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棉鼠肺表面活性相關(guān)蛋白A基因生物信息學(xué)分析及其與肺損傷相關(guān)性

發(fā)布時(shí)間:2017-09-04 14:10

  本文關(guān)鍵詞:棉鼠肺表面活性相關(guān)蛋白A基因生物信息學(xué)分析及其與肺損傷相關(guān)性


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【摘要】:目的分析棉鼠肺表面活性相關(guān)蛋白A(SP-A)的基因序列結(jié)構(gòu)和生物信息學(xué)特點(diǎn),觀察棉鼠肺損傷模型中SP-A mRNA和蛋白的表達(dá)水平,初探SP-A表達(dá)規(guī)律與肺損傷的相關(guān)性。方法將32只棉鼠隨機(jī)均分為4組:3個(gè)實(shí)驗(yàn)組棉鼠分別腹腔注射2mg/kg脂多糖(LPS)處理24、48和96h,對(duì)照組腹腔注射等量生理鹽水。建模后提取棉鼠肺組織總RNA,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增SP-A基因,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析;組織切片觀察LPS作用不同時(shí)期肺組織病理學(xué)變化;qRT-PCR分析SP-A mRNA的表達(dá)水平;蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)SP-A蛋白表達(dá)。結(jié)果棉鼠SP-A基因編碼區(qū)長(zhǎng)744bp,編碼248個(gè)氨基酸,具有多個(gè)半胱氨酸保守位點(diǎn)、α螺旋結(jié)構(gòu)和糖基化位點(diǎn),與其他物種相比其核苷酸(75.4%~90.1%)和氨基酸(70.6%~87.1%)序列均具有較高的同源性。在LPS誘導(dǎo)肺損傷模型中發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組棉鼠肺組織病理學(xué)改變隨LPS刺激時(shí)間延長(zhǎng)而加重,具有時(shí)間依賴性;SP-A mRNA和蛋白的表達(dá)水平在LPS處理24h后開(kāi)始迅速增加,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001和P0.01),48h時(shí)仍持續(xù)上升(P0.001和P0.01),96h時(shí)略有下降,但仍保持在較高水平,與對(duì)照組相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05和P0.01)。結(jié)論棉鼠SP-A基因具有高度保守性;棉鼠SP-A mRNA和蛋白的表達(dá)水平與肺損傷嚴(yán)重程度密切相關(guān),可反應(yīng)肺損傷的不同時(shí)程。
【作者單位】: 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院兒科研究所兒童發(fā)育疾病研究教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室兒童發(fā)育重大疾病診治與預(yù)防國(guó)際科技合作基地兒科學(xué)重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】棉鼠亞科 肺表面活性物質(zhì)相關(guān)蛋白質(zhì)A 肺損傷 計(jì)算生物學(xué)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(81302523) 重慶市科委基礎(chǔ)與前沿研究計(jì)劃項(xiàng)目(cstc2016jcyjA0387,cstc2016jcyjA0007)~~
【分類號(hào)】:R563
【正文快照】: increased in three LPS groups,with rapid increase starting from 24hafter treatment(P0.001,P0.01),with continuousincrease at 48h(P0.001and P0.01),and slight decrease and still keeping at a high level at 96h(P0.05,P0.01).Conclusion SP-A gene of cotto

本文編號(hào):791973

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