環(huán)介導等溫擴增技術(shù)在重癥社區(qū)獲得性肺炎病原學診斷中的臨床意義研究
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更多相關(guān)文章: 環(huán)介導等溫擴增 痰培養(yǎng) 重癥社區(qū)獲得性肺炎
【摘要】:背景:由于缺乏有效的診斷方法,重癥社區(qū)獲得性肺炎(Severe Community-acquired Pneumonia,sCAP)的病原學診斷率低,致患者不能在早期獲得針對性治療。環(huán)介導等溫擴增(Loop-mediated Isothermal Amplification, LAMP)作為一種新的核酸擴增技術(shù),具有操作簡便、對實驗條件要求低以及反應時間短等特點,適用于常見病原體的早期檢測。目的:驗證LAMP檢測法診斷sCAP常見病原體的有效性和可行性。方法:研究對象為臨床診斷sCAP患者,在入院當天收集痰或肺泡灌洗液檢測,采用培養(yǎng)法和LAMP法檢測12種常見病原體。以培養(yǎng)法作為標準檢測法,研究LAMP法診斷sCAP病原學的靈敏度、特異度和準確度。結(jié)果:共納入79例重癥社區(qū)獲得性肺炎患者中,其中28例(35.4%)經(jīng)痰培養(yǎng)確定為陽性。以培養(yǎng)法作為標準法,LAMP法檢測病原體DNA濃度對數(shù)所對應的ROC曲線中,當截斷值取2.95時,曲線下面積(Area Under the Curve, AUC)最大為0.871(95%CI0.777-0.936,P0.05),靈敏度、特異度及其95%CI分別為96.4%(81.7-99.9)和68.6%(54.1-80.9)。LAMP法檢測一致性為79.1%,靈敏度為96.4%,特異度為68.6%,陽性預測值為80.0%,陰性預測值為98.0%。28例標準法陽性組中,平均DNA濃度為(lg10 copies/ml)為(4.3±0.9);51例標準法陰性組中,平均DNA濃度(lg10 copies/ml)為(2.5±1.6),兩組患者DNA濃度差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)。LAMP法檢出率最高的5種病原體依次為銅綠假單胞菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鮑曼不動桿菌和嗜麥芽窄食單胞菌。LAMP法各病原體DNA濃度之和與PCT、白細胞行兩兩之間的Spearman相關(guān)分析,相關(guān)系數(shù)分別為0.73(95%CI0.60-0.82,P0.05)、0.42(95%CI0.21-0.59,P0.05)。結(jié)論:1.LAMP法能夠作為一項檢測sCAP患者常見病原體的手段。2.標準法陽性標本病原體DNA濃度明顯高于標準法陰性標本。3.病原體DNA濃度之和與PCT、白細胞存在正相關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:環(huán)介導等溫擴增 痰培養(yǎng) 重癥社區(qū)獲得性肺炎
【學位授予單位】:南昌大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R563.1;R440
【目錄】:
- 摘要3-5
- ABSTRACT5-10
- 第1章 前言10-12
- 第2章 材料與方法12-17
- 2.1 研究對象12-13
- 2.1.1 病例來源12
- 2.1.2 入選標準12-13
- 2.1.3 排除標準13
- 2.2 實驗材料及儀器設備13-14
- 2.3 實驗方法14-16
- 2.3.1 支氣管肺泡灌洗液采集方法14
- 2.3.2 痰標本采集方法14
- 2.3.3 標本的保存14
- 2.3.4 常規(guī)培養(yǎng)檢測法14-15
- 2.3.5 LAMP法檢測15-16
- 2.4 統(tǒng)計方法16-17
- 第3章 結(jié)果17-23
- 3.1 一般資料17
- 3.2 LAMP擴增結(jié)果17-20
- 3.2.1 LAMP擴增曲線17-18
- 3.2.2 LAMP結(jié)果分析南昌大學第一附屬醫(yī)院重癥監(jiān)護病房sCAP病原體流行病學18-19
- 3.2.3 培養(yǎng)法陰性與陽性標本DNA濃度19-20
- 3.3 不同診斷方法的有效性20
- 3.4 LAMP檢測sCAP病原體的ROC曲線20-21
- 3.5 LAMP結(jié)果與PCT、白細胞的相關(guān)分析21-23
- 第4章 討論23-26
- 第5章 結(jié)論與展望26-27
- 5.1 結(jié)論26
- 5.2 展望26-27
- 致謝27-28
- 參考文獻28-31
- 綜述 環(huán)介導等溫擴增技術(shù)在肺部感染病原體檢測中的作用31-37
- 參考文獻36-37
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