本文關鍵詞：棉鼠肺表面活性相關蛋白A基因生物信息學分析及其與肺損傷相關性

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【摘要】：目的分析棉鼠肺表面活性相關蛋白A(SP-A)的基因序列結構和生物信息學特點,觀察棉鼠肺損傷模型中SP-A mRNA和蛋白的表達水平,初探SP-A表達規(guī)律與肺損傷的相關性。方法將32只棉鼠隨機均分為4組:3個實驗組棉鼠分別腹腔注射2mg/kg脂多糖(LPS)處理24、48和96h,對照組腹腔注射等量生理鹽水。建模后提取棉鼠肺組織總RNA,經(jīng)RT-PCR擴增SP-A基因,并對其進行生物信息學分析;組織切片觀察LPS作用不同時期肺組織病理學變化;qRT-PCR分析SP-A mRNA的表達水平;蛋白質印跡法檢測SP-A蛋白表達。結果棉鼠SP-A基因編碼區(qū)長744bp,編碼248個氨基酸,具有多個半胱氨酸保守位點、α螺旋結構和糖基化位點,與其他物種相比其核苷酸(75.4%~90.1%)和氨基酸(70.6%~87.1%)序列均具有較高的同源性。在LPS誘導肺損傷模型中發(fā)現(xiàn),與對照組相比,實驗組棉鼠肺組織病理學改變隨LPS刺激時間延長而加重,具有時間依賴性;SP-A mRNA和蛋白的表達水平在LPS處理24h后開始迅速增加,差異有統(tǒng)計學意義(P0.001和P0.01),48h時仍持續(xù)上升(P0.001和P0.01),96h時略有下降,但仍保持在較高水平,與對照組相比差異有統(tǒng)計學意義(P0.05和P0.01)。結論棉鼠SP-A基因具有高度保守性;棉鼠SP-A mRNA和蛋白的表達水平與肺損傷嚴重程度密切相關,可反應肺損傷的不同時程。
【作者單位】： 重慶醫(yī)科大學附屬兒童醫(yī)院兒科研究所兒童發(fā)育疾病研究教育部重點實驗室兒童發(fā)育重大疾病診治與預防國際科技合作基地兒科學重慶市重點實驗室;
【關鍵詞】： 棉鼠亞科 肺表面活性物質相關蛋白質A 肺損傷 計算生物學
【基金】：國家自然科學基金(81302523) 重慶市科委基礎與前沿研究計劃項目(cstc2016jcyjA0387,cstc2016jcyjA0007)~~
【分類號】：R563
【正文快照】： increased in three LPS groups,with rapid increase starting from 24hafter treatment(P0.001,P0.01),with continuousincrease at 48h(P0.001and P0.01),and slight decrease and still keeping at a high level at 96h(P0.05,P0.01).Conclusion SP-A gene of cotto，

本文編號：791973