本文關(guān)鍵詞：基于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)的基因主效應(yīng)及交互效應(yīng)分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：現(xiàn)代生物技術(shù)面臨著一個巨大的挑戰(zhàn),即如何提出一個行之有效、計算可行的處理高維數(shù)據(jù)的方法,問題大多集中在處理基因之間的交互效應(yīng)上.傳統(tǒng)的方法受到算法的復(fù)雜程度,軟件計算能力等方面的限制不再適用.因此,提出一個切實可行的統(tǒng)計方法勢在必行.本文主要研究老鼠群體對紫外線輻射引起的免疫抑制易感性基因間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).首先,我們利用篩選清理(Screen and Clean)和Dantzig變量選擇的方法篩選數(shù)據(jù)變量,建立合理模型,分析位點(diǎn)間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).比較兩種方法檢測的顯著位點(diǎn)之間的區(qū)別,并評價兩種方法的優(yōu)缺點(diǎn).結(jié)果顯示Dantzig變量選擇的方法較前者準(zhǔn)確度更高.其次,結(jié)合Dantzig變量選擇方法提出兩階段法,在全基因組范圍內(nèi)檢測老鼠群體的與紫外線輻射引起免疫抑制易感性有關(guān)的性狀之間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).最后,分析總結(jié)所應(yīng)用的方法,識別出主效應(yīng)顯著性強(qiáng)烈的位點(diǎn)是D10Mit170,交互效應(yīng)顯著的位點(diǎn)對是D14Mit266和D19Mit34.
【關(guān)鍵詞】：老鼠免疫抑制數(shù)據(jù) 主效應(yīng) 交互效應(yīng) 變量篩選 兩階段法
【學(xué)位授予單位】：黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R392;Q811.4
【目錄】：

• 中文摘要4-5
• Abstract5-8
• 第1章 緒論8-12
• 1.1 主效應(yīng)及交互效應(yīng)概述8-9
• 1.2 應(yīng)用背景介紹9-10
• 1.3 本文研究的主要內(nèi)容10-12
• 第2章 預(yù)備知識12-14
• 2.1 遺傳學(xué)基本概念與術(shù)語12-13
• 2.2 回交設(shè)計13-14
• 第3章 識別主效應(yīng)及交互效應(yīng)已有的方法及其應(yīng)用14-30
• 3.1 數(shù)據(jù)資料14-15
• 3.2 篩選和清理(SC)方法15-23
• 3.2.1 SC方法介紹15-19
• 3.2.2 SC方法應(yīng)用于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)19-23
• 3.2.3 SC方法評價23
• 3.3 Dantzig變量選擇方法23-30
• 3.3.1 Dantzig方法介紹23-26
• 3.3.2 Dantzig方法應(yīng)用于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)26-27
• 3.3.3 Dantzig方法評價27-29
• 3.3.4 SC方法與Dantzig方法比較29-30
• 第4章 基于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)在全基因組范圍內(nèi)的主效應(yīng)及交互效應(yīng)檢測30-34
• 4.1 兩階段檢測方法30-34
• 4.1.1 階段一: Dantzig變量篩選30-31
• 4.1.2 階段二: 交互效應(yīng)檢驗31-32
• 4.1.3 總結(jié)32-34
• 第5章 模擬研究34-38
• 5.1 模擬設(shè)計34-35
• 5.2 結(jié)果分析35-38
• 結(jié)論38-39
• 參考文獻(xiàn)39-45
• 附錄45-54
• 致謝54

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