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失衡數(shù)據(jù)情況下成團(tuán)細(xì)胞圖像合成與分類

發(fā)布時(shí)間:2020-04-26 00:36
【摘要】:近年來全球范圍內(nèi)宮頸癌的發(fā)病率呈逐年上升趨勢,已經(jīng)成為威脅婦女生命的社會問題。DNA倍體分析技術(shù)是近年來應(yīng)用到細(xì)胞病理學(xué)自動閱片技術(shù)。有效的將病理學(xué)專家的診斷經(jīng)驗(yàn)與計(jì)算機(jī)的精確計(jì)算和快速處理能力結(jié)合起來,實(shí)現(xiàn)對宮頸細(xì)胞圖像的識別和診斷。該技術(shù)首先采集人體細(xì)胞標(biāo)本,并對細(xì)胞DNA染色,然后將細(xì)胞置于顯微鏡下,通過高分辨率相機(jī)拍攝得到細(xì)胞核圖片。采用模型訓(xùn)練方法,將細(xì)胞核圖像進(jìn)行分類并識別各類細(xì)胞核,然后采用圖像處理技術(shù)測量細(xì)胞DNA的相對含量。最后將異常的細(xì)胞羅列出來,輔助醫(yī)生診斷。然而異常細(xì)胞大多數(shù)存在于重疊細(xì)胞團(tuán),所以對于DNA倍體系統(tǒng),準(zhǔn)確識別出重疊細(xì)胞核至關(guān)重要。由于采集到的標(biāo)本中重疊細(xì)胞核種類繁多,收集大量重疊細(xì)胞核費(fèi)時(shí)費(fèi)力,這使得成團(tuán)細(xì)胞核的訓(xùn)練圖片數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于其他類別的圖片數(shù)量,導(dǎo)致訓(xùn)練數(shù)據(jù)失衡問題。然而大多數(shù)分類器學(xué)習(xí)算法對于不平衡數(shù)據(jù)分類效果并不理想,解決訓(xùn)練數(shù)據(jù)失衡問題對DNA倍體系統(tǒng)有重大意義。為解決上述問題,本文提出了失衡數(shù)據(jù)情況下成團(tuán)細(xì)胞圖像合成與分類方法。本文工作包括以下幾個方面:1.提出了一種基于余弦不變性的源細(xì)胞圖像選擇方法。該方法首先提取細(xì)胞圖像的特征值,然后基于特征空間利用余弦不變性原理,挑選有代表性的單細(xì)胞圖像用來合成大量成團(tuán)細(xì)胞圖像。當(dāng)樣本間形成的角度小于定義的閥值時(shí),只有一個輸入樣本被接受用于作為合成細(xì)胞圖像的原始材料,增加了合成數(shù)據(jù)樣本的多樣性。2.提出了基于隨機(jī)性的成團(tuán)細(xì)胞圖像合成方法。首先源細(xì)胞圖經(jīng)過旋轉(zhuǎn),分割后等處理,用兩張圖片圖合成新的成團(tuán)細(xì)胞核圖片。為了使合成的細(xì)胞盡可能地接近真實(shí),主要考慮了三個方面的問題。為了確保合成的細(xì)胞具有代表性,我們對單細(xì)胞進(jìn)行篩選,獲得典型的單細(xì)胞圖像用于合成。為了避免合成的數(shù)據(jù)在樣本空間過度聚集,在細(xì)胞的旋轉(zhuǎn)角度和重疊程度兩個方面引入和隨機(jī)性。為使重疊部分真實(shí),對重疊部分像素需要進(jìn)行重構(gòu)。3.提出了一種基于主動學(xué)習(xí)的合成重疊細(xì)胞圖像選擇方法。該方法首先將大量樣本分為多個樣本簇,增加主動選擇樣本的效率;其次根據(jù)兩條選擇標(biāo)準(zhǔn)來選擇訓(xùn)練樣本,即代表性和不確定性;然后在循環(huán)迭代過程中對每一個樣本簇進(jìn)行神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練,來選擇代表性訓(xùn)練樣本;最終將選擇出的所有成團(tuán)細(xì)胞圖像和單細(xì)胞圖像,用于模型訓(xùn)練。實(shí)驗(yàn)表明,向小類樣本類別加入合成重疊成團(tuán)細(xì)胞后,在多種分類器上都取得了識別率的提升。本文方法能用于不平衡數(shù)據(jù)處理問題上,當(dāng)小類樣本數(shù)據(jù)量過少無法讓分類器學(xué)習(xí)充分時(shí),有效合理的合成所需的細(xì)胞圖像,模擬重疊細(xì)胞團(tuán)的紋理、灰度、形狀、大小等特征,使分類器更加充分全面的學(xué)習(xí)小類樣本特征。最終結(jié)合主動學(xué)習(xí)方法來選擇質(zhì)量高的成團(tuán)細(xì)胞圖像,讓模型學(xué)習(xí)的更好并大大的提高了分類器對細(xì)胞圖像的識別率。
【圖文】:

上皮細(xì)胞,工程碩士學(xué)位,細(xì)胞圖片,論文量


哈爾濱理工大學(xué)工程碩士學(xué)位論文量較大的樣本進(jìn)行模型訓(xùn)練。析系統(tǒng)需要將細(xì)胞核圖像進(jìn)行分類,如何分類類別圖片處理方式不同,因此需要對細(xì)胞圖片需要精細(xì),但也要保證所有相似的樣本被分為胞的難度。鑒于以上幾點(diǎn),考慮本文將細(xì)胞分胞,單個非典型上皮細(xì)胞,兩個上皮細(xì)胞,3 ,淋巴細(xì)胞和固縮核,單個中心粒細(xì)胞,兩個像如下圖:

合成過程


哈爾濱理工大學(xué)工程碩士學(xué)位論文成。由于使用的是均勻產(chǎn)生隨機(jī)數(shù)的方法,生成的新圖片不集。通過實(shí)驗(yàn)證明,引入隨機(jī)性后分類器的正確識別率會高一避免合成數(shù)據(jù)偏向固定分布,通過線性同余法生成均勻隨機(jī)式如下: /,1,2,...(mod)1xMnxxcMnnnn 值,其中 的含義為乘子, c 的含義為增量, M 的含義為模胞合成算法以用單個細(xì)胞核和 3 重疊細(xì)胞團(tuán)合成 4 重疊細(xì)胞團(tuán)的例子來成方法。經(jīng)過旋轉(zhuǎn),分割提取輪廓,,兩細(xì)胞區(qū)域靠近的方式團(tuán)。圖 4-2 為合成過程:
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R737.33;TP391.41;TP181

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本文編號:2640878

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