【摘要】：目的:1.評估CNVplex高通量染色體拷貝數(shù)檢測技術(shù)對孕早期自然流產(chǎn)的遺傳學(xué)診斷價值,并建立流產(chǎn)組織遺傳學(xué)檢測方案;2.對流產(chǎn)組織進(jìn)行菌群多樣性分析,探討其與自然流產(chǎn)之間的關(guān)系;3.探索胎兒染色體拷貝數(shù)檢測結(jié)果與宮內(nèi)菌群多樣性的相關(guān)性。方法:1.對196例自然流產(chǎn)患者的絨毛組織樣本同時進(jìn)行染色體G顯帶核型分析與CNVplex染色體拷貝數(shù)檢測,并采用STR技術(shù)進(jìn)行母體細(xì)胞污染的鑒定。2.提取上述病例中52例患者的流產(chǎn)絨毛組織DNA,通過細(xì)菌16s rDNA測序進(jìn)行菌群多樣性分析;3.按染色體拷貝數(shù)正常和異常將樣本分為兩組,進(jìn)行菌群分析和比較。結(jié)果:1.CNVplex檢測成功194例(檢測成功率98.98%),G顯帶核型分析檢測成功175例(檢測成功率89.29%)。在175例二組方法都檢測成功的樣本中有10例結(jié)果不符,其中有2例多倍體、2例低比例嵌合未被CNVplex技術(shù)檢出;1例核型為易位型22三體而CNVplex僅顯示為22三體;5例CNVplex顯示為染色體部分片段拷貝數(shù)異常的樣本染色體核型結(jié)果正�；虿幻鞔_。CNVplex技術(shù)的異常檢出率與染色體核型分析無顯著差異,檢測成功率和準(zhǔn)確率均優(yōu)于核型分析,但對多倍體和染色體易位由于技術(shù)原理所限無法檢出;2.流產(chǎn)絨毛組織中的主要菌門為變形菌門和厚壁菌門,腸桿菌科占主要優(yōu)勢,菌群整體多樣性和豐度均較低;3.胎兒染色體拷貝數(shù)正常組和異常組的菌群結(jié)構(gòu)在門層次和屬層次共有19個類群存在顯著差異,但在整體菌群組成未見明顯差異。結(jié)論:1.對流產(chǎn)組織的遺傳學(xué)檢測而言,傳統(tǒng)染色體核型分析技術(shù)與CNVplex結(jié)合STR技術(shù)的聯(lián)合應(yīng)用能得到更為準(zhǔn)確和更具指導(dǎo)意義的檢測報告,適合臨床推廣應(yīng)用;2.自然流產(chǎn)組織的菌群群落結(jié)構(gòu)的多樣性和豐度均較低,主要以腸桿菌科為主;3.胎兒染色體拷貝數(shù)變異與宮內(nèi)低豐度的菌群構(gòu)成存在一定相關(guān)性。
【圖文】：

圖 1 母體細(xì)胞污染樣本 STR 檢測結(jié)果Fig1 The result of maternal cell contamination by STR1.2.3 兩種方法結(jié)果比較核型分析與 CNVplex 的檢測結(jié)果比較見表 1。在結(jié)構(gòu)異常檢出率方面，兩者存在顯著差異（P＜0.05），在檢測成功率方面，兩種方法具有高度顯著的差異（P＜0.001）。培養(yǎng)失敗的 21 例樣本中，CNVplex 的檢測結(jié)果顯示其中 11 例為數(shù)目異常，3 例為結(jié)構(gòu)異常，2 例檢測失敗，其余 5 例未見拷貝數(shù)異常。在應(yīng)用兩種方法都獲得結(jié)果的 175 例樣本中，結(jié)果不一致的共 10 例（表 2）。表 2 結(jié)果不一致樣本Tab 2 Inconsistent results during the two testing樣本號 核型分析 CNVplex

1.1p36.12×1,16p13.3×3,16p13.2×114C0780 46,XX46,XX.rsa 18q21.32×3,18q22.2×3,18q23×114C0800 46,XX46,XX.rsa 1p36.33×1,1p36.22×1,1q42.13×3,1q43×3,1q44×315C0319 46,XX46,XX,rsa 10q26.13×1,10q26.3×1,14q31.3×3,14q32.2×3,14q32.33×31.2.4 對結(jié)果不一致病例的進(jìn)一步研究第一例樣本 14C0689，患者 24 歲，G3P0，不良孕史。流產(chǎn)組織染色體核型結(jié)果 為 46,XX,der(8)? （ 圖 2A ） ， CNVplex 結(jié) 果 為 46,XX.rsa6q13*3,6q25.1*3,6q25.3*3,6q27*3,8p23.3*1,8p23.1*1（圖 2B）。后對患者進(jìn)行隨訪，，父母雙方進(jìn)行外周血染色體檢查，結(jié)果顯示父親染色體結(jié)果正常，母親為平衡易位攜帶者，核型為 46,XX,t(6;8)(q13;p23.1)（圖 2C），與絨毛染色體核型與 CNVplex檢測結(jié)果相符。
【學(xué)位授予單位】：上海交通大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R714.21

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2698952