一株新型裂解K63莢膜型肺炎克雷伯菌的噬菌體分離鑒定和生物學(xué)特性研究及全基因組分析
發(fā)布時(shí)間:2023-10-01 22:51
[背景]噬菌體具有特定的殺菌能力,對(duì)生態(tài)和細(xì)菌的進(jìn)化具有重要影響。近年來(lái)由于多重耐藥細(xì)菌的全球出現(xiàn),噬菌體療法逐漸引起了人們的關(guān)注。[目的]對(duì)一株新型裂解K63莢膜型肺炎克雷伯菌的噬菌體vBKpnPIME308進(jìn)行生物學(xué)特性研究、測(cè)序和比較基因組學(xué)的分析。[方法]以一株從臨床分離到的肺炎克雷伯菌為宿主菌分離噬菌體,應(yīng)用雙層平板法進(jìn)行噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)(optimal multiplicity of infection)、一步生長(zhǎng)曲線(one-step growth curve)、溫度以及pH敏感性實(shí)驗(yàn)測(cè)定,純化噬菌體并通過(guò)透射電鏡觀察噬菌體形態(tài);應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)的苯酚-氯仿提取方案提取噬菌體全基因組,使用Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行噬菌體全基因組測(cè)序,測(cè)序后對(duì)噬菌體全基因組序列進(jìn)行組裝、注釋、進(jìn)化和比較基因組學(xué)分析。[結(jié)果]分離到一株新型的肺炎克雷伯菌噬菌體,命名為vBKpnPIME308;其最佳感染復(fù)數(shù)為0.001,一步生長(zhǎng)曲線結(jié)果顯示,其感染宿主菌的潛伏期約為20 min,裂解期約為80 m...
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 菌株來(lái)源與培養(yǎng)條件
1.1.2 培養(yǎng)基及主要試劑和儀器
1.2 噬菌體的分離鑒定
1.3 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)測(cè)定
1.4 噬菌體一步生長(zhǎng)曲線(one-step growth)的測(cè)定
1.5 噬菌體溫度和p H敏感性的測(cè)定
1.6 噬菌體電鏡
1.7 噬菌體基因組提取
1.8 噬菌體的全基因組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 噬菌體的分離與鑒定
2.2 噬菌體的形態(tài)學(xué)特征
2.3 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)
2.4 噬菌體的一步生長(zhǎng)曲線
2.5 噬菌體溫度和p H的敏感性
2.6 噬菌體的全基因組分析
2.7 噬菌體v B_KpnP_IME308比較基因組學(xué)分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
3 討論與結(jié)論
本文編號(hào):3849594
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1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 菌株來(lái)源與培養(yǎng)條件
1.1.2 培養(yǎng)基及主要試劑和儀器
1.2 噬菌體的分離鑒定
1.3 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection,MOI)測(cè)定
1.4 噬菌體一步生長(zhǎng)曲線(one-step growth)的測(cè)定
1.5 噬菌體溫度和p H敏感性的測(cè)定
1.6 噬菌體電鏡
1.7 噬菌體基因組提取
1.8 噬菌體的全基因組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 噬菌體的分離與鑒定
2.2 噬菌體的形態(tài)學(xué)特征
2.3 噬菌體最佳感染復(fù)數(shù)
2.4 噬菌體的一步生長(zhǎng)曲線
2.5 噬菌體溫度和p H的敏感性
2.6 噬菌體的全基因組分析
2.7 噬菌體v B_KpnP_IME308比較基因組學(xué)分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
3 討論與結(jié)論
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