【摘要】：目的:通過生物信息學(xué)分析方法預(yù)測ARDS差異表達(dá)的miRNA及其靶基因,并探討ARDS患者外周血中相關(guān)miRNA及其靶基因的表達(dá)及其臨床意義,評(píng)估其在ARDS患者診斷及預(yù)后方面的意義。方法:應(yīng)用R語言數(shù)據(jù)分析、GO和KEGG進(jìn)行基因功能和通路的富集分析方法來分析篩選出ARDS相關(guān)的差異表達(dá)的miRNA。根據(jù)氧合指數(shù)(PaO_2/FiO_2)將患者分為輕度ARDS組(200mmHgPaO_2/FiO_2≤300mmHg伴PEEP或CPAP≥5cmH_2O,n=20),中度ARDS組(100mmHgPaO_2/FiO_2≤200mmHg伴PEEP≥5cmH_2O,n=20),重度ARDS組(PaO_2/FiO_2≤100mmHg伴PEEP≥5cmH_2O,n=40)和80例健康受試者,采用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)技術(shù)檢測外周血中候選miRNA的表達(dá)水平;采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)同時(shí)檢測80例ARDS患者和80例健康受試者中血清MMP2的表達(dá)水平,并采用統(tǒng)計(jì)學(xué)分析其臨床意義;通過相關(guān)分析了解候選miRNA表達(dá)、MMP2、APACHEII評(píng)分與的相關(guān)性,并對(duì)ARDS存活者及死亡者進(jìn)行亞組分析,運(yùn)用Logistic回歸分析評(píng)估ARDS預(yù)后的不良危險(xiǎn)因素。結(jié)果:(1)通過挖掘數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)方法分析和篩選出ARDS相關(guān)的3個(gè)miRNA:miR-155-5p、miR-1-3p、miR-34a-5p。(2)通過模塊互作分析篩選出miR-34a-5p可以靶向調(diào)控MMP2,遂以MMP2進(jìn)行下一步臨床研究。(3)qRT-PCR結(jié)果提示miR-155-5p、miR-1-3p在ARDS患者外周血中高表達(dá),在健康受試者中呈現(xiàn)低表達(dá),但經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)算得出在ARDS患者外周血中與健康受試者中表達(dá)無顯著差異(P0.05);miR-34a-5p在ARDS患者外周血中與健康受試者中表達(dá)有顯著差異,且隨著ARDS疾病嚴(yán)重程度逐漸加重,miR-34a-5p表達(dá)逐漸升高,兩兩比較顯示各組間差異具有統(tǒng)計(jì)意義(P0.05)。(4)ELISA技術(shù)檢測四組受試者血清MMP2表達(dá)水平,不同嚴(yán)重程度分組患者血清MMP2的表達(dá)高于健康對(duì)照組,且重度較中度、輕度明顯升高,中度較輕度明顯升高(P0.05)。(5)ARDS患者外周血miR-34a-5p表達(dá)水平與MMP2表達(dá)水平呈正相關(guān)(r=0.946,p0.01);(6)miR-34a-5p、MMP2與APACHEII評(píng)分成正相關(guān)(r分別為0.961,0.988,p0.05)。(7)Logistic回歸分析提示APACHEII評(píng)分和miR-34a-5p升高為患者預(yù)后不良的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。結(jié)論:(1)通過生物信息學(xué)方法,我們篩選出miR-155-5p、miR-1-3p和miR-34a-5p,作為ARDS患者相關(guān)的候選標(biāo)志物;通過模塊互作我們選取MMP2作為ARDS患者相關(guān)的候選標(biāo)志物。(2)ARDS患者外周血miR-34a-5p呈高表達(dá)。(3)ARDS患者血清MMP2呈高表達(dá)。(4)miR-34a-5p或可靶向調(diào)控MMP2參與ARDS發(fā)生發(fā)展。(5)APACHEII評(píng)分和miR-34a-5p升高為患者預(yù)后不良的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。
【圖文】：

18圖 1-1. 差異基因A. 差異基因表達(dá)量的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)分布圖（黑色表示非差異基因，綠色表示差異基因）。B. 火山圖（藍(lán)色表示差異下調(diào)，紅色表示差異上調(diào)，灰色表示非差異）。Figure 1-1. Differential genesA. Statistical test distribution map of differentially expressed gene expression (green indicates differentialgenes, black indicates non-differentiated genes). B. Volcano map (blue indicates differential down, redindicates differential up, gray indicates non-difference).

圖 1-2. 氣泡圖展示感興趣的功能和通路富集結(jié)果Figure 1-2. Bubble chart showing the function and pathway enrichment results of interest2.4 互作模塊表征 ARDS 潛在功能失調(diào)，差異基因的確定為了觀察 MMP 家族基因，ncRNA，差異基因的相互作用，，我們將其映射到人類RNA-RNA 相互作用網(wǎng)絡(luò)（RRI）中，得到了一個(gè)關(guān)于差異基因的 RRI（圖 1-3）。結(jié)果共包括 2418 個(gè) RNA 和 34858 個(gè)互作對(duì)。
【學(xué)位授予單位】：右江民族醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：R563.8

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2640813