基于RNA-seq技術(shù)對重度子癇前期孕婦胎盤組織差異性表達circRNA的研究
發(fā)布時間:2024-11-06 20:00
研究環(huán)狀RNA在重度子癇前期患者胎盤組織與正常胎盤組織中表達的差異性。選取重度子癇前期(sPE)患者、正常妊娠孕婦的胎盤組織各3例,應(yīng)用高通量測序技術(shù)檢測兩組樣本中環(huán)狀RNA的表達情況,使用miRanda軟件對篩選出的環(huán)狀RNA進行miRNA靶基因預(yù)測。有3 007個環(huán)狀RNA在實驗組與對照組中均有表達,其中差異表達的環(huán)狀RNA共有89個,包含44個上調(diào)基因和45個下調(diào)基因。多數(shù)篩選出的差異表達環(huán)狀RNA具有has-let-7、miR-100、miR-101、miR-103家族成員的結(jié)合位點。研究表明胎盤組織中環(huán)狀RNA的表達失調(diào)可能參與了sPE的發(fā)生發(fā)展過程。
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【部分圖文】:
本文編號:4011525
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共檢測出12000個circRNA,其中有3007個在對照組和實驗組中均有表達(圖1)。比較這3007個circRNA,發(fā)現(xiàn)89個差異性表達的circRNA,其中上調(diào)的circRNA有44個,下調(diào)的circRNA有45個(圖2)。上調(diào)和下調(diào)的circRNA差異倍數(shù)在5倍以上....
圖1circRNA的維恩圖表1上調(diào)/下調(diào)倍數(shù)前十的差異性表達circRNA基因名實驗組readcount對照組readcountlog2FoldChangepvalhsa<sub>c</sub>irc<sub>0</sub>0043831154.530000....
在篩選出的89個circRNA中,發(fā)現(xiàn)有75個circRNA具有has-let-7家族成員的結(jié)合位點,與miR-100、miR-101、miR-103家族成員有結(jié)合位點的circRNA個數(shù)分別是49、53和65個。與這4種miRNA均有合位點的circRNA有40個。其中,hsa....
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