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肺炎鏈球菌自溶素LytA的結(jié)構(gòu)和功能研究

發(fā)布時間:2024-10-05 07:34
  LytA存在于多種鏈球菌中,包括致病菌肺炎鏈球菌、假肺炎鏈球菌和輕型鏈球菌等。由于它在細菌自溶過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用而得名自溶素。LytA是錨定在細菌細胞壁上的肽聚糖水解酶,能夠水解N-乙酰胞壁酸和L-丙氨酸之間的酰胺鍵,但是其激活機制和發(fā)揮生理功能的分子機制仍然不清楚。我們解析了肺炎鏈球菌LytA的全長結(jié)構(gòu),分辨率為2.1A。LytA的全長結(jié)構(gòu)為一個飛鏢形狀的同源二聚體,其相互作用區(qū)域位于C末端。每個亞基都包含有一個N端的酰胺酶結(jié)構(gòu)域和一個C端的膽堿結(jié)合結(jié)構(gòu)域,其中膽堿結(jié)合結(jié)構(gòu)域有6個膽堿結(jié)合重復(fù)區(qū),包括5個典型的和1個單層的膽堿結(jié)合位點。LytA N端的酰胺酶結(jié)構(gòu)域上具有一個Y型的底物結(jié)合溝槽,結(jié)構(gòu)分析結(jié)合生化實驗證明其可能的底物為肺炎鏈球菌細胞壁的三個分支:糖鏈、肽鏈和磷壁酸。另外,點突變結(jié)合酶活實驗表明二聚化和所有膽堿結(jié)合位點被膽堿分子完全占據(jù),才能使LytA具有完全催化活性的構(gòu)象,進而使其2個酰胺酶結(jié)構(gòu)域維持合適的距離來切割肽聚糖上相距103A的2個乳酰-酰胺鍵。另外,我們還對肺炎鏈球菌中的肽聚糖水解酶CbpD進行了結(jié)構(gòu)和功能研究。為了獲得上清表達、穩(wěn)定性好和狀態(tài)均一的目的蛋白,我...

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1肺炎鏈球菌的掃描電鏡圖(Pletz,?6/a/.,2008)??圖注;呈雙球狀排列的肺炎鏈球菌在電鏡下的形態(tài)

圖1.1肺炎鏈球菌的掃描電鏡圖(Pletz,?6/a/.,2008)??圖注;呈雙球狀排列的肺炎鏈球菌在電鏡下的形態(tài)

每年可在全世界造成數(shù)百萬人死t,尤其是在醫(yī)療體系不健全和疫苗缺乏的發(fā)展??中國家,且主要是造成嬰幼兒和老年人的死亡(Tettelin,wa/.,2001)。該茵屬于厚??壁菌口,鏈球菌屬,鏈球菌科,是一種革蘭氏染色顯陽性的細菌(圖1.1)。1881??年,在法國一名肺炎感染者的疲....


圖1.9細菌狀聚糖被宿主的模式識別受體識別巧ukhi也asri,Wa/.,2013)??圖注:細菌和真菌的細胞壁姐分被宿主的模式識別受體識別,從而激活天然免疫應(yīng)答,包括??補體系統(tǒng)和?NF-kB?路徑

圖1.9細菌狀聚糖被宿主的模式識別受體識別巧ukhi也asri,Wa/.,2013)??圖注:細菌和真菌的細胞壁姐分被宿主的模式識別受體識別,從而激活天然免疫應(yīng)答,包括??補體系統(tǒng)和?NF-kB?路徑

宿主具有特異性的模式識別受體可W識別狀聚糖從而起始天然免疫應(yīng)答W消除??入侵的細菌,所W它同時也被認為是致病菌在感染宿主過程中的一個致命弱點??(圖1.9)。這些特異性的模式識別受體包括,植物中的LysM蛋白、哺乳動物中的??細胞內(nèi)NOD-like受體(NLRs卿Toll-lik....


圖1.13肺炎鏈球菌N-乙醜氨基葡糖昔酶LytB的催化結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)??圖注:LytB的催化結(jié)構(gòu)域由3個相對獨立的模塊組化、WW和邸73組成,通過2個loop??

圖1.13肺炎鏈球菌N-乙醜氨基葡糖昔酶LytB的催化結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)??圖注:LytB的催化結(jié)構(gòu)域由3個相對獨立的模塊組化、WW和。罚辰M成,通過2個loop??

?氣?JCto"ne?binding?domain??p10?P9??圖1.12肺炎鏈球菌溶菌酶LytC的整體結(jié)構(gòu)??圖注:LytC的整體結(jié)構(gòu)為特殊的hook型構(gòu)象,由N端的膽堿結(jié)合結(jié)構(gòu)域和C端起催化作??用的GH25結(jié)構(gòu)域組成。膽堿結(jié)合結(jié)構(gòu)域由11個膽堿結(jié)合重復(fù)區(qū)(pl ̄pll....


圖1.14肺炎鏈球菌D,D-竣膚酶DacA的整體結(jié)構(gòu)??圖注:DacA由N端的D,D-幾化酶樣結(jié)構(gòu)域和一個C端的、伸展的p-rich區(qū)域幾乎呈直角??排列姐成

圖1.14肺炎鏈球菌D,D-竣膚酶DacA的整體結(jié)構(gòu)??圖注:DacA由N端的D,D-幾化酶樣結(jié)構(gòu)域和一個C端的、伸展的p-rich區(qū)域幾乎呈直角??排列姐成

圍1.13)。其中,N端的SIDb模塊和WW模塊為全P結(jié)構(gòu);而C端的催化核也??模塊GH73則包含6個a螺旋和一個3i〇螺旋,但a4和a5螺旋之間的??Ala584 ̄Lys巧4殘基由于電子密度缺失而不可見(圖1.13)。LytB屬于糖昔水解??酶GH73家族,其GH73模塊中的5....



本文編號:4007708

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