì)照組的差異基因，扣掉ｌＯｗ?ＶＳ對(duì)照組、１５ｗ?ＶＳ對(duì)５９照組的差異基因??ｌＯｗ?ＶＳ對(duì)照組與１５ｗ?ＶＳ對(duì)照組中共有的差異基因，扣掉２５ｗ?ＶＳ?１９對(duì)照組中的差異基因??ｌＯｗｖｓ對(duì)照狙與２５ｗ?ＶＳ對(duì)照組中共有的差異基因，扣掉１５ｗｖｓ?３４對(duì)照組中的差異基因??１５ＷＶＳ對(duì)照組與２５ｗ?ＶＳ對(duì)照組中共有的差異基因，扣掉ｌＯｗ?ＶＳ?１１對(duì)照組中的差異基因??ｌＯｗ?ＶＳ對(duì)照組、１日Ｗ?ＶＳ對(duì)照狙、２５ｗ?ＶＳ對(duì)照組中共有的的差１８異基因??

Ａｐｏｅ?／小鼠動(dòng)脈粥樣硬化差異基因及精制血府膠免早期干巧研系??２．２．３差異基因火山圖分布結(jié)果：??將比較所產(chǎn)生的差異表達(dá)情況反映到火山圖中，Ｘ軸是差異倍數(shù)為底取對(duì)??數(shù)的值，Ｙ軸是ｐ－ｖａｌｕｅ值為底取負(fù)對(duì)數(shù)的值。在設(shè)生物學(xué)重復(fù)的情況下（即??使用統(tǒng)計(jì)分析法分析差異表達(dá)）將給出火山圖。其中灰色的點(diǎn)表示Ｆｏｌｄ絕對(duì)值小??于２，?Ｐ值＞０．０５的基因。紅色點(diǎn)：Ｆｏｌｄ絕對(duì)值大于或等于２，且Ｐ《０．?０５的基因，??這些基因?yàn)轱@著性差異基因�？桑讖膱D中直觀的看出相對(duì)于其他組間比較，ｌＯｗ??與１５ｗ相比顯著差異基因最少。而與對(duì)照組相比，各組顯著差異基因數(shù)量較大。??


本文編號(hào)：2979377