Zkscan3的結(jié)構(gòu)與功能分析
發(fā)布時間:2021-04-09 15:50
鋅指蛋白是一類含有鋅指結(jié)構(gòu)的蛋白,其中鋅指結(jié)構(gòu)通過鋅離子與周圍的氨基酸殘基基團(tuán)非共價交聯(lián),形成穩(wěn)定的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域。鋅指結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)后的十余年間,陸續(xù)有10多類這樣的結(jié)構(gòu)被發(fā)現(xiàn)。其中,包含最初發(fā)現(xiàn)的TFIIIA型鋅指結(jié)構(gòu)域的蛋白總數(shù)達(dá)到人類基因產(chǎn)物的1%左右。通常根據(jù)鋅指蛋白的結(jié)構(gòu)序列特征與功能,可將其分為9大類,分別為Cys2His2,Cys8,Cys6,Cys3His Cys4,Cys2His Cys,Cys2His Cys5,Cys4,Cys3His,Cys4His Cys3。根據(jù)鋅指蛋白中圍繞鋅離子的殘基的空間結(jié)構(gòu),又可將其分為C2H2樣鋅指、高音譜號鋅指、帶狀鋅指、塞結(jié)狀鋅指、類Zn2/Cys6鋅指、類TAZ2鋅指、鋅結(jié)合短環(huán)鋅指與金屬硫蛋白鋅指,其中前3個組群包含了大多數(shù)鋅指。自鋅指結(jié)構(gòu)首次發(fā)現(xiàn)于非洲爪蟾卵母細(xì)胞以來,數(shù)千種鋅指蛋白相繼被鑒定出來。結(jié)構(gòu)的多樣賦予其強(qiáng)大的功能,在轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,蛋白折疊與裝配以及DNA、RNA識別等分子功能基礎(chǔ)上,參與調(diào)節(jié)胚胎發(fā)育、機(jī)體免疫及腫瘤形成、發(fā)展等過程。鋅指蛋白作為分布最為廣泛的轉(zhuǎn)錄因子,在調(diào)節(jié)生物體功能的過程中扮演著重要角色。ZK...
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
中Zif268與DNA的作用方式
一、引言 Zkscan3的結(jié)構(gòu)與功能分析胞分裂的過程中也將永久存在,在胚胎生成早期 TEs 的甲基化被認(rèn)為將永遠(yuǎn)沉默,不再需要相關(guān)的 KRAB-ZFPs 抑制因子的持續(xù)表達(dá)[31]。Zkscan3 作為 KRAB-ZFPs 的其中一個成員,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的促進(jìn)作用,并且發(fā)現(xiàn)其在自噬過程中也發(fā)揮了調(diào)節(jié)作用,但是對于此基因在正常生理條件下所發(fā)揮的作用依然未知,為了加深對 Zkscan3 生理功能的了解,我們此前構(gòu)建了該基因的敲除小鼠模型如圖 1-2 中 A 所示。將 Zkscan3 基因的第二外顯子進(jìn)行敲除,得到基因敲除小鼠,對出生后小鼠的基因型進(jìn)行統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),各基因型小鼠的出生率與孟德爾分離定律相符,說明在小鼠胚胎發(fā)育階段,基因的敲除并未對小鼠發(fā)育產(chǎn)生顯著的影響。對出生后小鼠的體重進(jìn)行監(jiān)測發(fā)現(xiàn),隨著小鼠的生長,其體重在不同基因型之間并無顯著差異,說明基因的敲除對小鼠的正常生長并沒有明顯的抑制作用。
圖 1-3. 野生與 Zkscan3 基因敲除小鼠主要器官 H&E染色結(jié)果圖。對不同基因小鼠的腎、肝、肺與胸腺進(jìn)行石蠟切片并 H&E 染色,分別在 5倍與 20 倍物鏡下觀察組織的結(jié)構(gòu)與病理變化。隨后對野生型小鼠與敲除型小鼠體內(nèi)的 mRNA 進(jìn)行克隆分析,然而經(jīng)測序發(fā)現(xiàn),基因敲除小鼠體內(nèi)仍有截短型 Zkscan3 mRNA 的表達(dá)如圖 1-4 中 A 所示。將此 RNA 序列與 GFP 進(jìn)行融合表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)雖然該轉(zhuǎn)錄本缺失了第二外顯子部分,但是仍然可以正常轉(zhuǎn)錄,并與 GFP 形成融合蛋白表達(dá)于細(xì)胞中,如圖 1-4 中C 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Zinc finger protein 139 expression in gastric cancer and its clinical significance[J]. Yong Li,Qun Zhao,Li-Qiao Fan,Li-Li Wang,Bi-Bo Tan,Yan-Li Leng,Yu Liu,Dong Wang. World Journal of Gastroenterology. 2014(48)
本文編號:3127896
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
中Zif268與DNA的作用方式
一、引言 Zkscan3的結(jié)構(gòu)與功能分析胞分裂的過程中也將永久存在,在胚胎生成早期 TEs 的甲基化被認(rèn)為將永遠(yuǎn)沉默,不再需要相關(guān)的 KRAB-ZFPs 抑制因子的持續(xù)表達(dá)[31]。Zkscan3 作為 KRAB-ZFPs 的其中一個成員,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的促進(jìn)作用,并且發(fā)現(xiàn)其在自噬過程中也發(fā)揮了調(diào)節(jié)作用,但是對于此基因在正常生理條件下所發(fā)揮的作用依然未知,為了加深對 Zkscan3 生理功能的了解,我們此前構(gòu)建了該基因的敲除小鼠模型如圖 1-2 中 A 所示。將 Zkscan3 基因的第二外顯子進(jìn)行敲除,得到基因敲除小鼠,對出生后小鼠的基因型進(jìn)行統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),各基因型小鼠的出生率與孟德爾分離定律相符,說明在小鼠胚胎發(fā)育階段,基因的敲除并未對小鼠發(fā)育產(chǎn)生顯著的影響。對出生后小鼠的體重進(jìn)行監(jiān)測發(fā)現(xiàn),隨著小鼠的生長,其體重在不同基因型之間并無顯著差異,說明基因的敲除對小鼠的正常生長并沒有明顯的抑制作用。
圖 1-3. 野生與 Zkscan3 基因敲除小鼠主要器官 H&E染色結(jié)果圖。對不同基因小鼠的腎、肝、肺與胸腺進(jìn)行石蠟切片并 H&E 染色,分別在 5倍與 20 倍物鏡下觀察組織的結(jié)構(gòu)與病理變化。隨后對野生型小鼠與敲除型小鼠體內(nèi)的 mRNA 進(jìn)行克隆分析,然而經(jīng)測序發(fā)現(xiàn),基因敲除小鼠體內(nèi)仍有截短型 Zkscan3 mRNA 的表達(dá)如圖 1-4 中 A 所示。將此 RNA 序列與 GFP 進(jìn)行融合表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)雖然該轉(zhuǎn)錄本缺失了第二外顯子部分,但是仍然可以正常轉(zhuǎn)錄,并與 GFP 形成融合蛋白表達(dá)于細(xì)胞中,如圖 1-4 中C 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Zinc finger protein 139 expression in gastric cancer and its clinical significance[J]. Yong Li,Qun Zhao,Li-Qiao Fan,Li-Li Wang,Bi-Bo Tan,Yan-Li Leng,Yu Liu,Dong Wang. World Journal of Gastroenterology. 2014(48)
本文編號:3127896
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