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多組學(xué)用于卵巢癌發(fā)展、凋亡、調(diào)控、新分類方式探索及相關(guān)靶點及信號通路研究

發(fā)布時間:2020-08-21 18:11
【摘要】:研究目的:本課題利用采用小分子藥物、非編碼RNA序列及多組學(xué)方法,探索卵巢癌發(fā)展的相關(guān)調(diào)控因素,并根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫的信息,對漿液性卵巢癌進行多組學(xué)分析,探索卵巢癌的調(diào)控機制、凋亡相關(guān)因素其核心目的是找到一種新的診斷和治療方法,可以優(yōu)化卵巢癌,這對更多的卵巢癌患者有益。研究方法①使用Arctigenin對上皮卵巢癌細胞系OVCAR3和SKOV3進行抑制實驗。用Ac-DEVD-CHO預(yù)處理卵巢癌細胞抑制了 caspase-3活性。轉(zhuǎn)染空載體或pcDNA3.1-Survivin的質(zhì)粒。使用Arctigenin直接干預(yù)所研究的細胞并使用穩(wěn)定而可靠的細胞凋亡檢測試劑盒分析細胞凋亡。Western blotting和ECL化學(xué)發(fā)光檢測系統(tǒng)檢測免疫反應(yīng)性復(fù)合物的結(jié)合;②利用成熟的實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR)用于檢測卵巢癌組織樣本中DARS-AS1的表達的程度。檢測DARS-AS1對卵巢癌增殖和轉(zhuǎn)移的影響,通過熒光素酶測定和RNA免疫沉淀(RIP)對潛在機制進行探索;③根據(jù)公共數(shù)據(jù)庫的599例漿液性卵巢癌患者的1203個樣品的DNA甲基化、蛋白質(zhì)、microRNA和基因表達情況采用無監(jiān)督分類算法進行分類,依據(jù)RNA-seq數(shù)據(jù)分成9個亞型,再將亞型與預(yù)后以及臨床因素之間進行關(guān)聯(lián)評估,并對基于不同組學(xué)數(shù)據(jù)整合的亞型進行關(guān)聯(lián)性評估。研究結(jié)果①基礎(chǔ)狀態(tài)時卵巢癌細胞存在iNOS高表達。與對照組相比,Arctigenin治療組中iNOS的表達水平比基線低2至4倍。與化學(xué)NO供體共孵育時,由Arctigenin誘導(dǎo)的STAT3磷酸化和Survivin表達受抑現(xiàn)象被逆轉(zhuǎn);外源性NO的加入可拮抗牛蒡子素誘導(dǎo)的卵巢癌細胞凋亡。②DARS-AS1在卵巢癌組織中的表達顯著高于癌旁組織。當DARS-AS1在卵巢癌細胞中沉默時,細胞增殖受到抑制,細胞遷移和侵襲能力也受到抑制。microRNA-532-3p是DARS-AS1在卵巢癌中的直接靶標。敲除DARS-AS1后,miR-532-3p表達上調(diào)。③(1)基于RNA-seq結(jié)果將SOC分為九個亞型,相關(guān)基因主要在以下四個生物學(xué)行為過程中聚集:免疫活性、激素代謝、間充質(zhì)發(fā)育和MAPK信號傳導(dǎo)過程中(2)基于DNA甲基化、蛋白質(zhì)和microRNA表達水平的結(jié)果根據(jù)甲基化差異分成四種亞型,根據(jù)蛋白質(zhì)陣列分成兩個聚類的NMF模型;根據(jù)microRNA表達水平發(fā)現(xiàn)六組高表達microRNA。(3)基于綜合通路確定了四個聚類的PAM模型。結(jié)果表明基于一個組學(xué)的數(shù)據(jù)集的亞型無法完全替代其他組學(xué)的數(shù)據(jù)。結(jié)論①Arctigenin可抑制卵巢癌細胞增殖。其作用機制是該藥物通過STAT3/Survivin信號系統(tǒng)誘導(dǎo)卵巢癌細胞中caspase-3依賴性細胞凋亡;②DARS-AS1通過捕捉卵巢癌miR-532-3p增強細胞增殖和轉(zhuǎn)移;③多組學(xué)的研究結(jié)果表明:基于一個組學(xué)的數(shù)據(jù)集的亞型無法完全替代其他組學(xué)的數(shù)據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R737.31
【圖文】:

卵巢癌,細胞凋亡


為了驗證Arctigenin誘導(dǎo)的0VCAR3和SK0V3細胞增殖抑制是否因凋亡逡逑誘導(dǎo)所致,所以使用annexin-V結(jié)合試驗用于評估用Arctigenin處理的卵巢逡逑癌細胞0VCAR3和SK0V3的細胞凋亡。如圖2邋A所示,0VCAR3細胞添加逡逑Arctigenin后,使annexin-邋V+凋亡百分比增加4倍,SK0V3細胞凋亡百分逡逑比增加6倍(相對于未處理的對照組,p[0.邋05)。邋Western印跡分析的結(jié)果進逡逑—步證實了與未處理對照相比給予Arctigenin。邋卵巢癌0VCAR3和SK0V3逡逑細胞中caspase-3裂解顯著增加(圖2邋B)。邐為了證明castiase-3激活參與逡逑牛蒡子素誘導(dǎo)的細胞凋亡,采用Ac-邋DEVD-邋CH0對卵巢癌0VCAR3和SK0V3細逡逑胞進行2小時的預(yù)處理,然后給予Arctigenin。最終成效非常明顯,用Ac-逡逑DEVD-CH0預(yù)處理的卵巢癌0VCAR3和SK0V3細胞系,其Arctigenin誘導(dǎo)的逡逑細胞凋亡過程均被阻斷(圖2邋C)。逡逑-60-逡逑

信號傳導(dǎo),蛋白質(zhì)印跡分析,卵巢癌,持續(xù)降低


為了確定Arctigenin對STAT3激活的影響作用,我們使用蛋白質(zhì)印跡分析逡逑檢測了邋STAT3的枺酸化水平。結(jié)果顯示,與未給予Arctigenin的對照組相比,逡逑Arctigenin抑制殘基Y705處STAT3的枺酸化(圖3A)。給予Arctigenin處理逡逑后,Survivin的蛋白濃度持續(xù)降低(圖3B)。隨后,我們檢測了邋STAT3/Survivin逡逑信號傳導(dǎo)系統(tǒng)的失活是否因Aixt邋igenin誘導(dǎo)的0VCAR3和SK0V3細胞凋亡所致。逡逑如圖3C所示,使用表達Survivin質(zhì)粒進行預(yù)轉(zhuǎn)染明顯(p邋<0.05)阻斷了給予逡逑Arctigenin后引起的卵巢癌0VCAR3和SK0V3細胞的凋亡過程。逡逑A邐OVCAR3邐SKOV3邐^邐1邐_0VCAR3逡逑…邋"邋丨.;邐r—邋邐邋卜邐,邐O邋SKW3逡逑CwW邐Control邋Arrngmm邋<邐f邋!逡逑,swac^n[^r|邐I邐1'邐■邋■逡逑邐邐邋^邋°-s,邋I邋.邐!邋*逡逑STAT3邋mmm邋mwm邋mmmm邋mum邐m邐f邐mIM邋1逡逑邐邐t邐邐邐邋眾邋q邋i-jm—...:,.、urm一._*逡逑Control邋Arctigenin逡逑B邐0

本文編號:2799695

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