慢性、頑固性牙周炎的血液和唾液組織表達譜比較分析病例報告
發(fā)布時間:2024-03-04 18:33
目的:本文通過比較分析慢性牙周炎(CP)、頑固性牙周炎(RP)的血液和唾液組織中基因表達譜,篩選不同類型牙周炎在不同組織中具有特征代表性的基因,為區(qū)分和治療不同類型牙周炎提供幫助。材料與方法:從GEO數(shù)據(jù)庫中下載GSE43525數(shù)據(jù),共23個患者血液和唾液組織表達譜樣本:13個樣本來自血液(包括4個正常人,4個CP,5個RP),10個樣本來自唾液(包括3個正常人,4個CP,3個RP)。我們首先對每種類型的表達譜樣本進行了樣本描述比較,用limma軟件包篩選兩種牙周炎分別在血液和唾液中的差異表達基因,再對各組中篩選得到的差異表達基因進行層次聚類分析,然后分別用DAVID和KOBAS軟件包進行功能富集及通路分析,最后借助WebGestalt方法,搜索得到顯著相關的miRNA。結果:CP樣本得到213個差異表達基因(DEGs),RP樣本得到45個DEGs。功能富集分析顯示CP患者血液和唾液的DEGs主要分別富集于與翻譯相關生物學過程及細胞凋亡調(diào)控的通路上;而RP患者血液和唾液的DEGs主要分別富集在免疫應答的生物學過程及對有機物和細菌感染反應的通路上。搜索得到了一些與CP相關的miRNA如m...
【文章頁數(shù)】:569 頁
【學位級別】:博士
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本文編號:3919049
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