高級(jí)別漿液性卵巢癌侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)lncRNA的篩選及鑒定
【圖文】:
3 結(jié) 果3.1lncRNA在 HGSOC中的差異表達(dá)譜首先,我們采用 ArraystarHumanLncRNAs芯片檢測(cè)了來自 3例來自 HGSOC患者的配對(duì)卵巢癌原發(fā)灶組織和大網(wǎng)膜轉(zhuǎn)移灶組織的 lncRNA差異表達(dá)譜分布(圖3.1A)。通過芯片篩選共獲得 18617個(gè)差異性表達(dá)的 lncRNA,其中 OMTs相對(duì)于POCTs表達(dá)上調(diào)的 lncRNA37個(gè)(fold-change>2;p<0.05),,表達(dá)下調(diào)的 lncRNA22個(gè)(fold-change,>2;p<0.05)(圖 3.1B)。經(jīng)篩選,我們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)從未被報(bào)導(dǎo)過的lncRNACTD-2020K17.1,其表達(dá)上調(diào)最為顯著,且被收錄于 Gencodedatabase數(shù)據(jù)庫中。
6表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖(co-expressionnetworkofcoding-non-codinggenes計(jì)算在 HGSOC中差異表達(dá)的 lncRNA和 mRNA之間的 Pearson相圖所示(圖 3.2),共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖列舉了 15個(gè)與 lncRNACTD-2020潛在的靶基因,通過 pubmed數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn),其中一個(gè)基因 CA襲轉(zhuǎn)移緊密相關(guān),然而 CARD11與目的 lncRNA二者間具體的相互的分子機(jī)制有待進(jìn)一步深入的探究。
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R737.31
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本文編號(hào):2610726
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