【摘要】：目的分離鑒定一位重癥肺炎患者血液中的未知細(xì)菌并進(jìn)行多位點(diǎn)序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)。方法采用VITEK-2 compact微生物系統(tǒng)進(jìn)行鑒定和藥物敏感試驗(yàn),PCR法擴(kuò)增細(xì)茵的16S r DNA基因,通過測序并與Gen Bank中相關(guān)序列進(jìn)行比對(duì)。采用MLST進(jìn)行分型,BURST軟件分析細(xì)菌的遺傳變異。結(jié)果經(jīng)VITEK-2 compact微生物系統(tǒng)初步鑒定為類鼻疽伯克霍爾德菌。16S r DNA PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)測序與Gen Bank中序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)與類鼻疽伯克霍爾德菌CP012577.1序列有99%同源性,證實(shí)該菌為類鼻疽伯克霍爾德菌(Burkholderia pseudomallei)。MLST發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的序列型(sequence type,ST)-ST1348,與來自巴布亞新幾內(nèi)亞分離株僅有一個(gè)基因的差異,且均可溯源至澳大利亞株。結(jié)論來源于急性感染患者血液中的未知細(xì)菌是類鼻疽伯克霍爾德菌,MLST分型發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的ST序列-ST1348,該分離株與巴布亞新幾內(nèi)亞菌株ST246密切相關(guān)。
[Abstract]:Objective to isolate and identify the unknown bacteria in the blood of a severe pneumonia patient and Multilocus sequence typing (MLST). Methods the VITEK-2 compact microbiological system was used for identification and drug sensitivity test. The PCR method was used to amplify the R DNA gene of the 16S, and was sequenced and compared with the related sequence in Gen Bank. The genetic variation of bacteria was analyzed by MLST and BURST software. The results were preliminarily identified by VITEK-2 compact microbiological system as.16S R DNA PCR amplification of Burke and Holder bacteria, and the product was sequenced and compared with Gen Bank sequence. It was found to have 99% homology with the CP012577.1 sequence of Burke and Holder like bacteria, which confirmed that the bacteria was a kind of genus of the genus. Burkholderia pseudomallei (Burkholderia pseudomallei).MLST found a new sequence type (sequence type, ST) -ST1348, with only one gene from the isolated strains from Papua New Guinea, and traceable to the Australian strain. Conclusion the unknown bacteria from the blood of the acute infected patients were Burke Holder, the MLST score. A new ST sequence -ST1348 was found, which is closely related to Papua New Guinea strain ST246.
【作者單位】： 江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院;揚(yáng)州市第三人民醫(yī)院檢驗(yàn)科;江蘇大學(xué)附屬武進(jìn)醫(yī)院檢驗(yàn)科;江蘇大學(xué)附屬人民醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81101227) 鎮(zhèn)江市社會(huì)發(fā)展項(xiàng)目(SH2015040)
【分類號(hào)】：R563.1

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本文編號(hào)：2121869