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大鼠牙周炎對(duì)腸道菌群多樣性的影響

發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 01:19
  背景:人體腸道中定植了一百萬(wàn)億的微生物,它們被稱為腸道菌群。隨著測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,腸道菌群的研究也越來(lái)越多,很多人都認(rèn)為腸道菌群更像是一個(gè)器官,因?yàn)槟c道菌群可起到預(yù)防腸道致病菌感染的作用,可以從我們的飲食中提取營(yíng)養(yǎng)和能量,并在正常的免疫功能中發(fā)揮作用。但如果出現(xiàn)了菌群失調(diào)的情況,也可能產(chǎn)生一些致癌物質(zhì),或者通過(guò)影響宿主的糖、脂肪、蛋白質(zhì)、炎癥因子等物質(zhì)代謝和轉(zhuǎn)化導(dǎo)致疾病或者產(chǎn)生不適,對(duì)人體健康造成不利的影響。牙周炎是與牙齒生物膜功能失調(diào)有關(guān)的復(fù)雜的發(fā)炎性疾病,可引起牙周支持組織的長(zhǎng)期慢性炎癥,牙周炎與其他疾病之間存在一種機(jī)制,即牙周病原體及其致病因子可以到達(dá)遠(yuǎn)處的器官,然后引起系統(tǒng)性炎癥并影響宿主的免疫防御。近年來(lái),關(guān)于牙周炎和系統(tǒng)性疾病的研究越來(lái)越多,但是有關(guān)腸道菌群和牙周炎之間的關(guān)系的研究很少,更缺少相關(guān)的基礎(chǔ)研究。目的:因此本研究擬通過(guò)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的方式,用16S rDNA測(cè)序技術(shù)探究牙周炎大鼠模型的腸道中菌群的數(shù)量和結(jié)構(gòu)的變化,通過(guò)菌群的組成和豐度變化揭示牙周炎和腸道菌群的關(guān)系。方法:選取22只8周齡的SPF級(jí)SD大鼠,計(jì)算機(jī)隨機(jī)分為牙周炎組和對(duì)照組。牙周炎組的大鼠經(jīng)過(guò)適應(yīng)性飼養(yǎng)... 

【文章來(lái)源】:河南大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

大鼠牙周炎對(duì)腸道菌群多樣性的影響


實(shí)驗(yàn)流程

流程圖,數(shù)據(jù)分析,流程,腸道菌群


大鼠牙周炎對(duì)腸道菌群多樣性的影響10圖2-2數(shù)據(jù)分析流程2.2.5.2測(cè)序數(shù)據(jù)處理原始的數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)質(zhì)量過(guò)濾和數(shù)據(jù)拼接后,將相似度在97%的以上的tags聚類為一個(gè)操作分類單元(OperationalTaxonomicUnits,OTU)。通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)的對(duì)比生成各樣本OTU表,基于OTU數(shù)據(jù)繪制OTUVenn圖、OTUPCA分析、OTUPLS-DA分析、OTU累積曲線圖和OTURank曲線。采用RDPclassifier貝葉斯算法對(duì)OTU序列進(jìn)行分類學(xué)分析,并通過(guò)繪制物種豐度柱狀圖、關(guān)鍵物種差異比較柱狀圖對(duì)比兩組之間的物種變化情況;贠TU數(shù)據(jù)進(jìn)行單一樣本的α多樣性和樣本間β多樣性分析。2.2.6數(shù)據(jù)分析本研究的統(tǒng)計(jì)分析采用定量和定性兩種方法,數(shù)據(jù)記錄采用Excel2016,數(shù)據(jù)處理采用R軟件。腸道菌群的分析主要采用USEARCH(v11.0.667)、UCHIME(v4.2.40)、FastTree(version2.1.3)、R(v3.1.1)、FLASH(v1.2.11)和RDPclassifier貝葉斯算法等進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析和圖像繪制。正態(tài)分布的連續(xù)性數(shù)據(jù)用“均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)”表示,非正態(tài)的的連續(xù)性數(shù)據(jù)用“中位數(shù),四分位數(shù)”表示,各組間兩兩比較用SNK-q檢驗(yàn),P<0.05認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

牙周炎,牙槽骨


3結(jié)果113結(jié)果3.1牙周建模結(jié)果3.1.1Micro-CT掃描結(jié)果通過(guò)SkyScan1176活體小動(dòng)物CT對(duì)大鼠實(shí)驗(yàn)牙牙槽骨進(jìn)行掃描,掃描參數(shù):以9um空間分辨率進(jìn)行360o旋轉(zhuǎn),管內(nèi)電壓58KV-429uA,圖像分辨率4000×2672。通過(guò)NReCon進(jìn)行三維重構(gòu),CTvox軟件獲取3D圖片。結(jié)果提示:未進(jìn)行牙周實(shí)驗(yàn)的對(duì)照組的牙槽骨未發(fā)現(xiàn)明顯吸收,而牙周炎組的第二磨牙近中、遠(yuǎn)中牙槽嵴頂、根分叉處均發(fā)生明顯吸收。(結(jié)果見(jiàn)圖3-1,圖3-2)圖3-1牙周炎組Micro-CT掃描結(jié)果圖3-2對(duì)照組Micro-CT掃描結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]《中國(guó)心血管病報(bào)告2018》概要[J]. 胡盛壽,高潤(rùn)霖,劉力生,朱曼璐,王文,王擁軍,吳兆蘇,李惠君,顧東風(fēng),楊躍進(jìn),鄭哲,陳偉偉.  中國(guó)循環(huán)雜志. 2019(03)
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[4]Leaky gut and the liver: A role for bacterial translocation in nonalcoholic steatohepatitis[J]. Yaron Ilan.  World Journal of Gastroenterology. 2012(21)
[5]幽門螺桿菌口腔定植和胃腸疾病的關(guān)聯(lián)性研究[J]. 陳駿,何祥一,吳凌莉,車團(tuán)結(jié).  華西口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2011(04)
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