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呼吸道微生物組在呼吸系統(tǒng)疾病發(fā)生發(fā)展中的作用—二代測序

發(fā)布時間:2021-01-21 11:35
  背景:呼吸道微生物組與呼吸道疾病的相關(guān)研究現(xiàn)為一個焦點,測序技術(shù)的應(yīng)用可以更全面地闡述微生物群落結(jié)構(gòu)。測序技術(shù)應(yīng)用于呼吸道真菌微生物組學(xué)研究比較缺乏。但目前部分研究表明真菌在呼吸道疾病發(fā)生發(fā)展過程中扮演著重要角色,如真菌與喘息癥狀、耐藥等相關(guān),也參與了宿主粘膜免疫反應(yīng),并且證實真菌菌群的動態(tài)變化在人體健康與疾病狀態(tài)中作用重大。目前真菌微生物組研究包括了對囊性纖維化(Cystic Fibrosis,CF)、哮喘(Asthma,AS)和慢性阻塞性肺疾。–hronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)。在臨床工作中,在COPD急性發(fā)作期,常常給予吸入激素(Inhaled Corticosteroid,ICS)、長效β2受體激動劑(Long-acting β2-agonist inhaler,LABA)和長效M膽堿受體拮抗劑(Long-acting muscarinic antagonist,LAMA)聯(lián)合抗生素治療。但是,臨床上卻存在對三聯(lián)用藥(triple therapy,LAMA/LABA/ICS)和抗生素治療無效的現(xiàn)象。近期也有研究表明抗生素的使... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:73 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

呼吸道微生物組在呼吸系統(tǒng)疾病發(fā)生發(fā)展中的作用—二代測序


圖1-4.堆積圖展示真菌群落結(jié)構(gòu)組成變化和真菌兩大門水平相對豐度的組間對比??Figure?1-4.?Taxonomic?identi?

微生物群落結(jié)構(gòu),菌群,分析比較,組間


4、分組描述微生物群落結(jié)構(gòu)差異分析??我們使用LEfSe分析比較組間有統(tǒng)計學(xué)差異的菌群,該菌群可能成為診斷??疾病的生物標(biāo)記物。如下圖2-4為我們根據(jù)LEfSe分析比較結(jié)果,挑出組間何統(tǒng)??43??

菌群,組間,微生物群落結(jié)構(gòu)


?|?□Others??■|l?'?Il??B??圖2-3.堆積圖展示微生物群落結(jié)構(gòu)的組成變化。??Figure2-3.?Relative?Abundance?of?Each?Sample.??注:每-個柱狀閽的高低代表每個菌群的相對豐度的高低,展示菌群相對卡度y°/。的群落結(jié)??構(gòu)。(A)每個樣品在細(xì)菌菌群門水平的菌群結(jié)構(gòu)。(B)每個樣品在細(xì)菌菌群屬水平的菌群??結(jié)構(gòu)。??(A)Taxonomic?identification?of?bacterial?community?at?phylum?level?in?each?sample.??(B)Taxonomic?identification?of?bacterial?community?at?genus?level?in?each?sample.??4、分組描述微生物群落結(jié)構(gòu)差異分析??我們使用LEfSe分析比較組間有統(tǒng)計學(xué)差異的菌群,該菌群可能成為診斷??疾病的生物標(biāo)記物。如下圖2-4為我們根據(jù)LEfSe分析比較結(jié)果,挑出組間何統(tǒng)??43??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]痰真菌培養(yǎng)在診斷慢性阻塞性肺疾病并發(fā)持續(xù)喘息中的應(yīng)用研究[J]. 黃國平,毛選教,鄭哲.  中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2014(01)
[2]真菌與臨床喘息性疾病[J]. 王業(yè),文富強.  中華哮喘雜志(電子版). 2013(02)
[3]COPD并發(fā)持續(xù)喘息與痰真菌培養(yǎng)陽性的相關(guān)分析[J]. 祁卉卉,謝國鋼,高福生,金先橋.  中國呼吸與危重監(jiān)護(hù)雜志. 2009(02)



本文編號:2991086

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