本文關(guān)鍵詞：Mucin 5B啟動子區(qū)多態(tài)性變異與中國人群間質(zhì)性肺炎發(fā)病風險的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景和目的MUC5B啟動子區(qū)GT的變異,SNP (rs35705950)被證實與高加索人群中家族性肺間質(zhì)病(familial interstitial pneumonia, FIP)和特發(fā)性肺纖維化(idiopathic pulmonary fibrosis, IPF)有強烈的關(guān)聯(lián)性,但是該變異與中國人群發(fā)病風險的關(guān)系尚未見報道。本實驗著手于MUC5B啟動子區(qū)變異和中國人群間質(zhì)性肺炎的發(fā)病風險的相關(guān)性進行研究。材料和方法1.利用限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)方法篩查405例間質(zhì)性肺疾病(interstitial lung diseases, ILD)病人、360例自身免疫病病人、103例普通肺炎病人和2034例正常對照人的DNA樣本中MUC5B基因啟動子區(qū)GT多態(tài)性變異(rs35705950)的基因型。2. Taqman探針法篩查ILD病人、自身免疫病病人、普通肺炎病人和正常對照人群DNA樣本中MUC5B基因動子區(qū)GT多態(tài)性變異(rs35705950)的基因型。3.直接測序法確定篩查出的雜合型(G/T)樣本的多態(tài)性位點基因型。結(jié)果1. MUC5B基因啟動子區(qū)GT變異：健康對照中T等位基因頻率為0.66%,ILD病人中T等位基因頻率為2.22%,IPF病人中T等位基因頻率為3.33%,自身免疫病病人和普通肺炎病人中T等位基因頻率分別為0.7%和0.49%。2.中國正常人群中MUC5B啟動子區(qū)突變T等位基因頻率顯著低于高加索人群(0.66%比10%),且T等位基因在中國正常人群中存在性別分布上的差異,T等位基因在成年男性(≥30歲)中的等位基因頻率低于成年女性(0.42%比1.04%,P=0.030),而在年輕男性(30歲)和女性中則沒有顯著差別。3.病例-對照研究發(fā)現(xiàn),ILD病人MUC5B基因啟動子區(qū)GT多態(tài)性變異的等位基因頻率為2.22%,顯著高于正常對照組0.79%(P=0.002,OR:2.885；95%CI: 1.449-5.627):IPF病人中T等位基因頻率3.33%,與健康對照組有顯著差異(P =0.001,OR:4.332,95%CI:1.992-9.419).按照年齡性別分層分析表明,MUC5B的這一多態(tài)性變異與ILD和IPF發(fā)病風險的相關(guān)性主要表現(xiàn)在老年(≥55)男性人群(OR:8.152,95%CI:2.192-30.314；OR:10.481,95％CI:2.593-42.355)。而在自身免疫病和普通肺炎病人中,MUC5B基因啟動子區(qū)GT多態(tài)性變異頻率與對照中相比無顯著性差異,表明與其發(fā)病風險無明顯關(guān)聯(lián)。結(jié)論我們在篩查MUC5B基因啟動子區(qū)GT變異(rs35705950)與ILD發(fā)病風險關(guān)系時,發(fā)現(xiàn)中國人群中T等位基因頻率顯著低于歐洲高加索人群。盡管該突變不是中國人群患IPF的主要因素,但是也與中國人ILD/IPF病人有強發(fā)病風險。未發(fā)現(xiàn)MUC5B基因rs35705950多態(tài)性與CTD-ILD.自身免疫病、普通肺炎有發(fā)病風險相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】：MUC5B基因 多態(tài)性變異 間質(zhì)性肺炎 特發(fā)性肺纖維化 發(fā)病風險
【學位授予單位】：南京大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R563.1
【目錄】：

• 中文摘要6-8
• ABSTRACT8-10
• 英文縮寫與中文對照10-11
• 1. 研究背景11-13
• 2. 材料與方法13-26
• 2.1 研究對象13-15
• 2.2 主要儀器和試劑15-16
• 2.3 外周血DNA提取16-17
• 2.4 MUC5B基因啟動子區(qū)rs35705950多態(tài)性變異的篩查17-22
• 2.4.1 引物設(shè)計17
• 2.4.2 限制性片段長度多態(tài)性技術(shù)分析MUC5B基因啟動子區(qū)變異的基因型17-19
• 2.4.3 Taqman探針法篩查MUC5B基因啟動子區(qū)突變19-22
• 2.5 高分辨率溶解曲線分析MUC5B啟動子區(qū)rs17235353缺失/插入的變異分析22-24
• 2.6 MUC5B基因測序24-26
• 2.6.1 瓊脂糖凝膠回收PCR產(chǎn)物24-25
• 2.6.2 Bigdye反應(yīng)25
• 2.6.3 沉淀步驟25-26
• 2.6.4 測序26
• 2.7 統(tǒng)計學方法26
• 3. 實驗結(jié)果26-37
• 3.1 MUC5B基因啟動子區(qū)多態(tài)性變異(rs35705950)篩查和驗證26-30
• 3.2 中國人群中rs35705950 T等位基因頻率低,成年男性和成年女性中有很大差異30-32
• 3.3 病例對照分析表明rs35705950 T等位基因與中國人群ILD和IPF風險相關(guān)32
• 3.4 MUC5B rs35705950多態(tài)性與結(jié)締組織病相關(guān)的ILD發(fā)病風險無明顯關(guān)聯(lián)32
• 3.5 分層分析MUC5B多態(tài)性并以與ILD的風險相關(guān)性32-34
• 3.6 MUC5B啟動子區(qū)的突變rs17235353與IPF的風險相關(guān)性34-37
• 4. 討論37-40
• 5. 結(jié)論40
• 參考文獻40-45
• 綜述45-58
• 參考文獻52-58
• 碩士期間發(fā)表論文58-59
• 致謝59-60

【共引文獻】

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本文編號：252375