本文關(guān)鍵詞：肺結(jié)核分子流行病學(xué)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的：本研究旨在尋找肺結(jié)核的遺傳易感位點(diǎn)，探索宿主遺傳因素差異對(duì)肺結(jié)核發(fā)病的影響，為肺結(jié)核的預(yù)防和藥物研發(fā)提供理論依據(jù)。 方法：1、對(duì)1218名漢族居民進(jìn)行病例對(duì)照研究，其中病例組600例，對(duì)照組618例。進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查和生化指標(biāo)檢查。用血液基因組DNA提取試劑盒提取DNA。運(yùn)用限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈反應(yīng)（restriction fragment length polymorphism polymerasechain reaction，PCR-RFLP）技術(shù)檢測(cè)CISH基因rs2239751和rs622502的基因多態(tài)性，探索CISH基因與中國漢族人群肺結(jié)核的關(guān)聯(lián)性。 2、驗(yàn)證肺結(jié)核GWAS中rs2057178和rs4331426在中國漢族人群中是否與肺結(jié)核相關(guān)。運(yùn)用Pub med、Embase、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)、中國知網(wǎng)和萬方數(shù)據(jù)庫，系統(tǒng)檢索2000年到2014年3月1日之間發(fā)表的研究rs2057178多態(tài)性或rs4331426多態(tài)性與肺結(jié)核關(guān)系的中英文文獻(xiàn)，采用Stata version11.0軟件進(jìn)行Meta分析。 結(jié)果：1、病例組平均年齡41.03±16.26歲；對(duì)照組平均年齡43.26±17.26歲。差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。病例組痰樣本涂片陽性率為29.7%。胸片X線異常率為99.0%�？ń槊缃臃N率31.2%。 2、CISH基因的rs2239751和rs622502等位基因分布均符合Hardy-Weinberg（H-W）遺傳平衡定律，表明抽樣方法可靠，研究樣本的群體代表性較好。 3、rs4331426和rs2057178等位基因分布均符合Hardy-Weinberg（H-W）遺傳平衡定律，表明抽樣方法可靠，研究樣本的群體代表性較好。 4、CISH基因rs2239751位點(diǎn)多態(tài)性與肺結(jié)核相關(guān)性研究中，rs2239751位點(diǎn)基因型和等位基因分布在兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P值分別為0.02和0.01，并且攜帶C等位基因個(gè)體患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶A等位基因的個(gè)體1.16倍（OR95%CI=1.03-1.29，P=0.01）。 5、CISH基因rs622502位點(diǎn)多態(tài)性與肺結(jié)核相關(guān)性研究中，rs622502位點(diǎn)基因型和等位基因分布在兩組間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。 6、驗(yàn)證肺結(jié)核GWAS中rs4331426位點(diǎn)在漢族人群中是否與肺結(jié)核相關(guān)研究中，rs4331426基因型頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。對(duì)基因分型結(jié)果按性別，年齡和涂片情況進(jìn)行分層，仍然顯示rs4331426基因型頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。 7、驗(yàn)證肺結(jié)核GWAS中rs2057178位點(diǎn)在漢族人群中是否與肺結(jié)核相關(guān)研究中，rs2057178基因型頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。對(duì)基因分型結(jié)果按性別，年齡和涂片情況進(jìn)行分層，仍然顯示rs2057178基因型頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.05。 8、rs4331426的Meta分析包括研究對(duì)象16325人，其中病例組6176人，對(duì)照組10149人。病例組和對(duì)照組中G等位基因的頻率分別為36.8%和34.0%。非洲組的異質(zhì)性檢驗(yàn)無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，因此選用Peto Mantel-Haenszel method固定效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)合并計(jì)算OR；亞洲組和總體的異質(zhì)性差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P0.1，因此選用Dersimonian Lairdmethod隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)合并計(jì)算OR值。Meta分析結(jié)果顯示rs4331426在非洲人群中研究的合并OR值為1.18，95%CI為1.11-1.25；亞洲人群研究的合并OR值為0.85，95%CI為0.59-1.23；總體合并OR值為1.12，95%CI為1.02-1.23。顯著性檢驗(yàn)Z值為4.84，P㩳0.0001，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。漏斗圖和Egger’s-test結(jié)果顯示此次Meta分析存在發(fā)表偏倚的可能性較小。 9、rs2057178的Meta分析包括研究對(duì)象23897人，，其中病例組9421人，對(duì)照組14476人。病例組和對(duì)照組中T等位基因的頻率分別為15.6%和18.2%。各研究間的異質(zhì)性檢驗(yàn)無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，因此選用Peto Mantel-Haenszel method固定效應(yīng)模型計(jì)算合并OR值。Meta分析結(jié)果顯示rs2057178合并OR值為1.21，95%CI為1.15-1.28。顯著性檢驗(yàn)Z值為6.90，P㩳0.0001，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。漏斗圖和Egger’s-test結(jié)果顯示此次Meta分析存在發(fā)表偏倚的可能性較小。 結(jié)論：1、在漢族人群中rs2239751位點(diǎn)多態(tài)性可能是肺結(jié)核的危險(xiǎn)因素之一。rs622502位點(diǎn)多態(tài)性可能與肺結(jié)核無關(guān)。 2、在漢族人群中，經(jīng)驗(yàn)證rs2057178和rs4331426位點(diǎn)多態(tài)性可能與肺結(jié)核無關(guān)。即使排除性別，年齡和涂片情況等混雜因素，rs2057178和rs4331426位點(diǎn)多態(tài)性可能與肺結(jié)核無關(guān)。 3、rs4331426在非洲人群中可能是肺結(jié)核的易感位點(diǎn)，攜帶G等位基因比攜帶A等位基因患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)高；在亞洲人群中rs4331426可能并非肺結(jié)核的易感位點(diǎn)。 4、rs2057178在非洲人群中可能是肺結(jié)核的一個(gè)易感位點(diǎn)。攜帶T等位基因比攜帶C等位基因患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)高。
【關(guān)鍵詞】：肺結(jié)核 CISH 基因 多態(tài)性 全基因組關(guān)聯(lián)研究
【學(xué)位授予單位】：寧波大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R521
【目錄】：

• 摘要4-7
• Abstract7-10
• 縮略語表10-13
• 引言13-15
• 第一部分 CISH 基因多態(tài)性與肺結(jié)核的關(guān)聯(lián)研究15-27
• 引言15-16
• 1 研究目的16
• 2 材料與研究方法16-22
• 2.1 材料16-17
• 2.1.1 儀器16
• 2.1.2 試劑16-17
• 2.1.3 耗材17
• 2.2 研究方法17-22
• 2.2.1 確定研究對(duì)象17
• 2.2.2 流行病學(xué)調(diào)查及生化指標(biāo)檢查17-18
• 2.2.3 血樣采集18
• 2.2.4 血液 DNA 提取18
• 2.2.5 DNA 濃度測(cè)定及標(biāo)化18-19
• 2.2.6 PCR-PFLP 檢測(cè)基因多態(tài)性19-22
• 2.2.7 統(tǒng)計(jì)分析22
• 3 結(jié)果22-25
• 3.1 一般資料和生化指標(biāo)比較22
• 3.2 RS2239751 和 RS622502 酶切結(jié)果分析判定22-23
• 3.3 兩組 H-W 檢驗(yàn)及基因型頻率比較23-24
• 3.4 兩組基因頻率比較及風(fēng)險(xiǎn)性分析24-25
• 3.5 不同人群中 RS2239751 和 RS622502 與肺結(jié)核的相關(guān)性25
• 4 討論25-27
• 第二部分 肺結(jié)核 GWAS 的驗(yàn)證及相關(guān)基因多態(tài)性與肺結(jié)核發(fā)病率關(guān)聯(lián)的 Meta 分析27-49
• 引言27
• 1 研究目的27-28
• 2 研究步驟28-47
• 2.1 在中國漢族人群中驗(yàn)證肺結(jié)核 GWAS28-35
• 2.1.1 材料與方法28-32
• 2.1.2 統(tǒng)計(jì)分析32
• 2.1.3 結(jié)果32-35
• 2.2 META 分析35-47
• 2.2.1 研究方法36-37
• 2.2.2 結(jié)果37-47
• 3 討論47-49
• 參考文獻(xiàn)49-54
• 附錄 A 綜述54-66
• 參考文獻(xiàn)60-66
• 在學(xué)研究成果66-67
• 致謝67

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 何玉龍;張文清;吳月紅;;一氧化氮在結(jié)核分支桿菌感染巨噬細(xì)胞中的作用研究進(jìn)展[J];動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2014年07期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 巴恒星;中國梅花鹿全基因組初步組裝、分析及單核苷酸多態(tài)性研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2012年

2 韓宏志;HDACs基因家族基因多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)性分析[D];吉林大學(xué);2012年

3 胡耀東;雞H/L和SRBC遺傳選擇及部分抗病性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

4 陳英敏;初中生羞怯的結(jié)構(gòu)、特點(diǎn)及遺傳與環(huán)境的影響作用[D];山東師范大學(xué);2013年

5 尚軍亮;全基因組單核苷酸多態(tài)性交互作用研究[D];西安電子科技大學(xué);2013年

6 謝巖;奶牛產(chǎn)奶性狀候選基因EEF1D和PDE9A功能驗(yàn)證[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

7 范松華;SLC7A7基因與膠質(zhì)瘤易感性及膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者預(yù)后關(guān)系的研究[D];蘇州大學(xué);2013年

8 楊健康;中國漢族人群重型痤瘡的全基因組關(guān)聯(lián)研究[D];云南大學(xué);2014年

9 何萍;染色體15q25.1區(qū)域基因多態(tài)性與中國南方人群肺腺癌易感性的關(guān)聯(lián)研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2014年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 尚賢金;染色體12p13兩基因間多態(tài)與腦梗死的關(guān)聯(lián)研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2011年

2 逯越;反流性食管炎的流行特征及遺傳易感性分析[D];鄭州大學(xué);2011年

3 李興川;61781例家族性和散發(fā)食管癌臨床病理和生存期及與PLCE1和RFT2基因多態(tài)相關(guān)性[D];鄭州大學(xué);2011年

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本文編號(hào)：315891