列當(dāng)科（Orobanchaceae）肉蓯蓉屬（Cistoanche）植物是我國植物資源中的重要類群,目前我國肉蓯蓉相關(guān)產(chǎn)品的年銷售額已突破億元,肉蓯蓉產(chǎn)業(yè)已形成一定規(guī)模,并成為西部經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要組成部分。葉綠體作為植物進(jìn)行光合作用和能量轉(zhuǎn)化的細(xì)胞器,在維持地球生物的生存上有著重要作用。肉蓯蓉屬植物分類混亂,我國分類學(xué)家對(duì)于肉蓯蓉屬的分類意見各不相同。為了更好的對(duì)肉蓯蓉屬植物分類鑒別提供組學(xué)參考數(shù)據(jù),本文對(duì)生長于我國西北部地區(qū)的肉蓯蓉屬四個(gè)寄生性物種,肉蓯蓉（Cistanche deserticola）、管花肉蓯蓉（Cistanche tubulosa）、鹽生肉蓯蓉（Cistanche salsa）和沙蓯蓉（Cistanche sinensis）進(jìn)行了葉綠體全基因組測序、組裝和分析。結(jié)合從GenBank下載的同屬植物Cistanche phelypaea（NC₀25642.1）進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育、分化時(shí)間和分子標(biāo)記分析。結(jié)果:①肉蓯蓉屬四個(gè)植物的葉綠體基因組為典型的環(huán)形四分狀結(jié)構(gòu)。②葉綠體基因組大小依次為肉蓯蓉109 495 bp,管花肉蓯蓉75 375 bp,鹽生肉蓯... 

【文章來源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２引物設(shè)計(jì)位點(diǎn)詳情圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ｐｒｉｍｅｒ?ｄｅｓｉｇｎ?ｓｉｔｅ?ｄｅｔａｉｌ?ｍａｐ??表３引物設(shè)計(jì)（其中ＩＤ１－４為肉蓯蓉邊界驗(yàn)證設(shè)計(jì)的引物：６－９為管花肉蓯蓉；??－

本研宄利用基因轉(zhuǎn)錄時(shí)非編碼區(qū)不轉(zhuǎn)錄的原理，對(duì)肉蓯蓉葉綠體基因組中的基??因進(jìn)行了基因邊界區(qū)的ｊｕｎｃｔｉｏｎ?ｒｅａｄｓ驗(yàn)證，主要針對(duì)含有內(nèi)含子（ｉｎｔｒｏｎ）的基因??邊界驗(yàn)證（ｅｘｏｎ、ｉｎｔｒｏｎ驗(yàn)證）。原理如圖３。由于測序的四個(gè)物種均為肉灰蓉屬植??物，故本文僅對(duì)用于葉綠體基因組分析的肉蓯蓉同株植物進(jìn)行了二代轉(zhuǎn)錄組測序，??并用于基因邊界校正，其余三個(gè)物種以校正好的基因作為參考進(jìn)行校正。??圖３所示表明，當(dāng)一個(gè)含有內(nèi)含子的基因在轉(zhuǎn)錄時(shí)，內(nèi)含子（ｉｎｔｒｏｎ）部分不??會(huì)隨著外顯子（Ｅｘｏｎ）部分一起轉(zhuǎn)錄，所以可以利用ＤＮＡ序列與ｍＲＮＡ序列進(jìn)行??對(duì)比，根據(jù)對(duì)比結(jié)果精確地校正基因的邊界，校正效果良好，尤其是對(duì)含有內(nèi)含子??的基因來說。??ＤＮＡ?Ｓｅｑｕｅｎｃｅ?Ｅｘｏｎ?１?ｌｎｔｒｏｎ?Ｅｘｏｎ２?＊＊??ｍＲＮＡ?Ｓｅｑｕｅｎｃｅ?—?jiǎng)?wù)?Ｅｘｏｎ］?Ｅｘｏｎ２??圖３?ＤＮＡ、ＲＮＡ轉(zhuǎn)錄示意圖，ｍＲＮＡ－ｓｅｑ用于驗(yàn)證基因邊界的原理。??Ｆｉｇｕｒｅ?３?ＤＮＡ，?ｍＲＮＡ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ｍａｐ，?ｔｈｅ?ｐｒｉｎｃｉｐｌｅ?ｏｆ?ｕｓｉｎｇ?ｍＲＮＡ－ｓｅｑ?ｔｏ?ｖｅｒｉｆｙ??ｔｈｅ?ｇｅｎｅ?ｂｏｕｎｄａｒｉｅｓ．??２結(jié)果與討論??２．１葉綠體基因組組裝??通過對(duì)肉蓯蓉屬四個(gè)植物進(jìn)行拼接組裝后

對(duì)肉蓯蓉屬四個(gè)寄生植物葉綠體基因組進(jìn)行拼接組裝后，我們利用ＰＣＲ、ｓａｎｇｅｒ??測序?qū)ζ唇诱_性進(jìn)行了驗(yàn)證。測序結(jié)果顯示，拼接無誤�，F(xiàn)將ＰＣＲ產(chǎn)物膠圖列出，??見圖５。其中使用Ｍａｒｋｅｒ大小為２?０００?ｂｐ，ｌ－４號(hào)代表肉蓯蓉的四個(gè)邊界，６－９號(hào)代??表管花肉蓯蓉，１１－１４號(hào)代表沙蓯蓉，１６－１９號(hào)代表鹽生肉蓯蓉，該順序與引物設(shè)計(jì)??時(shí)使用順序一致，可參考圖２。??Ｃ．?ｄｅｓｅｒｔｉｃｏｌａ?Ｃ．?ｔｕｂｕｌｏｓａ?Ｃ．?ｓｉｎｅｎｓｉｓ?Ｃ．?ｓａｌｓａ??Ｍ?１?１?２?３?４?｜?６?７?８?９?１１?１２?１３?１４?｜ｌ５?１６?１７?１８?Ｎ??Ｅ部交??圖５?ＰＣＲ產(chǎn)物膠圖。其中使用Ｍａｒｋｅｒ大小為２?０００?ｂｐ，ｌ－４泳道代表肉蓯蓉的四??個(gè)邊界，６－９泳道代表管花肉灰蓉，１１－１４泳道代表沙蓯蓉，１６－１９泳道代表鹽生肉??蓯蓉。Ｎ代表陰性對(duì)照結(jié)果??Ｆｉｇｕｒｅ?５?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｇｅｌ?ｍａｐ．?Ｍａｒｋｅｒ?ｓｉｚｅ?ｏｆ?２?０００?ｂｐ，?ｌａｎｅ?１－４：?Ｃ．?ｄｅｓｅｒｔｉｃｏｌａ＾??ｌａｎｅ?６－９：?Ｃ．?ｔｕｂｕｌｏｓａ；?ｌａｎｅ?１１－１４：?Ｃ．?ｓｉｎｅｎｓｉｓ；?ｌａｎｅ?１６－１９：?Ｃ．?ｓａｌｓａ．?Ｎ：?ｎｅｇａｔｉｖｅ?ｒｅｓｕｌｔ??２６??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]中國肉蓯蓉屬的分類學(xué)研究及其寄主植物的確定[D]. 溫都蘇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3501868