【摘要】：目的了解2010年四川地區(qū)呼吸道合胞病毒(HRSV)G蛋白基因特征和優(yōu)勢型別。方法 RTPCR方法擴增18例呼吸道感染HRSV陽性患兒樣本HRSVG蛋白基因,測序并分析G蛋白基因特征,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹鑒定基因型,分析選擇壓力。結(jié)果所測G蛋白基因第二個高變區(qū)序列7例A亞型和11例B亞型核苷酸基因距離分別為0.022±0.005和0.073±0.010,堿基轉(zhuǎn)換率大于顛換率,A和B亞型分別主要是GA+AG和UC+CU轉(zhuǎn)換。系統(tǒng)進化分析A亞型全部為GA2基因型,B亞型為BA基因型和GB2基因型;A亞型G蛋白基因長度都為298aa,B亞型為295aa、312aa和315aa3種長度。A、B亞型的選擇壓力為凈化選擇占主導,第二個高變區(qū)A亞型有9個正選擇位點,B亞型有1個正選擇位點。結(jié)論 2010年四川18例HRSV以GA2、GB2和BA基因型為主要型別,G蛋白基因長度變化、堿基替換、選擇壓力是HRSV逃避免疫反應(yīng)的原因。
[Abstract]:Objective to understand the characteristics and dominant types of respiratory syncytial virus (HRSV) G protein gene in Sichuan in 2010. Methods RTPCR method was used to amplify the HRSVG gene of 18 HRSV positive children with respiratory tract infection. The G protein gene was sequenced and analyzed. Phylogenetic tree was constructed to identify the genotype and the selection pressure was analyzed. Results the nucleotide distances of 7 subtype A and 11 B subtypes of G protein gene were 0.022 鹵0.005 and 0.073 鹵0.010, respectively. The base conversion rate was higher than the transversion rate. Subtype A and B were mainly GA AG and UC CU transitions, respectively. Phylogenetic analysis showed that subtype A was GA2 genotype and subtype B was BA genotype and GB2 genotype. The length of G protein gene was 298aa in subtype A, 295aa in subtype B, 312aa and 315aa3 species length. The selection pressure of subtypes A and B was dominant in purification selection. There were 9 positive selection sites in subtype A and 1 positive selection site in subtype B in the second hypervariable region. Conclusion GA2,GB2 and BA genotypes were the main types of HRSV in Sichuan in 2010. G protein gene length change and base substitution were the main types of HRSV in 2010. Selection pressure was the reason why HRSV evaded immune response.
【作者單位】： 四川大學華西公共衛(wèi)生學院衛(wèi)生檢驗與檢疫學系;陜西省疾病預防控制中心;
【基金】：“艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治科技”重大專項“傳染病檢測技術(shù)平臺”項目 “云南省周邊省市傳染病病原譜流行規(guī)律研究”課題(No.2009ZX10004-212,No.2012ZX10004-212)資助
【分類號】：R563

【參考文獻】

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1 張燕,申昆玲,許文波,謝正德,蘆起,劉亞誼,劉春艷,梁國棟;北京地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株G蛋白基因遺傳變異特性研究[J];病毒學報;2005年05期

2 陳曉琦;徐葛林;全家嫵;;武漢地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株的G蛋白基因遺傳特征[J];中國生物制品學雜志;2008年06期

3 曹韻;張夢妍;廖虹瑜;關(guān)紅;葉倩;裴曉方;許欣;;592例呼吸道感染住院患兒呼吸道合胞病毒感染研究[J];現(xiàn)代預防醫(yī)學;2013年07期

【共引文獻】

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1 Qi Lu;Chun-xia Zhao;Kun-ling Shen;Wen-bo Xu;Yan Zhang;Jia-lin Yu;Xi-qiang Yang;;Genetic Characterization of Fusion Protein of Human Respiratory Syncytial Virus: Beijing[J];Infection International(Electronic Edition);2012年02期

2 陳曉琦;徐葛林;全家嫵;;武漢地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株的G蛋白基因遺傳特征[J];中國生物制品學雜志;2008年06期

3 張顏清;王英奇;;兒童支原體肺炎合并肺不張的臨床治療[J];中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè);2013年33期

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1 夏秋玲;呼吸道合胞病毒分離培養(yǎng)及其F蛋白基因變異分析[D];重慶醫(yī)科大學;2013年

【二級參考文獻】

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1 張燕,申昆玲,許文波,謝正德,蘆起,劉亞誼,劉春艷,梁國棟;北京地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株G蛋白基因遺傳變異特性研究[J];病毒學報;2005年05期

2 耿學輝,王之梁,錢淵,朱汝南,鄧潔,劉成貴,常汝虛,謝建屏,劉長清,朱宗涵;北京等四地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株G蛋白基因的比較分析[J];病毒學報;1999年01期

3 王斌,黃為民,梁巧明;廣州地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株亞型分析[J];中國兒童保健雜志;2000年02期

4 陽雋,黃海鷺,徐軍,鐘南山;廣州地區(qū)呼吸道合胞病毒分離株G蛋白基因序列分析[J];廣東醫(yī)學;2003年06期

5 朱汝南 ,鄧潔,王芳,錢淵,盧競,車莉;2000年秋冬至2002年夏北京地區(qū)急性呼吸道感染病毒病原學研究[J];臨床兒科雜志;2003年01期

6 陳小芳,董琳,李孟榮,張正霞,李昌崇;溫州地區(qū)嬰幼兒急性下呼吸道感染病毒病原學分析[J];臨床兒科雜志;2005年07期

7 亓曉,趙根明,張建華,丁云芳,陶云珍,諸麗娟,姜慶五;5歲以下呼吸道感染住院患兒痰標本的細菌與病毒病原學[J];復旦學報(醫(yī)學版);2004年03期

8 陳曉琦;徐葛林;全家嫵;;快速細胞培養(yǎng)法在呼吸道合胞病毒感染早期診斷中的應(yīng)用[J];中國生物制品學雜志;2007年04期

9 張然,董繼華,周生華,田慕貞;呼吸道合胞病毒A、B亞型變異的進一步研究[J];同濟醫(yī)科大學學報;1994年03期

10 茅海燕;盧亦愚;嚴菊英;;浙江地區(qū)呼吸道合胞病毒G基因分子特征分析[J];Virologica Sinica;2006年02期

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1 包軍;呼吸道合胞病毒所致下呼吸道感染的免疫機制和干擾素治療[J];現(xiàn)代診斷與治療;1996年03期

2 張艷敏,雷春蓮,王麗;三氮唑核苷霧化治療呼吸道合胞病毒感染的療效觀察[J];西安醫(yī)科大學學報;1997年02期

3 蔡曉紅;呼吸道合胞病毒毛細支氣管炎血清酶學的變化及其意義[J];河南診斷與治療雜志;1998年01期

4 王秀英，，曾冬元，董成松;呼吸道合胞病毒與長沙市小兒下呼吸道感染的關(guān)系[J];湖南醫(yī)學;1994年01期

5 袁孝賓;成人可群體獲得性發(fā)生呼吸道合胞病毒肺炎[J];國外醫(yī)學.呼吸系統(tǒng)分冊;1997年03期

6 鄒毅!510120現(xiàn)在廣州醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院變態(tài)反應(yīng)科510260,黃海鷺!510120,徐軍!510120,鐘南山!510120;小鼠的原發(fā)性呼吸道合胞病毒感染[J];中華結(jié)核和呼吸雜志;2001年08期

7 謝健屏，常汝虛，張美德;從尸解肺組織分離呼吸道合胞病毒2例分析[J];中華實驗和臨床病毒學雜志;1994年01期

8 張方;王嘉祺;馬慧;鄒鳳梅;劉剛;魏蓮花;魏玲;;老年人呼吸道合胞病毒感染32例臨床觀察[J];衛(wèi)生職業(yè)教育;2006年12期

9 陳方方;賈煃婷;焦倫先;姜淑娟;;呼吸道合胞病毒與支氣管哮喘[J];國際呼吸雜志;2006年08期

10 鄭冬凌;唐建民;郝彥峰;;呼吸道合胞病毒在支氣管哮喘發(fā)病中的作用[J];黑龍江醫(yī)學;2007年02期

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1 鄒毅;鐘南山;;呼吸道合胞病毒與支氣管哮喘[A];第一屆全國變態(tài)反應(yīng)學術(shù)研討會論文匯編[C];2001年

2 方泓;;呼吸道合胞病毒對哮喘支氣管上皮細胞作用的研究進展[A];第十次全國中西醫(yī)結(jié)合防治呼吸系統(tǒng)疾病學術(shù)研討會論文集[C];2009年

3 徐輝;程永樟;陳學軍;梁建鳳;鄭怡;;中國人群IL4受體Q576R基因多態(tài)性與支氣管哮喘易感性的Meta分析[A];2007年浙江省醫(yī)學檢驗學學術(shù)年會論文匯編[C];2007年

4 張曉巖;林江濤;李香凝;楊萌;俞紅霞;李桂琴;黃小杰;王萍;張嵐;周童亮;舒峻;;纖溶酶原激活物抑制劑1基因多態(tài)性對支氣管哮喘發(fā)病及血漿纖溶酶原激活物抑制劑1水平影響的研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國呼吸病學術(shù)會議暨學習班論文匯編[C];2006年

5 席淑華;郭麗;孫文娟;葉麗杰;祁榮;王雨;崔全山;;谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶基因多態(tài)性和大氣污染的交互作用對哮喘影響研究[A];2003年全國免疫毒理學術(shù)交流會論文集[C];2003年

6 金海霞;李們;付雷;陸宇;;NAT2基因型與異煙肼血藥濃度關(guān)系的研究[A];2011年中國防癆協(xié)會全國學術(shù)會議論文集[C];2011年

7 張曉雷;王辰;龐寶森;林英翔;逯勇;王軍;;血管緊張素轉(zhuǎn)換酶基因多態(tài)性對慢性阻塞性肺疾病患者運動耐力的影響[A];中華醫(yī)學會第七次全國呼吸病學術(shù)會議暨學習班論文匯編[C];2006年

8 張希龍;蘇士成;殷凱生;張希龍;;脂聯(lián)素基因單核苷酸多態(tài)性與阻塞性睡眠呼吸暫停低通氣綜合征的關(guān)系[A];中華醫(yī)學會第七次全國呼吸病學術(shù)會議暨學習班論文匯編[C];2006年

9 崔麗英;劉曉華;高麗霞;樊東升;;內(nèi)蒙古人群β_2腎上腺素受體基因多態(tài)性與支氣管哮喘關(guān)系的研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國呼吸病學術(shù)會議暨學習班論文匯編[C];2006年

10 王雯;王辰;哈木拉提·吾甫爾;伊力哈木江·沙比提;;β_2腎上腺素能受體基因多態(tài)性與新疆維吾爾族支氣管哮喘患者關(guān)系的研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國呼吸病學術(shù)會議暨學習班論文匯編[C];2006年

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1 ;產(chǎn)質(zhì)粒介導Ⅰ型頭孢菌素酶細菌的耐藥性及基因型研究[N];中國醫(yī)藥報;2003年

2 麥迪信;為了讓哮喘不再流行[N];醫(yī)藥經(jīng)濟報;2002年

3 羅剛邋通訊員 黃余紅 王繼榮;治療下呼吸道感染：走出中國道路[N];健康報;2007年

4 本報記者 張麗霞　實習生 謝文思;呼吸道感染別恐懼[N];大連日報;2008年

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1 高金明;支氣管哮喘分子遺傳學的研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2001年

2 蔣雄斌;CD8～+T細胞在呼吸道合胞病毒誘導的哮喘中的作用研究[D];南京醫(yī)科大學;2006年

3 陳雪融;NRAMP1基因、維生素D受體基因多態(tài)性與中國藏族結(jié)核病的關(guān)聯(lián)研究[D];四川大學;2006年

4 楊士芳;DNA加合物及其相關(guān)修復酶基因多態(tài)性在COPD發(fā)病中的研究[D];華中科技大學;2009年

5 邱玉英;β_2腎上腺素能受體基因單倍型/多態(tài)性與哮喘及其臨床表型的相關(guān)研究[D];南京醫(yī)科大學;2007年

6 王蓓;OSAHS患者心功能測定、心血管相關(guān)因子檢測及β_1-腎上腺素受體基因多態(tài)性研究[D];山西醫(yī)科大學;2008年

7 陸艷輝;中國人群肺動脈血栓栓塞癥易感因素研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;2002年

8 陳昕;人偏肺病毒感染分子流行病學及與哮喘發(fā)作的關(guān)系[D];重慶醫(yī)科大學;2010年

9 肖毅;阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征和發(fā)作性睡病發(fā)病機制的基礎(chǔ)研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學;1998年

10 崔玉霞;小發(fā)卡結(jié)構(gòu)狀RNA聯(lián)合脫氧核酶抗呼吸道合胞病毒實驗研究[D];重慶醫(yī)科大學;2006年

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1 穆雪濵;下呼吸道產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶細菌的分子流行病學研究[D];暨南大學;2005年

2 王應(yīng)燈;脂多糖和血小板活化因子誘導大鼠肺微血管內(nèi)皮細胞損傷機制及GRKs對其調(diào)控研究[D];安徽醫(yī)科大學;2004年

3 趙煒;IL-4基因和IL-13基因多態(tài)性與哮喘的相關(guān)性及對血漿總IgE水平的影響[D];青島大學;2007年

4 鄭晶晶;慢性阻塞性肺疾病急性加重期住院患者病毒感染危險因素分析[D];南方醫(yī)科大學;2013年

5 周丹;Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性與結(jié)核病的相關(guān)性研究[D];重慶醫(yī)科大學;2007年

6 吳照芳;白介素1β及白介素1受體拮抗劑基因多態(tài)性與哮喘的相關(guān)性研究[D];南昌大學;2007年

7 孫長虹;血管緊張素轉(zhuǎn)化酶基因多態(tài)性與特發(fā)性肺纖維化的相關(guān)性[D];河北醫(yī)科大學;2008年

8 葉涵;ADAM33基因T2、S2位點單核苷酸多態(tài)性與哮喘的相關(guān)性研究[D];南方醫(yī)科大學;2009年

9 陳治中;湖北漢族人群TIM-3基因單體型與變應(yīng)性哮喘相關(guān)性研究[D];華中科技大學;2008年

10 顧玉虹;γ-干擾素和白介素-10基因多態(tài)性與中國廣東地區(qū)漢族人群肺結(jié)核易感性關(guān)系的研究[D];廣州醫(yī)學院;2009年

本文編號：2442805