目的:基于全外測序(WES)研究DNA損傷修復(fù)(DDR)通路相關(guān)基因在中國高級別漿液性卵巢癌病人中的突變情況。方法:本研究所需的漿液性卵巢癌組織標本均來自河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院。本課題共篩選12例高級別卵巢漿液性癌患者。首先從這12個患者的新鮮手術(shù)組織中提取DNA,然后使用安捷倫外顯子雜交捕獲試劑盒Aglient SureSelect Human All Exon V6進行全外捕獲,之后在Illumina-NovaSeq 6000測序平臺上進行全外測序。下機數(shù)據(jù)質(zhì)控合格后,同時使用panel of normals(PON)方案,再利用Knijnenburg等人的276基因目錄篩選出每個樣本中發(fā)生突變的DDR相關(guān)基因。結(jié)果:1.獲得了12個高級別漿液性卵巢癌患者的WES測序數(shù)據(jù),平均測序深度200x。2.高級別漿液性卵巢癌突變基因主要的突變形式是錯義突變,其中主要是CT和TC。3.高級別漿液性卵巢癌的突變基因和細胞的各項生理活動均有關(guān),涉及WNT、NOTCH、Hippo等信號通路。分為兩類:一類是原癌基因的激活,如RTK-RAS以及PI3K信號通路;一類是抑癌基因的失活,如TP53、NOTCH、細胞周期等信號通路。4.DDR通路相關(guān)基因的突變特征和所有基因的突變特征一樣,突變形式以錯義突變?yōu)橹鳌Ｖ饕耐蛔兓蛴蠺P53、GEN1、HERC2、MSH3、BRCA1等。TP53的突變頻率高達75%,無熱點突變。5.高級別漿液性卵巢癌的突變基因間存在一定的相關(guān)性,TP53的突變和POLN、TOP3A是互斥的,而MSH3的突變和POLN和WRN是共突變的。結(jié)論:1.DDR通路相關(guān)基因的突變和高級別漿液性卵巢癌的發(fā)生關(guān)系密切。11例患者的HDR通路相關(guān)基因發(fā)生了突變,可能會受益于PRAP抑制劑。2.DDR通路相關(guān)基因的突變可能與患者的突變負荷有關(guān)。3.高級別漿液性卵巢癌的DDR通路突變頻率較高基因是TP53、GEN1、HERC2、MSH3、BRCA1。4.高級別漿液性卵巢癌的基因突變存在相關(guān)性,TP53的突變和POLN、TOP3A是互斥的。而MSH3的突變和POLN和WRN是共突變的。但是本次樣本量較少,有待后期進一步的而研究。
【學位單位】：河北醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R737.31
【部分圖文】：

卵巢癌中最常發(fā)生異常的DNA損傷修復(fù)通路：同源重組修復(fù)通路和錯配修復(fù)通路；a.同源重組修復(fù)通路；b.錯配修復(fù)通路Fig.1ThetwoDDRpathwaysmostfrequentlyalteredinovariancancer:homologousrecombinationrepairandmis-matchrepair；

雜交捕獲流程

文庫構(gòu)建流程
【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前6條

1 郭奕斌;;基因診斷中測序技術(shù)的應(yīng)用及優(yōu)缺點[J];遺傳;2014年11期

2 華瑛;姚安梅;楊浩;;紫杉醇聯(lián)合順鉑或奈達鉑治療晚期卵巢癌臨床對比觀察[J];陜西醫(yī)學雜志;2013年11期

3 張得芳;馬秋月;尹佟明;夏濤;;第三代測序技術(shù)及其應(yīng)用[J];中國生物工程雜志;2013年05期

4 錢帥偉;漆正堂;支彩霞;丁樹哲;;抑癌基因p53與細胞自噬[J];生命的化學;2011年05期

5 尤宗兵,郭燕燕,溫宏武,付學文,章小維,曹蘭萍,曹澤毅;人卵巢癌p53基因5～8外顯子的突變及其臨床意義[J];中華婦產(chǎn)科雜志;1996年11期

6 冷金花，郎景和，郭麗娜，沈鏗，許秀英;卵巢子宮內(nèi)膜樣癌p53抑癌基因蛋白的表達[J];中華婦產(chǎn)科雜志;1995年11期

本文編號：2867809