基于定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的肥胖多囊卵巢綜合征患者血清差異蛋白生物信息學(xué)分析
【學(xué)位單位】:廣州醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R711.75
【部分圖文】:
圖 3. 高 pH 反相色譜分離肽段2.8 質(zhì)譜分析:一維色譜分離的多肽樣品經(jīng)離心干燥后,重新溶解于25 μL的0.1%甲酸/2%乙腈/98%水溶液中,取10 μL樣品在Eksigent nanoLC-Ultra 二維納升液相色譜系統(tǒng)并聯(lián)合TripleTOF 5600 plus質(zhì)譜系統(tǒng)進(jìn)行分析。首先加樣品至納升流量的捕集柱(3 μm, 120 )上,上樣泵以A液(0.1%甲酸/2%乙腈/98%水溶液)流速為3.0 μL/min進(jìn)行脫鹽10分鐘,然后以B液(0.1%甲酸/2%水/98%乙腈溶液)溶液進(jìn)行梯度洗脫,同時(shí)進(jìn)行質(zhì)譜掃描分析。液相洗脫梯度為70分鐘內(nèi)線性梯度B液從5-40%,(分析柱為75 μm×15 cm ,C18-3 μm 120 , ChromXP Eksigent 公司)。質(zhì)譜參數(shù)設(shè)置為:納噴電壓為2.5 kV,霧化氣5 psi,氣簾氣35 psi,離子源加熱溫度為150℃,質(zhì)譜掃描方式為IDA掃描模式,掃描范圍為400-1250 m/z,一級(jí)掃描累加250毫秒,一次一級(jí)質(zhì)譜掃描最多選取30個(gè)母離子進(jìn)行二級(jí)質(zhì)譜分析,累計(jì)
廣州醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文3.2 四組樣品高豐度蛋白去除效果高豐度蛋白去除效果如圖示(圖 4),與原始血清 A(肥胖 PCOS 組)、B(正常對照組)、C(非肥胖 PCOS 組)、D(肥胖正常對照組)相比,四組樣品 A-de、B-de、C-de、D-de 的高豐度蛋白去除效果顯著,考馬斯亮藍(lán)染色可見多條新出現(xiàn)的蛋白條帶。
第一部分 多囊卵巢綜合征患者血清的定量蛋白組學(xué)檢測結(jié)果驗(yàn)共定性鑒定了 1690 個(gè)蛋白質(zhì),其中有定量信息的蛋白質(zhì)為 343 個(gè)果 P 值與定性鑒定蛋白質(zhì)分布火山圖(圖 5)可以看出,四組樣品定量結(jié)果數(shù)目約占 50%左右,在 P<0.0001 的結(jié)果為 30%左右,表明結(jié)果良好。1Volcano Plot ‐ All Ratios, All Proteins
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