本文關(guān)鍵詞：基于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)的基因主效應(yīng)及交互效應(yīng)分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：現(xiàn)代生物技術(shù)面臨著一個(gè)巨大的挑戰(zhàn),即如何提出一個(gè)行之有效、計(jì)算可行的處理高維數(shù)據(jù)的方法,問(wèn)題大多集中在處理基因之間的交互效應(yīng)上.傳統(tǒng)的方法受到算法的復(fù)雜程度,軟件計(jì)算能力等方面的限制不再適用.因此,提出一個(gè)切實(shí)可行的統(tǒng)計(jì)方法勢(shì)在必行.本文主要研究老鼠群體對(duì)紫外線輻射引起的免疫抑制易感性基因間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).首先,我們利用篩選清理(Screen and Clean)和Dantzig變量選擇的方法篩選數(shù)據(jù)變量,建立合理模型,分析位點(diǎn)間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).比較兩種方法檢測(cè)的顯著位點(diǎn)之間的區(qū)別,并評(píng)價(jià)兩種方法的優(yōu)缺點(diǎn).結(jié)果顯示Dantzig變量選擇的方法較前者準(zhǔn)確度更高.其次,結(jié)合Dantzig變量選擇方法提出兩階段法,在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)老鼠群體的與紫外線輻射引起免疫抑制易感性有關(guān)的性狀之間的主效應(yīng)及交互效應(yīng).最后,分析總結(jié)所應(yīng)用的方法,識(shí)別出主效應(yīng)顯著性強(qiáng)烈的位點(diǎn)是D10Mit170,交互效應(yīng)顯著的位點(diǎn)對(duì)是D14Mit266和D19Mit34.
【關(guān)鍵詞】：老鼠免疫抑制數(shù)據(jù) 主效應(yīng) 交互效應(yīng) 變量篩選 兩階段法
【學(xué)位授予單位】：黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R392;Q811.4
【目錄】：

• 中文摘要4-5
• Abstract5-8
• 第1章 緒論8-12
• 1.1 主效應(yīng)及交互效應(yīng)概述8-9
• 1.2 應(yīng)用背景介紹9-10
• 1.3 本文研究的主要內(nèi)容10-12
• 第2章 預(yù)備知識(shí)12-14
• 2.1 遺傳學(xué)基本概念與術(shù)語(yǔ)12-13
• 2.2 回交設(shè)計(jì)13-14
• 第3章 識(shí)別主效應(yīng)及交互效應(yīng)已有的方法及其應(yīng)用14-30
• 3.1 數(shù)據(jù)資料14-15
• 3.2 篩選和清理(SC)方法15-23
• 3.2.1 SC方法介紹15-19
• 3.2.2 SC方法應(yīng)用于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)19-23
• 3.2.3 SC方法評(píng)價(jià)23
• 3.3 Dantzig變量選擇方法23-30
• 3.3.1 Dantzig方法介紹23-26
• 3.3.2 Dantzig方法應(yīng)用于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)26-27
• 3.3.3 Dantzig方法評(píng)價(jià)27-29
• 3.3.4 SC方法與Dantzig方法比較29-30
• 第4章 基于老鼠免疫抑制數(shù)據(jù)在全基因組范圍內(nèi)的主效應(yīng)及交互效應(yīng)檢測(cè)30-34
• 4.1 兩階段檢測(cè)方法30-34
• 4.1.1 階段一: Dantzig變量篩選30-31
• 4.1.2 階段二: 交互效應(yīng)檢驗(yàn)31-32
• 4.1.3 總結(jié)32-34
• 第5章 模擬研究34-38
• 5.1 模擬設(shè)計(jì)34-35
• 5.2 結(jié)果分析35-38
• 結(jié)論38-39
• 參考文獻(xiàn)39-45
• 附錄45-54
• 致謝54

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本文編號(hào)：291647