ctDNA用于卵巢癌診斷的臨床價值初步研究
發(fā)布時間:2020-03-31 18:37
【摘要】:目的:通過檢測不同病理類型卵巢惡性腫瘤及卵巢良性腫瘤患者手術(shù)前循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)染色體失衡水平,并與健康對照組對比,惡性腫瘤組血漿結(jié)果與相應(yīng)腫瘤組織中的染色體失衡狀況相比對,探討ctDNA在卵巢惡性腫瘤術(shù)前診斷及鑒別診斷方面的臨床價值。材料和方法:我們選取了自2016年1月1日起至2017年12月31日為止,收治于青島市市立醫(yī)院婦科中心病區(qū)的28名卵巢惡性腫瘤者、36名卵巢良性腫瘤患者以及4名交界性卵巢腫瘤患者的相關(guān)臨床資料。同時選取同期于青島市市立醫(yī)院進行健康查體的34例健康女性采集靜脈血,作為對照組。所有患者均于術(shù)前采集靜脈血液8ml,提取血漿后采用二代全基因組測序(WGS)方法測定ctDNA染色體失衡現(xiàn)象;并于術(shù)中采集患者卵巢腫瘤標(biāo)本,同樣方法進行測序,最后分析生物學(xué)信息并采用Cscore模型為ctDNA檢測結(jié)果賦值。比較惡性腫瘤組與良性腫瘤組、健康對照組ctDNA染色體失衡情況,比較惡性腫瘤組ctDNA與組織DNA染色體失衡的一致性,分析不同病理類型腫瘤組的Cscore分布,繪制惡性腫瘤組與健康對照組診斷的ROC曲線,及與良性腫瘤組鑒別診斷的ROC曲線。結(jié)果:惡性組82.14%(23/28)檢測出明顯的染色體失衡,且不局限于一條染色體,尤其對于高級別漿液性卵巢癌(HGSC),檢測陽性率達100%(18/18);交界性腫瘤存在0-3條不等染色體失衡;良性腫瘤組4例檢出1-2條染色體失衡;健康組未檢測到染色體失衡。通過對惡性腫瘤組ctDNA和組織DNA檢測結(jié)果對比,提示了兩者之間的高度一致性。對所有腫瘤按照病理類型進行Cscore比較,結(jié)果提示HGSC組Cscore明顯高于其他組別。通過Cscore正序排列,可以清楚地區(qū)分惡性腫瘤組與健康對照組,且得分最高的10例均為HGSC。利用Cscore數(shù)值繪制受試者工作特征曲線(ROC),計算曲線下面積AUC,用于評估該模型的診斷效能。HGSC與健康組對照,AUC為1.000。所有惡性腫瘤與健康組對照,AUC為0.8929。惡性腫瘤+交界性腫瘤組與健康組對照,AUC為0.8906。在卵巢腫瘤的良惡性鑒別診斷試驗中,如果不區(qū)分組織學(xué)亞型,采用所有惡性腫瘤樣本與良性組對比,AUC為0.8700;如果惡性腫瘤只采集HGSC的樣本與良性腫瘤樣本進行對比,AUC為0.9880。結(jié)論:1.卵巢惡性腫瘤樣本中ctDNA染色體失衡現(xiàn)象表現(xiàn)嚴(yán)重,尤其對于高級別漿液性卵巢惡性腫瘤(HGSC),此現(xiàn)象表現(xiàn)得更為突出。2.惡性腫瘤患者中ctDNA與腫瘤組織DNA染色體失衡呈現(xiàn)高度一致性,說明ctDNA是源自腫瘤組織的,攜帶有與腫瘤組織相一致的遺傳畸變信息,可能成為卵巢惡性腫瘤的標(biāo)志物。3.本研究應(yīng)用一種篩選模型,即Cscore評分,對卵巢惡性腫瘤進行了診斷和鑒別診斷,得到了相對理想的AUC,提示ctDNA可能在卵巢惡性腫瘤診斷和鑒別診斷方面具有一定的臨床參考價值,尚需進一步深入研究。
【圖文】:
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果1 各研究組 ctDNA 中的染色體失衡為了清楚地顯示不同組別的染色體失衡,對所有樣本計算每個染色體的 zscore,見圖 1。圖中,橫坐標(biāo)自左往右綠色區(qū)代表所有納入的卵巢惡性腫瘤患者,紫色區(qū)域代表4 例交界性卵巢腫瘤患者,明黃色區(qū)域代表 36 例卵巢良性腫瘤患者,枚紅色代表入組的 34 例健康對照個體。對于任意一條染色體 i,計算其 z score,若 z score 的絕對值(即|zChri|)小于 3,則定義為正常,即表示為底色淺灰色色塊;若 3<|zChri|<6,則定義為“輕度失衡”,圖中用藍色塊表示;若|zChri|>6,則定義為“重度失衡”。圖中用紅色塊表示。
圖 2 組織與外周血染色體失衡對比圖我們的結(jié)果顯示:①同一惡性腫瘤患者中,血漿染色體失衡與其腫瘤組織的檢測結(jié)果高度匹配;個別個體出現(xiàn)了腫瘤組織 DNA 染色體失衡檢出,而 ctDNA 檢測為陰性結(jié)果。上述結(jié)果提示:②在血漿中檢測到的染色體失衡的確起源于腫瘤部位。組織和血漿樣本之間的細(xì)微差異可能是由于血漿 ctDNA 降解,,腫瘤異質(zhì)性等引起的。3 各不同病理類型組 Cscore將入組研究對象按照各自病理類型進行分組,得到以下組別(見圖 3):(1)惡性組:高級別漿液性癌(HGSC)18 例、透明細(xì)胞癌(ClearCell)3 例、低級別漿液性癌(LGSC)3 例、轉(zhuǎn)移性癌(Metastatic)2 例和粘液性囊腺癌(CACM)1 例;(2)交界性組(Borderline)4 例;(3)良性組:子宮內(nèi)膜異位囊腫(EM)16 例、粘液性囊腺瘤(CAMO)6 例、畸胎瘤(Tera)11 例和其他良性腫瘤(Others)3 例。繪制盒圖(圖3)用以形象地表示所有不同病理類型中 ctDNA 計算所得 CScore。
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R737.31
本文編號:2609429
【圖文】:
青島大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果1 各研究組 ctDNA 中的染色體失衡為了清楚地顯示不同組別的染色體失衡,對所有樣本計算每個染色體的 zscore,見圖 1。圖中,橫坐標(biāo)自左往右綠色區(qū)代表所有納入的卵巢惡性腫瘤患者,紫色區(qū)域代表4 例交界性卵巢腫瘤患者,明黃色區(qū)域代表 36 例卵巢良性腫瘤患者,枚紅色代表入組的 34 例健康對照個體。對于任意一條染色體 i,計算其 z score,若 z score 的絕對值(即|zChri|)小于 3,則定義為正常,即表示為底色淺灰色色塊;若 3<|zChri|<6,則定義為“輕度失衡”,圖中用藍色塊表示;若|zChri|>6,則定義為“重度失衡”。圖中用紅色塊表示。
圖 2 組織與外周血染色體失衡對比圖我們的結(jié)果顯示:①同一惡性腫瘤患者中,血漿染色體失衡與其腫瘤組織的檢測結(jié)果高度匹配;個別個體出現(xiàn)了腫瘤組織 DNA 染色體失衡檢出,而 ctDNA 檢測為陰性結(jié)果。上述結(jié)果提示:②在血漿中檢測到的染色體失衡的確起源于腫瘤部位。組織和血漿樣本之間的細(xì)微差異可能是由于血漿 ctDNA 降解,,腫瘤異質(zhì)性等引起的。3 各不同病理類型組 Cscore將入組研究對象按照各自病理類型進行分組,得到以下組別(見圖 3):(1)惡性組:高級別漿液性癌(HGSC)18 例、透明細(xì)胞癌(ClearCell)3 例、低級別漿液性癌(LGSC)3 例、轉(zhuǎn)移性癌(Metastatic)2 例和粘液性囊腺癌(CACM)1 例;(2)交界性組(Borderline)4 例;(3)良性組:子宮內(nèi)膜異位囊腫(EM)16 例、粘液性囊腺瘤(CAMO)6 例、畸胎瘤(Tera)11 例和其他良性腫瘤(Others)3 例。繪制盒圖(圖3)用以形象地表示所有不同病理類型中 ctDNA 計算所得 CScore。
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R737.31
【參考文獻】
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1 K.C.Allen Chan;;Plasma Epstein-Barr virus DNA as a biomarker for nasopharyngeal carcinoma[J];Chinese Journal of Cancer;2014年12期
2 逄錦忠;欽倫秀;任寧;葉青海;莢衛(wèi)東;劉銀坤;湯釗猷;;肝細(xì)胞癌患者血漿循環(huán)DNA微衛(wèi)星變異的研究[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2006年24期
3 雷曉;余佩武;趙永亮;石彥;饒蕓;曾冬竹;吳淼;周立新;;CD4~+CD25~+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞在胃癌患者的表達及其臨床意義[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2006年05期
本文編號:2609429
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