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基于生物信息學(xué)分析哮喘患者鼻黏膜上皮細(xì)胞DNA及α肌動(dòng)蛋白2甲基化差異性表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2021-04-11 22:10
  目的:研究哮喘患者鼻黏膜上皮細(xì)胞中全基因組甲基化水平及α肌動(dòng)蛋白2(actin alpha 2,ACTA2)基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平改變。方法:利用甲基化850K芯片法檢測6例哮喘患者與5例健康者鼻黏膜上皮細(xì)胞中全基因組甲基化水平,進(jìn)行生物功能分析后選擇ACTA2為目的基因,以重亞硫酸鹽測序法檢測12例哮喘患者及12例健康者ACTA2啟動(dòng)子區(qū)域甲基化水平。結(jié)果:850K芯片測序結(jié)果顯示,哮喘患者所有常染色體均存在不同程度的甲基化修飾,大部分發(fā)生在基因體及基因間區(qū),10%~20%發(fā)生在啟動(dòng)子區(qū),且高甲基化和低甲基化改變可存在于同一染色體上;重亞硫酸鹽法測序示與健康對(duì)照組相比,哮喘組ACTA2基因啟動(dòng)子區(qū)出現(xiàn)明顯高甲基化改變(P=0.001)。結(jié)論:哮喘患者鼻黏膜上皮細(xì)胞各染色體均出現(xiàn)廣泛甲基化修飾,ACTA2基因啟動(dòng)子區(qū)域出現(xiàn)高甲基化改變。 

【文章來源】:江蘇大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,30(04)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于生物信息學(xué)分析哮喘患者鼻黏膜上皮細(xì)胞DNA及α肌動(dòng)蛋白2甲基化差異性表達(dá)


差異性甲基化位點(diǎn)總體比例

甲基化,功能區(qū)域,位點(diǎn),差異性


本研究中檢測所得的差異性甲基化區(qū)域絕大多數(shù)集中在基因體及基因間區(qū),位于啟動(dòng)子區(qū)域的差異性甲基化位點(diǎn)占10%~20%,分布比例如圖2所示。2.1.4 GO分析

功能圖,富集,差異性,位點(diǎn)


本研究中所涉及的GO功能分析包括三個(gè)方面:生物學(xué)過程、細(xì)胞組分、分子功能。哮喘患者鼻黏膜上皮細(xì)胞中相關(guān)的甲基化差異顯著區(qū)域的GO富集結(jié)果分析如圖3所示,其中包括了平滑肌細(xì)胞增殖及上皮管腔形成等各個(gè)方面。AC-TA2基因與其中的血管平滑肌收縮、蛋白質(zhì)磷酸化的正向調(diào)控、信號(hào)傳感器的活動(dòng)及線粒體功能等方面相關(guān)。2.2 ACTA2啟動(dòng)子檢測分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用補(bǔ)丁甲基化技術(shù)構(gòu)建特殊報(bào)告載體檢測DNA甲基化對(duì)FCER1G基因啟動(dòng)子的調(diào)控活性[J]. 梁云生,趙明,梁功平,尹恒,陸前進(jìn).  中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2013(02)



本文編號(hào):3132047

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