【摘要】：目的了解2010年四川地區(qū)呼吸道合胞病毒(HRSV)G蛋白基因特征和優(yōu)勢(shì)型別。方法 RTPCR方法擴(kuò)增18例呼吸道感染HRSV陽(yáng)性患兒樣本HRSVG蛋白基因,測(cè)序并分析G蛋白基因特征,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)鑒定基因型,分析選擇壓力。結(jié)果所測(cè)G蛋白基因第二個(gè)高變區(qū)序列7例A亞型和11例B亞型核苷酸基因距離分別為0.022±0.005和0.073±0.010,堿基轉(zhuǎn)換率大于顛換率,A和B亞型分別主要是GA+AG和UC+CU轉(zhuǎn)換。系統(tǒng)進(jìn)化分析A亞型全部為GA2基因型,B亞型為BA基因型和GB2基因型;A亞型G蛋白基因長(zhǎng)度都為298aa,B亞型為295aa、312aa和315aa3種長(zhǎng)度。A、B亞型的選擇壓力為凈化選擇占主導(dǎo),第二個(gè)高變區(qū)A亞型有9個(gè)正選擇位點(diǎn),B亞型有1個(gè)正選擇位點(diǎn)。結(jié)論 2010年四川18例HRSV以GA2、GB2和BA基因型為主要型別,G蛋白基因長(zhǎng)度變化、堿基替換、選擇壓力是HRSV逃避免疫反應(yīng)的原因。
[Abstract]:Objective to understand the characteristics and dominant types of respiratory syncytial virus (HRSV) G protein gene in Sichuan in 2010. Methods RTPCR method was used to amplify the HRSVG gene of 18 HRSV positive children with respiratory tract infection. The G protein gene was sequenced and analyzed. Phylogenetic tree was constructed to identify the genotype and the selection pressure was analyzed. Results the nucleotide distances of 7 subtype A and 11 B subtypes of G protein gene were 0.022 鹵0.005 and 0.073 鹵0.010, respectively. The base conversion rate was higher than the transversion rate. Subtype A and B were mainly GA AG and UC CU transitions, respectively. Phylogenetic analysis showed that subtype A was GA2 genotype and subtype B was BA genotype and GB2 genotype. The length of G protein gene was 298aa in subtype A, 295aa in subtype B, 312aa and 315aa3 species length. The selection pressure of subtypes A and B was dominant in purification selection. There were 9 positive selection sites in subtype A and 1 positive selection site in subtype B in the second hypervariable region. Conclusion GA2,GB2 and BA genotypes were the main types of HRSV in Sichuan in 2010. G protein gene length change and base substitution were the main types of HRSV in 2010. Selection pressure was the reason why HRSV evaded immune response.
【作者單位】： 四川大學(xué)華西公共衛(wèi)生學(xué)院衛(wèi)生檢驗(yàn)與檢疫學(xué)系;陜西省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：“艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治科技”重大專項(xiàng)“傳染病檢測(cè)技術(shù)平臺(tái)”項(xiàng)目 “云南省周邊省市傳染病病原譜流行規(guī)律研究”課題(No.2009ZX10004-212,No.2012ZX10004-212)資助
【分類號(hào)】：R563

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本文編號(hào)：2442805