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孕早期自然流產(chǎn)胎兒的染色體拷貝數(shù)變異與所在宮內(nèi)環(huán)境菌群的關(guān)聯(lián)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-06 01:46
【摘要】:目的:1.評(píng)估CNVplex高通量染色體拷貝數(shù)檢測(cè)技術(shù)對(duì)孕早期自然流產(chǎn)的遺傳學(xué)診斷價(jià)值,并建立流產(chǎn)組織遺傳學(xué)檢測(cè)方案;2.對(duì)流產(chǎn)組織進(jìn)行菌群多樣性分析,探討其與自然流產(chǎn)之間的關(guān)系;3.探索胎兒染色體拷貝數(shù)檢測(cè)結(jié)果與宮內(nèi)菌群多樣性的相關(guān)性。方法:1.對(duì)196例自然流產(chǎn)患者的絨毛組織樣本同時(shí)進(jìn)行染色體G顯帶核型分析與CNVplex染色體拷貝數(shù)檢測(cè),并采用STR技術(shù)進(jìn)行母體細(xì)胞污染的鑒定。2.提取上述病例中52例患者的流產(chǎn)絨毛組織DNA,通過(guò)細(xì)菌16s rDNA測(cè)序進(jìn)行菌群多樣性分析;3.按染色體拷貝數(shù)正常和異常將樣本分為兩組,進(jìn)行菌群分析和比較。結(jié)果:1.CNVplex檢測(cè)成功194例(檢測(cè)成功率98.98%),G顯帶核型分析檢測(cè)成功175例(檢測(cè)成功率89.29%)。在175例二組方法都檢測(cè)成功的樣本中有10例結(jié)果不符,其中有2例多倍體、2例低比例嵌合未被CNVplex技術(shù)檢出;1例核型為易位型22三體而CNVplex僅顯示為22三體;5例CNVplex顯示為染色體部分片段拷貝數(shù)異常的樣本染色體核型結(jié)果正;虿幻鞔_。CNVplex技術(shù)的異常檢出率與染色體核型分析無(wú)顯著差異,檢測(cè)成功率和準(zhǔn)確率均優(yōu)于核型分析,但對(duì)多倍體和染色體易位由于技術(shù)原理所限無(wú)法檢出;2.流產(chǎn)絨毛組織中的主要菌門為變形菌門和厚壁菌門,腸桿菌科占主要優(yōu)勢(shì),菌群整體多樣性和豐度均較低;3.胎兒染色體拷貝數(shù)正常組和異常組的菌群結(jié)構(gòu)在門層次和屬層次共有19個(gè)類群存在顯著差異,但在整體菌群組成未見明顯差異。結(jié)論:1.對(duì)流產(chǎn)組織的遺傳學(xué)檢測(cè)而言,傳統(tǒng)染色體核型分析技術(shù)與CNVplex結(jié)合STR技術(shù)的聯(lián)合應(yīng)用能得到更為準(zhǔn)確和更具指導(dǎo)意義的檢測(cè)報(bào)告,適合臨床推廣應(yīng)用;2.自然流產(chǎn)組織的菌群群落結(jié)構(gòu)的多樣性和豐度均較低,主要以腸桿菌科為主;3.胎兒染色體拷貝數(shù)變異與宮內(nèi)低豐度的菌群構(gòu)成存在一定相關(guān)性。
【圖文】:

檢測(cè)結(jié)果,樣本,核型分析


圖 1 母體細(xì)胞污染樣本 STR 檢測(cè)結(jié)果Fig1 The result of maternal cell contamination by STR1.2.3 兩種方法結(jié)果比較核型分析與 CNVplex 的檢測(cè)結(jié)果比較見表 1。在結(jié)構(gòu)異常檢出率方面,兩者存在顯著差異(P<0.05),在檢測(cè)成功率方面,兩種方法具有高度顯著的差異(P<0.001)。培養(yǎng)失敗的 21 例樣本中,CNVplex 的檢測(cè)結(jié)果顯示其中 11 例為數(shù)目異常,3 例為結(jié)構(gòu)異常,2 例檢測(cè)失敗,其余 5 例未見拷貝數(shù)異常。在應(yīng)用兩種方法都獲得結(jié)果的 175 例樣本中,結(jié)果不一致的共 10 例(表 2)。表 2 結(jié)果不一致樣本Tab 2 Inconsistent results during the two testing樣本號(hào) 核型分析 CNVplex

檢測(cè)結(jié)果,樣本,核型,染色體結(jié)


1.1p36.12×1,16p13.3×3,16p13.2×114C0780 46,XX46,XX.rsa 18q21.32×3,18q22.2×3,18q23×114C0800 46,XX46,XX.rsa 1p36.33×1,1p36.22×1,1q42.13×3,1q43×3,1q44×315C0319 46,XX46,XX,rsa 10q26.13×1,10q26.3×1,14q31.3×3,14q32.2×3,14q32.33×31.2.4 對(duì)結(jié)果不一致病例的進(jìn)一步研究第一例樣本 14C0689,患者 24 歲,G3P0,不良孕史。流產(chǎn)組織染色體核型結(jié)果 為 46,XX,der(8)? ( 圖 2A ) , CNVplex 結(jié) 果 為 46,XX.rsa6q13*3,6q25.1*3,6q25.3*3,6q27*3,8p23.3*1,8p23.1*1(圖 2B)。后對(duì)患者進(jìn)行隨訪,,父母雙方進(jìn)行外周血染色體檢查,結(jié)果顯示父親染色體結(jié)果正常,母親為平衡易位攜帶者,核型為 46,XX,t(6;8)(q13;p23.1)(圖 2C),與絨毛染色體核型與 CNVplex檢測(cè)結(jié)果相符。
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R714.21

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2698952

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