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兒童乳牙齲病牙菌斑的微生物多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2016-10-17 18:31

  本文關(guān)鍵詞:兒童乳牙齲病牙菌斑的微生物多樣性分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《福建醫(yī)科大學(xué)》 2014年

兒童乳牙齲病牙菌斑的微生物多樣性分析

嚴(yán)恒  

【摘要】:齲病是危害口腔健康最常見的疾病之一。齲病的四聯(lián)因素學(xué)說認(rèn)為細(xì)菌、食物、宿主、時(shí)間均是齲病發(fā)生的必要條件,細(xì)菌則是其中最重要的一個(gè)因素。隨著學(xué)者們對齲病微生物的不斷深入研究,在口腔中檢出的700多中微生物中,有一半以上是目前不可培養(yǎng)的微生物,因此對齲病的研究仍任重而道遠(yuǎn)。近年來,以16S rDNA基因?yàn)榛A(chǔ)的分子生物學(xué)技術(shù),尤其是高通量測序,在微生物群落分析中的廣泛應(yīng)用,使得我們能夠進(jìn)一步地認(rèn)識齲病牙菌斑的微生物多樣性。 目的:本研究以高齲兒童、無齲兒童為研究對象,利用基于16S rDNA V1-V2區(qū)PCR擴(kuò)增的454技術(shù)的GS FLX Titanium測序系統(tǒng),從門、綱、目、科、屬、種(OTU)對6個(gè)兒童的牙菌斑微生物進(jìn)行宏基因組分析,探討乳牙齲病牙菌斑的微生物多樣性,從而為乳牙齲病的病因?qū)W研究和防治提供新的方向。 方法:選取符合WHO取樣標(biāo)準(zhǔn)的3名高齲兒童和3名無齲兒童,每個(gè)高齲兒童取唇頰側(cè)、舌側(cè)和病損區(qū)菌斑3份,每個(gè)無齲兒童取唇頰側(cè)和舌側(cè)2份,提取基因組DNA,行16S rDNA V1-V2區(qū)PCR擴(kuò)增并構(gòu)建文庫,將樣本送公司進(jìn)行測序。所得序列進(jìn)行一系列處理后利用RDP分類器進(jìn)行分類,UCLUST軟件評估微生物多樣性,使用Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析、Metastats分析等進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果:(1)15份樣本共檢出5261個(gè)種水平上的OTUs,歸屬于9個(gè)門,16個(gè)綱,22個(gè)目,,38個(gè)科,59個(gè)屬。(2)高齲組與無齲組比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)的5個(gè)菌屬是鏈球菌屬(Streptococcus)、Filifactor、Solobacterium、棲熱菌屬(Thermus)、Brevibacillus。(3)唇頰側(cè)組、舌側(cè)組以及病損區(qū)組三組之間比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)的5個(gè)菌屬是鏈球菌屬(Streptococcus)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、纖毛菌屬(Leptotrichia)、乳桿菌屬(Lactobacillus)。(4)高齲與無齲的15個(gè)樣本中,有11個(gè)菌屬在所有菌斑樣本中都能檢出并且占到約95%的菌斑序列,有126個(gè)OTUs在15個(gè)樣本中均能檢出。 結(jié)論:(1)454焦磷酸測序用于分析齲病牙菌斑微生物的多樣性獲得了較為豐富的生物信息。(2)牙菌斑微生物的檢出率在高齲和無齲兒童中存在差異,除了變異鏈球菌外,乳牙齲病還可能是其他細(xì)菌作用的結(jié)果。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R788.1
【目錄】:

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本文編號:143255

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