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社區(qū)肺炎抗感染治療、VAP預(yù)防效果及軍團(tuán)菌基因組臨床與實(shí)驗(yàn)研究

發(fā)布時(shí)間:2018-05-11 12:15

  本文選題:抗菌藥物 + 社區(qū)獲得性肺炎; 參考:《復(fù)旦大學(xué)》2013年碩士論文


【摘要】:目的比較住院前后72小時(shí)內(nèi)經(jīng)驗(yàn)性抗感染治療是否覆蓋非典型病原體,對(duì)于患者住院期間的臨床療效及經(jīng)濟(jì)學(xué)指標(biāo)的影響。 方法本研究為基于人群的、多中心、回顧性隊(duì)列設(shè)計(jì)。納入江浙滬地區(qū)4家三級(jí)醫(yī)院、6家二級(jí)醫(yī)院,在2010年6月1日至2011年5月31日期間符合研究設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)的住院CAP患者。收集人口學(xué)資料、基礎(chǔ)疾病、臨床體檢、實(shí)驗(yàn)室檢查、治療和預(yù)后等相關(guān)信息。采用統(tǒng)計(jì)分析比較治療組和對(duì)照組之間臨床療效及經(jīng)濟(jì)學(xué)指標(biāo)的差異。結(jié)果共納入住院CAP患者827例。入院前后72小時(shí)內(nèi)抗感染治療中覆蓋非典型病原體(AP覆蓋組)的全因病死率為0.9%(95%CI,0.1-1.7%)顯著低于對(duì)照組(抗感染治療中覆蓋非典型病原體)的4.9%(95%CI,2.6-8.2%),糾正倚偏后的相對(duì)危險(xiǎn)度(RR)為0.18(95%CI,0.06-0.50)。主要經(jīng)濟(jì)學(xué)指標(biāo):AP覆蓋組的住院天數(shù)(length of stay, LOS)為10.1(95%CI,9.79-10.50)天,對(duì)照組的LOS為11.6(95%CI,11.00-12.25)天,p0.01?偟淖≡嘿M(fèi)用在AP覆蓋組為7306.0(95%CI,6905.9-7706.2)元,顯著低于對(duì)照組的9411.8(95%CI,8613.9-10209.6)元,p0.01。直接抗菌藥物費(fèi)用,AP覆蓋組為2653.1(95%CI,2477.6-2828.7)元,低于對(duì)照組的費(fèi)用3133.0(95%CI,2860.8-3405.2)元,p0.01。藥物使用強(qiáng)度(DDD)在AP覆蓋組為19.2(95%CI,18.3-20.2),同對(duì)照組的18.3(95%CI,17.0-19.6),p=0.28。 結(jié)論抗感染治療方案早期經(jīng)驗(yàn)性覆蓋非典型病原體有利于降低CAP患者的全因病死率,減少住院時(shí)間,降低總住院費(fèi)用和抗菌藥物直接費(fèi)用。 目的評(píng)價(jià)組合干預(yù)措施對(duì)上海市176個(gè)ICU呼吸機(jī)相關(guān)肺炎(VAP)發(fā)病率的影響。 方法本研究為前-后對(duì)照研究,起止時(shí)間為2007年1月至2012年6月,分為3個(gè)階段:基線調(diào)查、過(guò)渡期和干預(yù)期。主要VAP組合干預(yù)措施包括為加強(qiáng)手衛(wèi)生、半臥位,采用消毒劑進(jìn)行口腔護(hù)理以及對(duì)醫(yī)護(hù)人員的宣教和督查。由醫(yī)院感染控制專職人員收集ICU出入院人數(shù)、患者基本信息、住院天數(shù)、接受機(jī)械通氣天數(shù)和VAP發(fā)病情況等資料。比較干預(yù)前、后VAP發(fā)病率,評(píng)價(jià)組合干預(yù)措施效果。 結(jié)果共收集患者資料463,208例名患者資料,總計(jì)監(jiān)測(cè)ICU床日數(shù)為2,535,917天,累計(jì)總機(jī)械通氣日數(shù)(ventilator days, VDs)為695,185天;調(diào)查階段,VAP發(fā)病率為每千VDs23.4例。實(shí)施組合干預(yù)后,VAP發(fā)病率明顯開(kāi)始下降,2009-2012年VAP平均發(fā)病率為每千VDs14.3例(2009-2012vs2007,RR=0.61(95%CI,0.59-0.64),RD=9.1(95%CI,8.3-9.9)。 結(jié)論在ICU中施行VAP組合千預(yù)措施,可顯著降低患者VAP發(fā)病率。 目的通過(guò)分析嗜肺軍團(tuán)菌環(huán)境分離株和臨床分離株在基因組水平上的差異,探索其對(duì)人類致病性的影響。 方法對(duì)分離于醫(yī)院環(huán)境中的嗜肺軍團(tuán)菌(LPE509)采用高通量Illumina技術(shù)denovo測(cè)序。。通過(guò)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行拼接、組裝后獲得完整的基因組數(shù)據(jù)。采用生物信息學(xué)分析方法預(yù)測(cè)基因和可能編碼的蛋白。利用OrthoMCL和Vaxign系統(tǒng)將LPE509基因組同已經(jīng)公布序列的L.pneumophila(strains130b,570-CO-H,Alcoy, Corby, Lens, Paris, Philadelphia1)比較基因組水平的差異。 結(jié)果基因組數(shù)據(jù)已經(jīng)保存于GenBank,檢索號(hào)為CP003885、CP003886。LPE509同其它7株已經(jīng)測(cè)序的Lpneumophila存在一定相似性。LPE509基因組中發(fā)現(xiàn)了編碼分泌系統(tǒng)的基因,其中包括type I secretion system(T1SS)、T2SS以及Dot/IcinT4BSS。在所有已完成測(cè)序的L.pneumophila菌株中Dot/Icm T4SSB相對(duì)保守,LPE509基因組中發(fā)現(xiàn)了同致病性高度相關(guān)的T4BSS的重要組分Lvh基因。7.3kbp的質(zhì)粒為L(zhǎng)PE509所特有,其中發(fā)現(xiàn)了可能編碼多重耐藥的基因。通過(guò)于其它7株序列(130b,570-CO-H, Alcoy, Corby, Lens, Paris, Philadelphia1)序列比對(duì),LPE509編碼的580,235,512,522,669,443,562為首次發(fā)現(xiàn)的蛋白。 結(jié)論不同種屬L.pneumophila基因組水平存在高度異質(zhì)性,而編碼分泌系統(tǒng)的基因,T1SS、T2SS以及Dot/Icm T4BSS目對(duì)保守。
[Abstract]:Objective to compare the effects of empirical anti infection treatment on atypical pathogens within 72 hours before and after hospitalization and on the clinical efficacy and economic indicators of patients during hospitalization.
Methods the study was based on population, multi center and retrospective cohort design. It was included in 4 three level hospitals in Jiangsu, Zhejiang and Shanghai, 6 class two hospitals, which met the research design criteria for CAP patients during the period from June 1, 2010 to May 31, 2011. The related letters, basic diseases, clinical physical examination, laboratory examination, treatment and prognosis were collected. Statistical analysis was used to compare the differences in clinical and economic indicators between the treatment group and the control group. The results were included in 827 hospitalized CAP patients. The total cause fatality rate of 0.9% (95%CI, 0.1-1.7%) covering the atypical pathogens (AP coverage group) in the anti infection treatment was significantly lower than that of the control group (anti infection treatment coverage) within 72 hours before and after admission. 4.9% (95%CI, 2.6-8.2%) of the atypical pathogen (95%CI, 0.06-0.50) after correction (95%CI, 0.06-0.50). The main economic indicators: the number of hospital days in the AP coverage group (length of stay, LOS) was 10.1 (95%CI, 9.79-10.50) days, and the control group was 11.6 (9), and the total hospitalization expenses were 7306 (9) 5%CI, 6905.9-7706.2) yuan, significantly lower than the control group of 9411.8 (95%CI, 8613.9-10209.6), p0.01. direct antibacterial drug costs, AP coverage group of 2653.1 (95%CI, 2477.6-2828.7), lower than the control group costs 3133 (95%CI, 2860.8-3405.2), p0.01. drug use strength (DDD) in 19.2 (9), with the control group of 18.3 (9) 5%CI, 17.0-19.6), p=0.28.
Conclusion the early empirical coverage of atypical pathogens in the anti infection treatment regimen is beneficial to reducing the total cause of death in CAP patients, reducing the time of hospitalization, reducing the total hospitalization expenses and the direct cost of antibacterial drugs.
Objective to evaluate the effect of combined interventions on the incidence of 176 ICU ventilator-associated pneumonia (VAP) in Shanghai.
Methods the study was a pre and post control study. The onset and stop time was from January 2007 to June 2012. It was divided into 3 stages: baseline survey, transition period and dry expectation. The main VAP intervention measures included strengthening hand hygiene, semi lying position, using disinfectants for oral care and education and supervision of medical staff. The staff collected the number of ICU entrance and exit, the basic information of the patients, the days of hospitalization, the number of days of mechanical ventilation and the incidence of VAP, compared the incidence of VAP before and after the intervention, and evaluated the effect of the combined intervention measures.
Results a total of 463208 patient data were collected, the total number of ICU bed days was 2535917 days, the total total mechanical ventilation day (ventilator days, VDs) was 695185 days. The incidence of VAP was per 1000 VDs23.4 cases at the baseline survey stage. The incidence of VAP incidence began to decline, and the average incidence of VAP in 2009-2012 years was per thousand. VDs14.3 cases (2009-2012vs2007, RR=0.61 (95%CI, 0.59-0.64), RD=9.1 (95%CI, 8.3-9.9).
Conclusion VAP combined with 1000 preconditioning in ICU can significantly reduce the incidence of VAP in patients.
Objective to explore the effect of Legionella pneumophila on the pathogenicity of human beings by analyzing the differences in genomic level between Legionella pneumophila isolates and clinical isolates.
Methods the Legionella pneumophila (LPE509) isolated from the hospital environment was sequenced with high throughput Illumina technology, denovo, and complete genome data were obtained by sequencing. The gene and possible encoded proteins were predicted by bioinformatics analysis. The LPE509 genome was used by OrthoMCL and Vaxign system. The differences in comparative genomic level of published sequences of L.pneumophila (strains130b, 570-CO-H, Alcoy, Corby, Lens, Paris, Philadelphia1) were compared.
Results genomic data had been stored in GenBank, the search number was CP003885, CP003886.LPE509 and other 7 other sequenced Lpneumophila had a certain similarity in the.LPE509 genome and found the genes encoding the secretory system, including type I secretion system (T1SS), T2SS, and Dot/IcinT4BSS. in all completed sequencing. The Dot/Icm T4SSB in the hila strain is relatively conservative. The plasmid of the important component of the T4BSS that is highly related to the pathogenicity of the Lvh gene.7.3kbp is unique to LPE509, and the genes that may be coded for multidrug resistance are found. The sequence ratio of the other 7 sequences (130b, 570-CO-H, Alcoy, Corby, Corby) Yes, LPE509 encoded 580235512522669443562 is the first protein found.
Conclusion the L.pneumophila genomes of different species are highly heterogeneous, while genes encoding the secretory system, T1SS, T2SS and Dot/Icm T4BSS are conservative.

【學(xué)位授予單位】:復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R563.1

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