研究環(huán)狀RNA在重度子癇前期患者胎盤(pán)組織與正常胎盤(pán)組織中表達(dá)的差異性。選取重度子癇前期(sPE)患者、正常妊娠孕婦的胎盤(pán)組織各3例,應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)兩組樣本中環(huán)狀RNA的表達(dá)情況,使用miRanda軟件對(duì)篩選出的環(huán)狀RNA進(jìn)行miRNA靶基因預(yù)測(cè)。有3 007個(gè)環(huán)狀RNA在實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組中均有表達(dá),其中差異表達(dá)的環(huán)狀RNA共有89個(gè),包含44個(gè)上調(diào)基因和45個(gè)下調(diào)基因。多數(shù)篩選出的差異表達(dá)環(huán)狀RNA具有has-let-7、miR-100、miR-101、miR-103家族成員的結(jié)合位點(diǎn)。研究表明胎盤(pán)組織中環(huán)狀RNA的表達(dá)失調(diào)可能參與了sPE的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。

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共檢測(cè)出12000個(gè)circRNA,其中有3007個(gè)在對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組中均有表達(dá)(圖1)。比較這3007個(gè)circRNA,發(fā)現(xiàn)89個(gè)差異性表達(dá)的circRNA,其中上調(diào)的circRNA有44個(gè),下調(diào)的circRNA有45個(gè)(圖2)。上調(diào)和下調(diào)的circRNA差異倍數(shù)在5倍以上....

圖1circRNA的維恩圖表1上調(diào)/下調(diào)倍數(shù)前十的差異性表達(dá)circRNA基因名實(shí)驗(yàn)組readcount對(duì)照組readcountlog2FoldChangepvalhsa_circ₀0043831154.530000....

在篩選出的89個(gè)circRNA中,發(fā)現(xiàn)有75個(gè)circRNA具有has-let-7家族成員的結(jié)合位點(diǎn),與miR-100、miR-101、miR-103家族成員有結(jié)合位點(diǎn)的circRNA個(gè)數(shù)分別是49、53和65個(gè)。與這4種miRNA均有合位點(diǎn)的circRNA有40個(gè)。其中,hsa....

本文編號(hào)：4011525