C反應(yīng)蛋白基因多態(tài)性及牙周致病菌在慢性牙周炎和冠心病相關(guān)性中研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-12 13:39
目的:(1)探討C反應(yīng)蛋白(C reactive protein, CRP)基因(+1059G>C rs1800947,+1444C>Trs1130864)的基因多態(tài)性、單倍型與慢性牙周炎(chronic periodontitis,CP)、冠心。╟oronary heartdisease, CHD)、慢性牙周炎伴冠心。–P+CHD)易感性的關(guān)系;(2)探討慢性牙周炎與冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟。ㄒ韵潞(jiǎn)稱冠心病)發(fā)病的相關(guān)性機(jī)制。方法:(1)中重度CP患者100例、CHD患者98例、中重度CP伴CHD患者92例與125例健康對(duì)照者(CONTROL)的煩黏膜拭子,提取DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性法對(duì)+1059G>Crs 1800947,+1444C>Trs1130864位點(diǎn)的基因分型,及對(duì)CP伴CHD組和健康對(duì)照組測(cè)序檢測(cè)2個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)單倍型;(2)對(duì)合并組患者隨機(jī)抽取38例收集冠狀動(dòng)脈粥樣硬化斑塊和齦下菌斑,采用Chelex-100法提取細(xì)菌DNA,以實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)(RTQ-PCR)法檢測(cè)冠狀動(dòng)脈粥樣硬化斑塊和齦下菌斑中具核梭桿菌(Fn)、...
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
+10596>Crs1800947擴(kuò)增產(chǎn)物GG型
對(duì)照組與cP伴cHD組單倍型檢測(cè)所用PcR產(chǎn)物分析,PCR產(chǎn)物 780bp基因組DNA抽提產(chǎn)物經(jīng)質(zhì)量分?jǐn)?shù)1%瓊脂糖凝膠電泳分析證實(shí),產(chǎn)物基本完整,無(wú)斷裂,純度較高。見(jiàn)圖3。產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果見(jiàn)圖4,圖5。1.3四組基因多態(tài)性比較由于 rs1800947的CC基因型純合子和 rs1800947的TT基因型的純合子檢出較少,故在統(tǒng)計(jì)分析時(shí)分別將CC基因型與GC基因型合并后再與GG基因型比較,CT基因型與TT基因型合并后與再CC基因型比較。并且分別比較 rsl800947位點(diǎn)的G基因型與C基因型在對(duì)照組與其余各組差異, rs1130864位點(diǎn)C基因型和T基因型在對(duì)照組與其余各組的差異。比較分析結(jié)果::51800947和rSll30864基因多態(tài)性位點(diǎn)在4組統(tǒng)計(jì)學(xué)均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義, rsl130864多態(tài)性位點(diǎn)在CP伴CHD組與健康對(duì)照組間比較P值最小 (0.086,0.065)是否提示差異有擴(kuò)大趨勢(shì)值得進(jìn)一步研究。表4:健康對(duì)照組與合并組基因多態(tài)性比較 :rs1800947的CC+GC基因型與GG基[Xl型比較,z’=0.959,作0.320
2.2熒光定量PCR檢測(cè)具核梭桿菌(FN)福塞斯坦納菌(TF)及內(nèi)參基因標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)引物濃度、退火溫度、延伸步驟等進(jìn)行優(yōu)化,確定最佳的實(shí)時(shí)熒光定量PCR的反應(yīng)體系(25閃)為:SYBRGreenl熒光染料混合物12.5川,上游及下游引物各0.5州,重組質(zhì)粒DNAZ州,無(wú)菌去離子水9.5閃。反應(yīng)條件為:95℃2分鐘,95℃10秒鐘,60℃40秒鐘,進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。標(biāo)準(zhǔn)品可以得到較好的擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)曲線和融解曲線,標(biāo)準(zhǔn)曲線顯示線性關(guān)系良好(內(nèi)參基因總菌165v3區(qū)相關(guān)系數(shù)對(duì)二0.997,目的基因FN相關(guān)系數(shù)擴(kuò)一0.997,目的基因TF相關(guān)系數(shù)對(duì)一0.995),可以在寬廣的范圍內(nèi)進(jìn)行準(zhǔn)確定量;擴(kuò)增效率較好(內(nèi)參基因總菌165V3區(qū):E二101%,目的基因FN:E一101%,目的基因TF:E=95%),目的基因融解曲線峰形單一,說(shuō)明反應(yīng)特異性好。總菌165通用引物357F、518R擴(kuò)出的基因熔解曲線較亂,而且有少量標(biāo)本有雙峰,這是因?yàn)闃悠分杏懈鞣N不同菌,不同菌的165V3區(qū)基因序列有差別,造成總菌357F、518R
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兔牙周炎與動(dòng)脈粥樣硬化結(jié)合模型建立及研究[J]. 張?jiān)疵?周曉歡,鐘良軍,高云,倪佳,徐雋. 中華實(shí)用診斷與治療雜志. 2010(05)
[2]血清C反應(yīng)蛋白在大鼠慢性牙周炎合并動(dòng)脈粥樣硬化模型中的表達(dá)[J]. 倪佳,張?jiān)疵?徐雋,鐘良軍,史芳川,周曉歡. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2009(02)
[3]C反應(yīng)蛋白基因多態(tài)性及冠心病相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 翁良,趙昕. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2008(08)
[4]冠心病患者的牙周狀況與hs-CRP和HDL-C的相關(guān)性研究[J]. 周驄,聶敏海,李家富,胡佳. 實(shí)用口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2008(03)
[5]牙周疾病與冠狀動(dòng)脈性心臟病的關(guān)系[J]. 歐陽(yáng)翔英. 北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2008(01)
[6]冠心病和慢性牙周炎相關(guān)性研究[J]. 張?jiān)疵?鐘良軍,何秉賢,聶晶,王璇,李文超. 中華流行病學(xué)雜志. 2006(03)
[7]牙菌斑與全身疾病的關(guān)系[J]. 楊懋彬,周學(xué)東. 國(guó)外醫(yī)學(xué).口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè). 2005(01)
[8]伴放線放線桿菌flp-1基因遺傳多樣性分析[J]. 劉冬宇,王者玲,王明榮,徐昕,蔡巖,楊圣輝. 北京口腔醫(yī)學(xué). 2004(01)
[9]PCR直接檢測(cè)齦下菌斑主要可疑牙周致病菌[J]. 王者玲,崗本公彰,楊圣輝,前田伸子,李金陸,母瑞紅,劉潁. 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2003(02)
[10]牙周病與冠心病的相關(guān)性研究[J]. 張衛(wèi)東. 國(guó)外醫(yī)學(xué).口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè). 2002(04)
本文編號(hào):2972948
【文章來(lái)源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
+10596>Crs1800947擴(kuò)增產(chǎn)物GG型
對(duì)照組與cP伴cHD組單倍型檢測(cè)所用PcR產(chǎn)物分析,PCR產(chǎn)物 780bp基因組DNA抽提產(chǎn)物經(jīng)質(zhì)量分?jǐn)?shù)1%瓊脂糖凝膠電泳分析證實(shí),產(chǎn)物基本完整,無(wú)斷裂,純度較高。見(jiàn)圖3。產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果見(jiàn)圖4,圖5。1.3四組基因多態(tài)性比較由于 rs1800947的CC基因型純合子和 rs1800947的TT基因型的純合子檢出較少,故在統(tǒng)計(jì)分析時(shí)分別將CC基因型與GC基因型合并后再與GG基因型比較,CT基因型與TT基因型合并后與再CC基因型比較。并且分別比較 rsl800947位點(diǎn)的G基因型與C基因型在對(duì)照組與其余各組差異, rs1130864位點(diǎn)C基因型和T基因型在對(duì)照組與其余各組的差異。比較分析結(jié)果::51800947和rSll30864基因多態(tài)性位點(diǎn)在4組統(tǒng)計(jì)學(xué)均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義, rsl130864多態(tài)性位點(diǎn)在CP伴CHD組與健康對(duì)照組間比較P值最小 (0.086,0.065)是否提示差異有擴(kuò)大趨勢(shì)值得進(jìn)一步研究。表4:健康對(duì)照組與合并組基因多態(tài)性比較 :rs1800947的CC+GC基因型與GG基[Xl型比較,z’=0.959,作0.320
2.2熒光定量PCR檢測(cè)具核梭桿菌(FN)福塞斯坦納菌(TF)及內(nèi)參基因標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)引物濃度、退火溫度、延伸步驟等進(jìn)行優(yōu)化,確定最佳的實(shí)時(shí)熒光定量PCR的反應(yīng)體系(25閃)為:SYBRGreenl熒光染料混合物12.5川,上游及下游引物各0.5州,重組質(zhì)粒DNAZ州,無(wú)菌去離子水9.5閃。反應(yīng)條件為:95℃2分鐘,95℃10秒鐘,60℃40秒鐘,進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。標(biāo)準(zhǔn)品可以得到較好的擴(kuò)增曲線、標(biāo)準(zhǔn)曲線和融解曲線,標(biāo)準(zhǔn)曲線顯示線性關(guān)系良好(內(nèi)參基因總菌165v3區(qū)相關(guān)系數(shù)對(duì)二0.997,目的基因FN相關(guān)系數(shù)擴(kuò)一0.997,目的基因TF相關(guān)系數(shù)對(duì)一0.995),可以在寬廣的范圍內(nèi)進(jìn)行準(zhǔn)確定量;擴(kuò)增效率較好(內(nèi)參基因總菌165V3區(qū):E二101%,目的基因FN:E一101%,目的基因TF:E=95%),目的基因融解曲線峰形單一,說(shuō)明反應(yīng)特異性好。總菌165通用引物357F、518R擴(kuò)出的基因熔解曲線較亂,而且有少量標(biāo)本有雙峰,這是因?yàn)闃悠分杏懈鞣N不同菌,不同菌的165V3區(qū)基因序列有差別,造成總菌357F、518R
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兔牙周炎與動(dòng)脈粥樣硬化結(jié)合模型建立及研究[J]. 張?jiān)疵?周曉歡,鐘良軍,高云,倪佳,徐雋. 中華實(shí)用診斷與治療雜志. 2010(05)
[2]血清C反應(yīng)蛋白在大鼠慢性牙周炎合并動(dòng)脈粥樣硬化模型中的表達(dá)[J]. 倪佳,張?jiān)疵?徐雋,鐘良軍,史芳川,周曉歡. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2009(02)
[3]C反應(yīng)蛋白基因多態(tài)性及冠心病相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 翁良,趙昕. 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2008(08)
[4]冠心病患者的牙周狀況與hs-CRP和HDL-C的相關(guān)性研究[J]. 周驄,聶敏海,李家富,胡佳. 實(shí)用口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2008(03)
[5]牙周疾病與冠狀動(dòng)脈性心臟病的關(guān)系[J]. 歐陽(yáng)翔英. 北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2008(01)
[6]冠心病和慢性牙周炎相關(guān)性研究[J]. 張?jiān)疵?鐘良軍,何秉賢,聶晶,王璇,李文超. 中華流行病學(xué)雜志. 2006(03)
[7]牙菌斑與全身疾病的關(guān)系[J]. 楊懋彬,周學(xué)東. 國(guó)外醫(yī)學(xué).口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè). 2005(01)
[8]伴放線放線桿菌flp-1基因遺傳多樣性分析[J]. 劉冬宇,王者玲,王明榮,徐昕,蔡巖,楊圣輝. 北京口腔醫(yī)學(xué). 2004(01)
[9]PCR直接檢測(cè)齦下菌斑主要可疑牙周致病菌[J]. 王者玲,崗本公彰,楊圣輝,前田伸子,李金陸,母瑞紅,劉潁. 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2003(02)
[10]牙周病與冠心病的相關(guān)性研究[J]. 張衛(wèi)東. 國(guó)外醫(yī)學(xué).口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè). 2002(04)
本文編號(hào):2972948
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