背景:全基因組表達(dá)譜芯片是一種用于基因表達(dá)研究的技術(shù)手段,具有高度敏感性以及特異性,它可以在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與慢性牙周炎相關(guān)的差異基因,從而高效快速地發(fā)現(xiàn)與慢性牙周炎密切相關(guān)的因子。目的:應(yīng)用全基因組表達(dá)譜芯片篩選慢性牙周炎相關(guān)基因。方法:選取15例正畸拔牙患者正常牙周膜組織作為對(duì)照組,21例慢性牙周炎患者牙周組織。比對(duì)4例慢性牙周炎組織和4例正常組織的全基因組表達(dá)譜芯片,篩選出上調(diào)基因及下調(diào)基因。通過(guò)Real-TimePCR（7例正常及13例患者）和Western Blot（4例正常及4例患者）對(duì)2組牙周膜組織中差異基因PI3K-Akt信號(hào)通路的表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證。實(shí)驗(yàn)方案由海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)（批準(zhǔn)號(hào):HNM20180034）并獲得所有患者的知情同意。結(jié)果與結(jié)論:①全基因組表達(dá)譜芯片結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)慢性牙周炎樣本中均存在顯著差異表達(dá)的上調(diào)基因1 565個(gè),下調(diào)基因1 849個(gè);②富集分析發(fā)現(xiàn)其中在慢性牙周炎中PI3K-Akt信號(hào)通路表達(dá)有顯著差異（P <0.001）;③Real-Time PCR及Western Blot檢測(cè)發(fā)現(xiàn)PI3K及Akt的m RNA和蛋白在慢性... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)組織工程研究. 2020,24(23)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

圖1 兩組全基因組表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)差異倍數(shù)柱狀圖

對(duì)照組對(duì)比慢性牙周炎臨床樣本火山圖

聚類(lèi)分析的相關(guān)數(shù)據(jù)包含基因名稱(chēng)的聚類(lèi)圖。聚類(lèi)分析是通過(guò)數(shù)據(jù)建模簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)的一種方法，目的在于獲得數(shù)據(jù)的分布狀況，觀察每一簇?cái)?shù)據(jù)的特征。并以距離指標(biāo)描述樣本簇之間的關(guān)聯(lián)性，見(jiàn)圖3。分析中以差異表達(dá)基因探針訊號(hào)差異(該探針在所有芯片間的訊號(hào)值差異大于31 000)篩選出的294基因探針進(jìn)入分析。2.1.3 功能富集分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]The cytokine network involved in the host immune response to periodontitis[J]. Weiyi Pan,Qingxuan Wang,Qianming Chen.  International Journal of Oral Science. 2019(04)
[2]Differential gene expression profiling of gastric intraepithelial neoplasia and early-stage adenocarcinoma[J]. Xue Xu,Lin Feng,Yu Liu,Wei-Xun Zhou,Ying-Cai Ma,Gui-Jun Fei,Ning An,Yuan Li,Xi Wu,Fang Yao,Shu-Jun Cheng,Xing-Hua Lu.  World Journal of Gastroenterology. 2014(47)



本文編號(hào)：3568745