背景:人體腸道中定植了一百萬億的微生物,它們被稱為腸道菌群。隨著測序技術的快速發(fā)展,腸道菌群的研究也越來越多,很多人都認為腸道菌群更像是一個器官,因為腸道菌群可起到預防腸道致病菌感染的作用,可以從我們的飲食中提取營養(yǎng)和能量,并在正常的免疫功能中發(fā)揮作用。但如果出現(xiàn)了菌群失調的情況,也可能產(chǎn)生一些致癌物質,或者通過影響宿主的糖、脂肪、蛋白質、炎癥因子等物質代謝和轉化導致疾病或者產(chǎn)生不適,對人體健康造成不利的影響。牙周炎是與牙齒生物膜功能失調有關的復雜的發(fā)炎性疾病,可引起牙周支持組織的長期慢性炎癥,牙周炎與其他疾病之間存在一種機制,即牙周病原體及其致病因子可以到達遠處的器官,然后引起系統(tǒng)性炎癥并影響宿主的免疫防御。近年來,關于牙周炎和系統(tǒng)性疾病的研究越來越多,但是有關腸道菌群和牙周炎之間的關系的研究很少,更缺少相關的基礎研究。目的:因此本研究擬通過動物實驗的方式,用16S rDNA測序技術探究牙周炎大鼠模型的腸道中菌群的數(shù)量和結構的變化,通過菌群的組成和豐度變化揭示牙周炎和腸道菌群的關系。方法:選取22只8周齡的SPF級SD大鼠,計算機隨機分為牙周炎組和對照組。牙周炎組的大鼠經(jīng)過適應性飼養(yǎng)... 

【文章來源】：河南大學河南省

【文章頁數(shù)】：90 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

實驗流程

大鼠牙周炎對腸道菌群多樣性的影響10圖2-2數(shù)據(jù)分析流程2.2.5.2測序數(shù)據(jù)處理原始的數(shù)據(jù)經(jīng)過質量過濾和數(shù)據(jù)拼接后，將相似度在97%的以上的tags聚類為一個操作分類單元（OperationalTaxonomicUnits，OTU）。通過數(shù)據(jù)庫的對比生成各樣本OTU表，基于OTU數(shù)據(jù)繪制OTUVenn圖、OTUPCA分析、OTUPLS-DA分析、OTU累積曲線圖和OTURank曲線。采用RDPclassifier貝葉斯算法對OTU序列進行分類學分析，并通過繪制物種豐度柱狀圖、關鍵物種差異比較柱狀圖對比兩組之間的物種變化情況。基于OTU數(shù)據(jù)進行單一樣本的α多樣性和樣本間β多樣性分析。2.2.6數(shù)據(jù)分析本研究的統(tǒng)計分析采用定量和定性兩種方法，數(shù)據(jù)記錄采用Excel2016，數(shù)據(jù)處理采用R軟件。腸道菌群的分析主要采用USEARCH（v11.0.667）、UCHIME（v4.2.40）、FastTree（version2.1.3）、R（v3.1.1）、FLASH（v1.2.11）和RDPclassifier貝葉斯算法等進行統(tǒng)計學分析和圖像繪制。正態(tài)分布的連續(xù)性數(shù)據(jù)用“均數(shù)±標準差（mean±SD）”表示，非正態(tài)的的連續(xù)性數(shù)據(jù)用“中位數(shù)，四分位數(shù)”表示，各組間兩兩比較用SNK-q檢驗，P<0.05認為具有統(tǒng)計學差異。

3結果113結果3.1牙周建模結果3.1.1Micro-CT掃描結果通過SkyScan1176活體小動物CT對大鼠實驗牙牙槽骨進行掃描，掃描參數(shù)：以9um空間分辨率進行360o旋轉，管內電壓58KV-429uA，圖像分辨率4000×2672。通過NReCon進行三維重構，CTvox軟件獲取3D圖片。結果提示：未進行牙周實驗的對照組的牙槽骨未發(fā)現(xiàn)明顯吸收，而牙周炎組的第二磨牙近中、遠中牙槽嵴頂、根分叉處均發(fā)生明顯吸收。（結果見圖3-1，圖3-2）圖3-1牙周炎組Micro-CT掃描結果圖3-2對照組Micro-CT掃描結果

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3603298