本文關(guān)鍵詞：淫羊藿苷誘導(dǎo)人牙周膜干細(xì)胞成骨分化的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是核苷酸序列大于200nt,不編碼蛋白的新型RNA分子。有學(xué)者認(rèn)為,lncRNA在調(diào)控細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育的過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用,尤其對(duì)于干細(xì)胞增值和分化的調(diào)節(jié)。通過(guò)分析lnc RNA在淫羊藿苷(Icariin,ICA)誘導(dǎo)人牙周膜干細(xì)胞(Human periodontal ligament stem cells,hPDLSCs)成骨分化前后的差異性表達(dá),篩選出與成骨分化密切相關(guān)的lncRNA,初步探討其功能和意義,為PDLSCs成骨分化的功能和機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ)。方法:(1)采用lncRNA表達(dá)譜芯片檢測(cè)ICA誘導(dǎo)hPDLSCs成骨分化前后的表達(dá)差異,篩選出差異表達(dá)2倍以上,P0.05的mRNAs和lncRNAs;(2)生物信息學(xué)方法分析差異表達(dá)分子,預(yù)測(cè)成骨相關(guān)lncRNA的靶基因;(3)qRT-PCR驗(yàn)證lnc RNA表達(dá)譜芯片結(jié)果,檢測(cè)差異基因的表達(dá)水平;(4)結(jié)合生物信息學(xué)分析,qRT-PCR結(jié)果以及查閱相關(guān)文獻(xiàn),初步篩選成骨相關(guān)lncRNA。結(jié)果:(1)采用lncRNA芯片,篩選出差異表達(dá)水平2倍以上,P0.05的lnc RNAs共48個(gè),mRNAs共117個(gè);(2)通過(guò)生物信息學(xué)分析,得到差異基因功能富集情況,每個(gè)信號(hào)通路上差異表達(dá)基因富集程度以及差異mRNAs和lnc RNAs的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò);(3)qRT-PCR驗(yàn)證了6個(gè)分子的表達(dá)水平,其趨勢(shì)與芯片結(jié)果基本一致;(4)最終選擇lncRNA-p16340和lncRNA-p21662作為成骨相關(guān)目標(biāo)分子,為機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)論:通過(guò)lnc RNA表達(dá)譜芯片的檢測(cè)和篩選,qRT-PCR的驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)成骨分化相關(guān)分子—lncRNA-p16340和lnc RNA-p21662,它們隨著成骨誘導(dǎo)時(shí)間的增加,其表達(dá)逐漸成上升趨勢(shì),提示可能與成骨分化的調(diào)控密切相關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：長(zhǎng)鏈非編碼RNA 基因芯片 牙周膜干細(xì)胞 成骨分化
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R781.4
【目錄】：

• 中文摘要3-4
• Astract4-6
• 縮略詞表6-10
• 第一章 引言10-20
• 1.1 牙周病的概述10
• 1.2 牙周膜干細(xì)胞（PDLSCs）的分化10-11
• 1.3 淫羊藿苷（ICA）的促成骨作用11-12
• 1.4 長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）的簡(jiǎn)介12-20
• 1.4.1 lnc RNA的功能12-14
• 1.4.2 lnc RNA在基因組中的調(diào)節(jié)14-15
• 1.4.3 lnc RNA對(duì)生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控15-16
• 1.4.4 lnc RNA對(duì)細(xì)胞多能性和分化的調(diào)控16-17
• 1.4.5 lnc RNA對(duì)表觀遺傳的影響17-20
• 第二章 研究?jī)?nèi)容和技術(shù)路線20-23
• 2.1 研究?jī)?nèi)容20
• 2.1.1 ICA誘導(dǎo)hPDLSCs成骨分化20
• 2.1.2 lnc RNA芯片檢測(cè)ICA誘導(dǎo)hPDLSCs成骨分化的差異表達(dá)20
• 2.1.3 定量分析成骨分化差異表達(dá)的mRNAs和lncRNAs20
• 2.1.4 篩選成骨相關(guān)lncRNA20
• 2.2 論文研究目的和意義20-21
• 2.3 論文研究方案及技術(shù)路線21-23
• 2.3.1 研究方案21-22
• 2.3.2 技術(shù)路線22-23
• 第三章 實(shí)驗(yàn)器材和方法23-33
• 3.1 實(shí)驗(yàn)器材23-24
• 3.1.1 主要原料與試劑23
• 3.1.2 主要儀器與設(shè)備23-24
• 3.2 實(shí)驗(yàn)方法24-33
• 3.2.1 hPDLSCs的分離、培養(yǎng)和鑒定24
• 3.2.2 最佳濃度ICA誘導(dǎo)液的配制24-25
• 3.2.3 茜素紅染色觀察鈣結(jié)節(jié)的形成25
• 3.2.4 qRT-PCR檢測(cè)成骨相關(guān)基因表達(dá)25-26
• 3.2.5 lnc RNA表達(dá)譜芯片測(cè)定差異表達(dá)基因26-30
• 3.2.6 生物信息學(xué)分析芯片數(shù)據(jù)30-31
• 3.2.7 引物設(shè)計(jì)與合成31-32
• 3.2.8 qRT-PCR驗(yàn)證芯片結(jié)果32-33
• 第四章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析33-41
• 4.1 hPDLSCs的分離、培養(yǎng)和鑒定33-34
• 4.2 hPDLSCs成骨能力分析34-35
• 4.3 lnc RNA芯片檢測(cè)結(jié)果35-36
• 4.4 成骨相關(guān)lncRNA的靶基因36-39
• 4.4.1 靶基因預(yù)測(cè)結(jié)果36
• 4.4.2 靶基因Gene Ontology分析(GO分析)36-37
• 4.4.3 靶基因Pathway分析37
• 4.4.4 靶基因lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析37-39
• 4.5 qRT-PCR的結(jié)果分析39-40
• 4.6 成骨相關(guān)lncRNA的篩選40-41
• 第五章 討論41-43
• 第六章 結(jié)論43-44
• 參考文獻(xiàn)44-52
• 在學(xué)期間的研究成果52-53
• 致謝53

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 秦子順;殷麗華;王開(kāi)娟;劉琪;程文曉;高鵬;孫可墨;鐘梅;余占海;;淫羊藿苷促進(jìn)人牙周膜干細(xì)胞增殖及骨向分化的作用[J];華西口腔醫(yī)學(xué)雜志;2015年04期

2 高鵬;程文曉;王開(kāi)娟;孫可墨;鐘梅;秦子順;殷麗華;余占海;;人參皂苷Rg1促進(jìn)人牙周膜干細(xì)胞增殖及骨向分化[J];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2015年01期

3 殷麗華;劉琪;余占海;秦子順;;牙周膜干細(xì)胞的生物學(xué)特性及其作為種子細(xì)胞在牙周組織工程中應(yīng)用的研究進(jìn)展[J];吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2013年02期

  本文關(guān)鍵詞：淫羊藿苷誘導(dǎo)人牙周膜干細(xì)胞成骨分化的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：313102