2014―2019年青島市A型流感病毒進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2024-04-21 09:20
目的了解2014―2019年青島市人群A型流感病毒(influenza A virus,IAV)流行病學(xué)和遺傳特征。方法提取9 807份流感樣病例咽拭子標(biāo)本的病毒RNA,采用多重實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄PCR方法鑒定分型;采用一步法反轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增IAV血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)基因,并進(jìn)行序列測定和基因分析。結(jié)果 2014―2019年青島市流感病毒流行具有北半球典型季節(jié)性流感特征。夏季小量流行主要是H3N2。青島市IAV中H1N1pdm09和H3N2分別占57.6%和42.4%,并呈現(xiàn)交替流行。基因群分屬于6B和3C。兩者HA和NA基因進(jìn)化都處在凈化選擇下,但抗原進(jìn)化可能具有不同的進(jìn)化模式。與2009年毒株相比,2019年青島市H1N1pdm09和H3N2的HA分別已發(fā)生21個(gè)和30個(gè)氨基酸替換,均主要發(fā)生在頭部,分別包含5個(gè)和18個(gè)抗原位點(diǎn)。H1N1pdm09檢測到兩株神經(jīng)氨酸酶抑制劑抗性突變,1株為H275Y突變,另1株為S247N突變;H3N2中未發(fā)現(xiàn)NAI抗性突變。結(jié)論 H1N1pdm09和H3N2是2014―2019年青島市...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 標(biāo)本資料
1.2 核酸提取
1.3 流感病毒鑒定
1.4 基因擴(kuò)增
1.5 序列分析
2 結(jié)果
2.1 流感病毒時(shí)間分布
2.2 基因進(jìn)化
2.3 氨基酸變異分析
3 討論
本文編號:3960704
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1 材料與方法
1.1 標(biāo)本資料
1.2 核酸提取
1.3 流感病毒鑒定
1.4 基因擴(kuò)增
1.5 序列分析
2 結(jié)果
2.1 流感病毒時(shí)間分布
2.2 基因進(jìn)化
2.3 氨基酸變異分析
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