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高齡合并妊娠期糖尿病孕婦腸道菌群的分布特點(diǎn)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-25 01:18
【摘要】:研究背景及目的妊娠期糖尿病(GDM)是圍產(chǎn)期常見(jiàn)的并發(fā)癥,與早產(chǎn)、胎兒死亡、巨大兒、母嬰遠(yuǎn)期2型糖尿病等多種不良結(jié)局相關(guān),發(fā)病率有逐漸上升的趨勢(shì)。GDM為一種妊娠期代謝性疾病,GDM孕婦表現(xiàn)出胰島素分泌不足、胰島素敏感性下降、糖代謝異常等病理生理改變。高齡是GDM的高危因素之一,高齡孕婦(AMA)發(fā)生GDM等代謝性疾病的幾率顯著升高。研究發(fā)現(xiàn),腸道菌群及其代謝產(chǎn)物等的變化伴隨或促進(jìn)人體能量代謝的改變,腸道菌群失調(diào)與糖尿病、血脂異常等代謝性疾病密切相關(guān)。年齡與菌群的相互影響,可能是GDM發(fā)生與發(fā)展的影響因素之一。本研究旨在借助16S rRNA測(cè)序,研究GDM孕婦腸道菌群變化,尤其是高齡合并GDM孕婦的腸道菌群特點(diǎn)。研究方法1.妊娠期糖尿病患者腸道菌群變化采集在2017年12月到2018年8月期間,于南方醫(yī)科大學(xué)附屬南方醫(yī)院產(chǎn)檢孕婦的糞便標(biāo)本,并收集相關(guān)臨床資料,按OGTT結(jié)果分為GDM組和非糖尿病(non-GDM)組。提取糞便標(biāo)本總DNA,16S rRNA擴(kuò)增V4基因,通過(guò)Illumina平臺(tái)測(cè)序,進(jìn)行生物信息學(xué)分析與統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,分析GDM組與non-GDM組腸道菌群特征與差異。2.妊娠期糖尿病患者中高齡孕婦腸道菌群變化將第一部分研究中GDM孕婦,按預(yù)產(chǎn)期時(shí)滿35周歲為界,將其分為AMA組和NMA組,通過(guò)Illumina平臺(tái)測(cè)序,進(jìn)行生物信息學(xué)分析與統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,分析兩組腸道菌群的特征和差異。研究結(jié)果1.妊娠期糖尿病患者腸道菌群變化1.1 共納入47例GDM患者和85例non-GDM孕婦,兩組孕婦的年齡、孕產(chǎn)次、胎數(shù)、血壓、血紅蛋白、血脂等臨床指標(biāo)無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。GDM孕婦孕前BMI(P=0.022)及孕期增重(P0.001)高于non-GDM,并且GDM組超重、肥胖患病率高(P=0.004),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,兩組圍產(chǎn)期BMI無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。1.2 GDM與non-GDM孕婦相比,與α多樣性有關(guān)的指標(biāo)如Shannon指數(shù)、Chaol指數(shù)、PD指數(shù)和observed OTUs值均無(wú)明顯差異。加權(quán)和非加權(quán)的PCoA分析中兩組患者均能在組內(nèi)聚類,在組間顯著區(qū)分,表明兩組的β多樣性上有顯著差異(P0.05)。在門水平上,GDM孕婦腸道中的厚壁菌門比例顯著降低,擬桿菌門、變形菌門比例顯著升高。在屬水平上Bacteroides、Prevotella、Faecalibacterium、、Megamonas、Lachnospira、Roseburia GDM婦腸道中的比例顯著增加。LEFSe結(jié)果提示,GDM組富集了更多的變形菌門,而non-GDM富集了更多的厚壁菌門。厚壁菌門-梭菌綱-梭菌目-瘤胃菌科為non-GDM中的特征菌。變形菌門-Y變形菌綱-腸桿菌目-腸桿菌科為GDM組中的特征菌。特征菌中厚壁菌門與圍產(chǎn)期HbA1c負(fù)相關(guān),與圍產(chǎn)期空腹血糖負(fù)相關(guān),瘤胃菌科與圍產(chǎn)期空腹血糖負(fù)相關(guān),變形菌門與圍產(chǎn)期空腹血糖正相關(guān)。2.妊娠期糖尿病患者中高齡孕婦腸道菌群變化2.1 GDM孕婦中,AMA孕婦23例,NMA孕婦24例。兩組的基礎(chǔ)情況指標(biāo)如胎數(shù)、血壓、血紅蛋白水平、血脂差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,體重相關(guān)指標(biāo),如孕前BMI、產(chǎn)前BMI、孕期增重差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2.2 AMA孕婦與正常年齡孕婦相比,Chao1指數(shù)、PD指數(shù)和observed OTUs等α多樣性相關(guān)指標(biāo)均顯著降低(P0.5),非加權(quán)的PCoA分析能在組內(nèi)聚類,在組間顯著區(qū)分,表明兩組的β多樣性上有顯著差異(P0.05)。在門水平上,AMA孕婦腸道中的厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門比例降低,放線菌門比例升高。LEFSe結(jié)果提示,δ-變形菌綱-脫硫弧菌科為AMA組特征菌,厚壁菌門、Y-變形菌綱為NMA組特征菌。特征菌中脫硫菌屬與圍產(chǎn)期HbA1c負(fù)相關(guān),顫螺旋菌屬與圍產(chǎn)期HbA1c負(fù)相關(guān)。研究結(jié)論GDM組與non-GDM組腸道菌群β多樣性存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,整體結(jié)構(gòu)不一致,糖尿病組中厚壁菌門豐度降低,擬桿菌門、變形菌門豐度升高,特征菌為富集于變形菌門。妊娠期糖尿病的發(fā)生、發(fā)展伴隨腸道菌群變化。GDM患者中,AMA腸道菌群豐度降低,與NMA腸道菌群的β多樣性存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,整體結(jié)構(gòu)不一致,其厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門豐度降低,梭桿菌門豐度升高,特征菌富集于δ變形菌綱。年齡因素通過(guò)影響腸道菌群的組成,在疾病的發(fā)生、發(fā)展中起著一定作用。孕婦的腸道菌群特征分析可作為潛在的篩查手段及治療靶點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R714.256
【圖文】:

曲線,曲線,序列數(shù),測(cè)序


并間接反映所檢測(cè)樣本中物種的豐富程度,當(dāng)曲線趨向平坦時(shí),提逡逑示更多的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的物種,測(cè)序數(shù)據(jù)量漸進(jìn)合理。以組為單位繪逡逑制Chaol邋(圖1-1)和Observed邋OTUs邋(圖1-2)兩種曲線,序列數(shù)目2000左右逡逑出現(xiàn)拐點(diǎn),X椉硬廡蟶疃齲咔饔諂交,达到平台期,禂莉列数村P保矗埃埃疤蹂義鮮本锏階畬蟛廡蟶疃。平台圃懩臭溨提示冀{黽有蛄惺倉(cāng)荒芊⑾稚倭烤義先骸K得髁階檠靜廡蟶疃瘸浞幀⒑俠,覆杆N蠖嗍鏤鎦鄭觳庋峰義銜鎦址岣懷潭茸鬩月愫笮難繡,冀{黽硬廡蚴,不钢\淠殼凹觳飩峁。辶x稀鰣澹牽模灣義希咤澹睿錚睿牽模灣義希保擔(dān)埃板澹義希靛義希義希渝澹保埃埃板危卞錘逡逑00邋2000邐4000邐6000邐8000邐10000邐12000邐14000逡逑Sequences邋Per邋Sample逡逑圖1-1邋Chaol稀釋曲線逡逑Figurel-1邋Chaol邋rarefaction邋measure逡逑13逡逑

曲線,曲線,擬桿菌,相對(duì)豐度


87個(gè)科,230個(gè)屬。發(fā)現(xiàn)GDM組與non-GDM在門水平的菌群組成逡逑差異不大,門水平相對(duì)豐度排在前三位均為:厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門,逡逑它們構(gòu)成超過(guò)95%邋(95.4%邋vs97.2%)的序列(表1-6、圖1-3)。厚壁菌門、擬桿逡逑菌門、變形菌門,它們構(gòu)成超過(guò)95%邋(95.4%邋vs97.2%)的序列。但相當(dāng)于逡逑non-GDM,邋GDM組中厚壁菌門比例更低(50.4%邋vs邋60.6%),擬桿菌門(36.1%逡逑vs邋32.3%)、變形菌門(8.9%邋vs邋4.3%)比例更高。逡逑表1-6邋GDM組與non-GDM組菌群門水平相對(duì)豐度組成情況逡逑Table邋\-6邋Relative邋abundance邋of邋main邋bacterial邋taxon邋on邋phylum邋level逡逑GDM%邋non-GDM%逡逑Firmicutes邐50.4邐60.6逡逑Bacteroidetes邐36.1邐32.3逡逑Proteobacteria邐8.9邐4.3逡逑Actinobac邋teria邐1.4邐1.1逡逑Verrucomicrobia邐1.4邐1.1逡逑others邐1.8邐0.6逡逑14逡逑

多樣性,秩和檢驗(yàn),指數(shù)


f3邐?.?■0??.>??0■.■§xjam>y?mi.>??i.O?m?'.*?>**ii?i.>io?jj逡逑圖1-4邋GDM與non-GDM組菌群屬水平堆積圖展示逡逑Figure邋1-4邋Stacked邋bar邋of邋bacteria邋on邋genus邋level逡逑3.2.3邋GDM組與non-GDM腸道菌群a多樣性分析逡逑a多樣性主要反映樣本的物種多樣性,所用指標(biāo)包括Chaol指數(shù)、observed逡逑species、Shannon指數(shù)和PD指數(shù)等。由于a多樣性分析所得數(shù)據(jù)并不滿足正逡逑態(tài)分布,因而采用K個(gè)相關(guān)樣品秩和檢驗(yàn)(Friedman秩和檢驗(yàn))。逡逑其中Chaol指數(shù)是根據(jù)Chaol算法來(lái)估計(jì)樣本中所含OTU數(shù)目

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