矽肺是吸入二氧化硅粉塵顆粒所致的以肺間質(zhì)纖維化為主的全身性疾病。早期健康監(jiān)護(hù)是矽肺防治的關(guān)鍵環(huán)節(jié),但至目前尚無(wú)有效的早期健康監(jiān)護(hù)指標(biāo)。探討矽肺的發(fā)病機(jī)制和探索發(fā)現(xiàn)血清早期診斷(篩檢)的生物標(biāo)志物,對(duì)預(yù)防、治療乃至最終消除矽肺具有重要的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)意義。近年蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)特別是質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為矽肺診斷開(kāi)拓了新領(lǐng)域,一種新的應(yīng)用功能磁珠、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和ClinProTools軟件包組成的ClinProt系統(tǒng)以其高敏感性和可重復(fù)性被用于血清蛋白質(zhì)表達(dá)譜的研究[1]。利用磁珠分離、去除樣品中的高豐度蛋白和其他雜質(zhì),同時(shí)富集低豐度目的蛋白。經(jīng)飛行時(shí)間質(zhì)譜測(cè)定得到在矽塵暴露人群和正常對(duì)照組之間表達(dá)差異的蛋白質(zhì),為尋找矽肺生物標(biāo)記物提供重要的的線索。如何從高通量的血清蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)中篩選出可能的疾病早期標(biāo)志物,是應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行疾病分析的的前提。本研究采用液體蛋白芯片飛行時(shí)間質(zhì)譜作為檢測(cè)手段,將Relief算法、遺傳算法結(jié)合支持向量機(jī)(SVM)應(yīng)用于MALDI-TOF-MS質(zhì)譜數(shù)據(jù),構(gòu)建矽塵暴露人群診斷模型,篩選早期矽肺血清蛋白生物標(biāo)志物,其拓展的分析技術(shù)...

【文章頁(yè)數(shù)】：69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比軟件自動(dòng)提取可用峰Fig.1TheselectedpeaksbyClinprotools

mixture(4pmol/ul)按1:5混勻后點(diǎn)1ul，待干燥后點(diǎn)1ul基質(zhì)。（3）參數(shù)設(shè)置：采用線性陽(yáng)離子模式，第一離子源25KV，第二離子源23.45KV，檢測(cè)范圍800-10000Da。每個(gè)樣品點(diǎn)四個(gè)靶點(diǎn)，每個(gè)點(diǎn)100shots，選8個(gè)不同位置累計(jì)80....

圖2無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比Gelview圖譜

統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異蛋白，本研究中采用了Clinprotools軟件內(nèi)置的QC(QuickClassifier)算法和SNN(SupervisedNeuralNetwork)算法。4結(jié)果1)無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組比較分析圖....

圖3無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比模型結(jié)果示意圖

圖3無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比模型結(jié)果示意圖Fig.3TheperformanceofmodelbuildingbyClinprotools由圖3所示在無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比，Clinprotools軟件利用神經(jīng)SNN和快速分類算法QC....

圖4無(wú)塵肺0+期與正常對(duì)照組對(duì)比軟件自動(dòng)提取可用峰Fig.4TheselectedpeaksbyClinprotools

圖3無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比模型結(jié)果示意圖Fig.3TheperformanceofmodelbuildingbyClinprotools由圖3所示在無(wú)塵肺0期與正常對(duì)照組對(duì)比，Clinprotools軟件利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法SNN和快速分類算法....

本文編號(hào)：3991292