本文關(guān)鍵詞： 組織蛋白酶B 矽肺 差異表達(dá)基因 電子克隆　出處：《中國工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志》2014年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的探討差異表達(dá)基因組織蛋白酶B在大鼠矽肺模型中的作用。方法對以往經(jīng)抑制消減雜交篩選得到的一條編號為ES110708的差異表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)作為種子序列,通過電子克隆進(jìn)行延伸,并在大鼠矽肺模型中用RT-PCR方法進(jìn)行驗證。結(jié)果篩選得到的大鼠矽肺差異表達(dá)EST經(jīng)電子克隆延伸得到了含有完整開放讀碼框架(ORF)的cDNA序列,長度為1977bp,比原來的EST片段(172bp)延伸了1805 bp。其ORF預(yù)測為1020 bp,符合Kozak規(guī)則。將ORF序列進(jìn)行同源性檢索,其與序列號為NM022597.2的cDNA部分序列完全同源,說明所測ORF屬于序列NM022597.2。該序列代表的基因是組織蛋白酶B。經(jīng)RT-PCR驗證,實驗組大鼠肺組織Cathepsin B mRNA表達(dá)量明顯上調(diào)。15 d、30 d、60 d時,其吸光度(A)值分別為對照組的4.133、6.639、4.981倍,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論電子克隆能有效延伸EST序列直至全長cDNA序列,差異表達(dá)基因組織蛋白酶B可能參與了矽肺的發(fā)生與發(fā)展。
[Abstract]:Objective to investigate the role of differentially expressed cathepsin B (cathepsin B) in rat model of silicosis. Methods A differentially expressed sequence label named ES110708, which was selected by suppression subtractive hybridization, was used as seed sequence. The rat silicosis differential expression EST was amplified by electronic cloning and verified by RT-PCR method in the rat silicosis model. Results the cDNA sequence with complete open reading frame was obtained by electronic cloning extension of rat silicosis differential expression EST. The length is 1977bp, which extends 1805 BP compared with the original EST fragment 172bp. its ORF prediction is 1020 BP, which conforms to the Kozak rule. The homology search of ORF sequence is completely homologous to the partial sequence of cDNA with sequence number NM022597.2. The results showed that the ORF belonged to the sequence NM022597.2.The gene represented by this sequence was cathepsin B. the expression of Cathepsin B mRNA in lung tissue of experimental group was significantly up-regulated at 30 d ~ 60 d, and the absorbance of Cathepsin B was 4.981 times higher than that of control group, respectively, after 30 d ~ (60 d) upregulation, as compared with that of control group, NM022597.2.The expression of Cathepsin B mRNA in lung tissue of experimental group was 4.133 times higher than that of control. Conclusion Electronic cloning can effectively extend the EST sequence to the full-length cDNA sequence, and the differentially expressed cathepsin B may be involved in the genesis and development of silicosis.
【作者單位】： 河北聯(lián)合大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)系;唐山市眼科醫(yī)院病理科;淄博市中心醫(yī)院病理科;
【基金】：河北省科學(xué)技術(shù)研究與發(fā)展計劃項目(09276192D)
【分類號】：R135.2

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 山麗梅,張錦超,趙艷玲,俞煒源,汪海;血管內(nèi)皮細(xì)胞乙酰膽堿作用靶標(biāo)相關(guān)新基因的電子克隆[J];生物技術(shù)通訊;2004年04期

2 李蕾,趙東赤,張楚瑜,李樂,游上游,黃靜寧;呼吸道合胞病毒感染SPC-A1相關(guān)新基因zlg10con的電子克隆及分析和驗證[J];武漢大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版);2003年04期

3 黃驥,王建飛,張紅生,曹雅君,林長發(fā),王東,楊金水;水稻葡萄糖-6-磷酸脫氫酶cDNA的電子克隆[J];遺傳學(xué)報;2002年11期

4 夏榮,黎燕,凌倫獎,馮建男,蘭炯采,沈倍奮;白細(xì)胞介素-6相關(guān)新基因的生物學(xué)分析[J];第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2003年01期

5 付勁蓉,劉文勵,周劍鋒,周玉峰,徐酉華,金先慶;多藥耐藥相關(guān)基因HV126的電子克隆及在化療前后白血病細(xì)胞中的表達(dá)[J];中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志;2005年02期

6 張其威,李蕾,趙東赤,張楚瑜,李樂,游上游,黃靜寧;人呼吸道合胞病毒感染的SPC-A1細(xì)胞相關(guān)基因zzz171con的電子克隆與分析[J];氨基酸和生物資源;2005年02期

7 李鑫,章濤;新基因的克隆策略和方法[J];海峽藥學(xué);2004年03期

8 邵筱,吳忠道,劉翰騰,鄒賽德,余新炳;應(yīng)用EST和電子克隆策略研究血吸蟲表達(dá)基因譜[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2005年07期

9 胡震;楊樹源;張建寧;楊新宇;;腦膿腫相關(guān)新基因RBAG2-3的電子克隆及其功能預(yù)測[J];中華神經(jīng)醫(yī)學(xué)雜志;2006年02期

10 唐雪芳;賀修勝;;生物信息學(xué)策略鑒定新基因[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2008年07期

相關(guān)會議論文 前10條

1 劉慧泉;付艷蘋;姜道宏;謝甲濤;程家森;李國慶;易先宏;;利用電子克隆技術(shù)克隆病毒基因組[A];中國植物病理學(xué)會2010年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2010年

2 陳超;魏明發(fā);朱珉;;豬吲哚2,3-二氧化酶的電子克隆與生物信息學(xué)分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第八次全國小兒外科學(xué)術(shù)會論文集[C];2010年

3 鄭小龍;羅洪林;張為宇;黃維義;;大片吸蟲成蟲FG0018EST序列的電子克隆分析和驗證[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜寄生蟲學(xué)分會第五次代表大會暨第八次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2004年

4 邵健忠;金紅建;項黎新;毛樹堅;;魚類免疫功能基因的電子克隆及數(shù)字化差異顯示分析[A];中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會第八屆會員代表大會暨學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2003年

5 邵淑敏;蔣思文;;豬APC基因家族的電子克隆,表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[A];第十二次全國畜禽遺傳標(biāo)記研討會論文集[C];2010年

6 李亮;朱慶;;家雞核糖體蛋白基因RPS13的電子克隆及鑒定[A];中國家禽業(yè)——機遇與挑戰(zhàn)——第十三次全國家禽學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2007年

7 付勁蓉;劉文勵;周劍鋒;孫漢英;金先慶;徐酉華;;多藥耐藥相關(guān)新基因HV126的電子克隆及在化療前后急性白血病細(xì)胞中的表達(dá)分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第八次全國血液學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2004年

8 曹隨忠;李宏濱;姚學(xué)萍;趙興緒;杜立新;;牛PSME1基因的電子克隆與序列分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2006學(xué)術(shù)年會論文集（上冊）[C];2006年

9 王海濤;暢繼武;郭志;;人和大鼠自噬相關(guān)新基因WIPI-3的電子克隆和序列分析[A];第四屆中國腫瘤學(xué)術(shù)大會暨第五屆海峽兩岸腫瘤學(xué)術(shù)會議論文集[C];2006年

10 葛曉奇;;豬Chemerin基因的克隆與序列分析[A];中國動物遺傳育種研究進(jìn)展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年

相關(guān)重要報紙文章 前2條

1 本報記者 張荔子;用電子技術(shù)克隆基因[N];健康報;2002年

2 支勇平　記者 張哲浩;我小麥條銹病研究取得五大突破[N];科技日報;2009年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 李彬;人子宮肌瘤相關(guān)基因的克隆和研究[D];中國科學(xué)院研究生院（上海生命科學(xué)研究院）;2002年

2 陳軍方;太谷核不育基因ms2的分子生物學(xué)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

3 張鳳偉;豬七個候選印記基因的分離、印記鑒定及其與性狀的關(guān)聯(lián)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

4 張劍亮;觀賞向日葵花色形成的機理研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2008年

5 王勇;家蠶bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定及其基因的電子克隆[D];江蘇大學(xué);2008年

6 汪金榮;一個人類睪丸特異表達(dá)新基因-septin 12 transcript variant 2的克隆與功能初步研究[D];中南大學(xué);2007年

7 司紅起;小麥籽粒多酚氧化酶生化特性及其控制基因的研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

8 陳大福;蜜蜂（Apis mellifera）ant基因和vha16基因的克隆及其功能預(yù)測的生物信息學(xué)研究[D];浙江大學(xué);2004年

9 吳金華;小麥—黑麥抗白粉病衍生系遺傳分析及其相關(guān)基因差異表達(dá)與克隆[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

10 賈晉;大白菜和蘿卜敗蕾相關(guān)基因的差異表達(dá)及克隆研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 王冠男;玉米促絲裂原活化蛋白激酶家族基因的電子克隆及生物信息學(xué)分析[D];東北師范大學(xué);2010年

2 鄭鵬;棉花TRIPTYCHON基因的電子克隆和功能初步驗證[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

3 姚偉;溫光敏雄性不育兩用系玉米葉片annexin蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析及其基因的電子克隆[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2012年

4 黃驥;水稻功能基因的電子克隆與鹽脅迫誘導(dǎo)cDNA文庫的構(gòu)建[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

5 楊堅;正常豬外周血淋巴細(xì)胞cDNA文庫部分EST序列的電子克隆及初步實驗驗證[D];廣西大學(xué);2006年

6 周國安;水稻耐鹽性的遺傳分析與耐鹽相關(guān)基因的克隆[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

7 羅洪林;大片吸蟲成蟲cDNA文庫的構(gòu)建及其表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）的研究[D];廣西大學(xué);2005年

8 郭志愛;小麥抗旱相關(guān)基因TaRab2和TaFer的克隆及分析[D];山西農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

9 鄭新欣;普通小麥編碼組蛋白H3基因的克隆與分析[D];首都師范大學(xué);2009年

10 張穎;東方巴貝斯蟲EST序列分析及其線粒體基因的測定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

，

本文編號：1523374