【摘要】：背景及目的我國癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,近年來國內(nèi)卵巢癌的發(fā)病和死亡均居女性惡性腫瘤前十位。卵巢癌的死亡率逐年增高,這與其在早期臨床癥狀不明顯有關(guān)。目前關(guān)于卵巢癌的研究重點(diǎn)是如何早期發(fā)現(xiàn)和診斷,而生物標(biāo)志物是預(yù)測疾病風(fēng)險和進(jìn)展的關(guān)鍵一環(huán),可以提高卵巢癌的診斷精度,利于早期診斷。故而本文首先通過基因芯片研究篩選到了與卵巢癌有相關(guān)性的關(guān)鍵基因羥酰-CoA脫氫酶HADH和非受體酪氨酸激酶SRC,然后通過組織學(xué)實(shí)驗(yàn)檢測這兩個基因在卵巢癌患者腫瘤組織和相應(yīng)正常組織之間的差異,分析其表達(dá)含量和卵巢癌預(yù)后之間的關(guān)系,探討其作為卵巢癌預(yù)后和治療的分子標(biāo)志物的可能。方法利用生物信息學(xué)方法確定差異基因。從GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)數(shù)據(jù)庫下載并整理卵巢癌基因芯片數(shù)據(jù)。通過對差異表達(dá)基因進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,獲得差異基因。進(jìn)行基因本體論(Gene Ontology)分析和信號通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。最后利用Cytoscape對所有差異基因的編碼蛋白構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)。收集2013年6月至2015年6月青州市人民醫(yī)院婦科72例卵巢癌患者的腫瘤組織和相對應(yīng)的正常組織(距腫瘤邊緣=5cm)。使用Real-time PCR法檢測卵巢癌患者腫瘤組織與對應(yīng)正常組織中HADH和SRC的表達(dá)含量,結(jié)合患者的臨床信息,以SPSS19.0分析它們表達(dá)含量與卵巢癌患者臨床病理特征之間的關(guān)系。使用ROC曲線法,評價HADH和SRC的診斷價值,明確其針對卵巢癌患者的診斷臨界點(diǎn),并探討用ROC曲線法確定可疑值范圍。通過隨訪(截止時間為2017.12.31),分析HADH和SRC表達(dá)水平與患者生存預(yù)后之間的關(guān)系。結(jié)果經(jīng)過篩選與整理,將卵巢癌基因芯片GSE105437數(shù)據(jù)納入研究。篩選差異基因的限定條件為:p≤0.05,logFC≥2。卵巢癌基因芯片中共篩選出差異基因196個,其中上調(diào)基因149個,下調(diào)基因47個。生物信息學(xué)分析在這些差異基因中進(jìn)行。對所有差異基因進(jìn)行基因本體論富集分析,結(jié)果顯示差異基因富集B細(xì)胞增殖調(diào)節(jié)、細(xì)胞生長因子調(diào)節(jié)、化學(xué)致癌作用等因素與卵巢癌的發(fā)病相關(guān)。對這些差異基因功能的關(guān)系構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)。用Cytoscape分析差異基因蛋白之間的作用網(wǎng)絡(luò),得分前五位的基因有ALDH6A1、HADH、FYN、SRC和TNF,這些基因是可能與卵巢癌高度相關(guān)的關(guān)鍵基因。HADH和SRC分別在卵巢癌腫瘤組織中的表達(dá)明顯高于相應(yīng)的正常組織,其表達(dá)量的差異性具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.01)。HADH和SRC均與患者的年齡、腫瘤大小、病理類型無明顯關(guān)系(P0.05),而與患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況和TNM分期等有相關(guān)性(P0.05)。PFS曲線分析顯示:與相應(yīng)的低表達(dá)組相比,HADH和SRC高表達(dá)組的3年無進(jìn)展生存率明顯下降,具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。HADH和SRC的ROC曲線下面積分別為0.753和0.841,并有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05),說明這兩個基因可能有較高的診斷價值。結(jié)論HADH和SRC在卵巢癌腫瘤組織中的表達(dá)高于相應(yīng)正常組織;HADH和SRC高表達(dá)的卵巢癌往往分期晚,且預(yù)后不良;HADH和SRC與卵巢癌的發(fā)生發(fā)展存在相關(guān)性,有可能成為卵巢癌早期診斷和治療的分子標(biāo)志物。
【圖文】：

WH-868 型渦旋振蕩器 南京諾泰施格科學(xué)儀器有限公司DHG-9088A 型恒溫鼓風(fēng)干燥箱 上海般諾生物科技有限公司可調(diào)微量移液器 德國 Eppendorf 公司壓力蒸汽滅菌器 山東博科生物產(chǎn)業(yè)有限公司2 實(shí)驗(yàn)方法和步驟2.1 生物信息學(xué)登錄 GEO 數(shù)據(jù)庫，搜索并下載卵巢癌基因芯片數(shù)據(jù)，，見圖 1-2。數(shù)據(jù)集入選條件：（1）數(shù)據(jù)集屬于卵巢癌全基因 RNA 芯片；（2）實(shí)驗(yàn)取材人類卵巢癌患者組織與正常卵巢組織對照。在 GEO 數(shù)據(jù)庫中利用 GEO2R 進(jìn)行芯片數(shù)據(jù)分析，獲得差異表達(dá)基因，見圖 3。利用 DAVID 6.9（免費(fèi)在線工具，https：//david.ncifcrf.gov/tools.jsp）對 所 有 差 異 表 達(dá) 基 因 進(jìn) 行 Gene Ontology 富 集 分 析 和 信 號 通 路 富 集 分 析（KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）。最后利用 STRING[9]（http：//www.string-db.org）進(jìn)行差異基因編碼蛋白的相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI）的構(gòu)建。

在GEO數(shù)據(jù)庫下載卵巢癌芯片
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R737.31

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 秦穎;;經(jīng)陰道彩色多普勒超聲診斷卵巢腫瘤的價值分析[J];中國醫(yī)藥指南;2018年09期

2 顏嘉楣;;女性圍絕經(jīng)期健康大講堂(之四十三) 女性更年期常見病之十九——卵巢腫瘤[J];首都食品與醫(yī)藥;2017年03期

3 衛(wèi)張寧;;貓屎不光能沖咖啡,還能抗癌?![J];中國老年;2016年16期

4 呂春亮;;超聲引導(dǎo)下無水乙醇硬化治療卵巢囊腫后卵巢功能的改變[J];人人健康;2016年20期

5 蔡玲;;卵巢癌病人化療中的護(hù)理[J];人人健康;2017年06期

6 雷輝志;;孕期卵巢腫瘤處理因人而異[J];家庭醫(yī)學(xué);2015年02期

7 竹劍平;;卵巢腫瘤應(yīng)警惕[J];養(yǎng)生月刊;2014年02期

8 程小艷;;臨床分析腹腔鏡下實(shí)施卵巢腫瘤剝離止血對患者卵巢功能的影響[J];醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐;2014年05期

9 孫豐梅;李波;;中期妊娠患卵巢腫瘤行腹腔鏡手術(shù)護(hù)理心得[J];基層醫(yī)學(xué)論壇;2012年15期

10 LUCY;;Q＆A[J];食品與藥品;2011年08期

相關(guān)會議論文 前10條

1 鄭飛云;;老年婦女卵巢腫瘤的診治[A];2012年浙江省婦產(chǎn)科學(xué)及圍產(chǎn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會暨《婦產(chǎn)科常見疾病規(guī)范化治療新進(jìn)展》及《圍產(chǎn)醫(yī)學(xué)熱點(diǎn)追蹤》學(xué)習(xí)班論文集[C];2012年

2 張海;李光展;吳瑛;盧俊;王慧芳;鄧偉蓮;;經(jīng)陰道彩色多普勒血流圖檢測卵巢腫瘤血管的臨床價值[A];中華醫(yī)學(xué)會第六次全國超聲醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2001年

3 洪樹勛;許紅;曹良杰;;801例卵巢腫瘤臨床分析[A];紀(jì)念卓越的人民醫(yī)學(xué)家林巧稚大夫誕辰100周年——全國婦產(chǎn)科高級學(xué)術(shù)論壇論文集[C];2001年

4 李利;王超英;林忠乙;;老年卵巢腫瘤82例分析[A];中國抗癌協(xié)會婦科腫瘤專業(yè)委員會第六次全國學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2001年

5 楊幼易;;老年婦女卵巢腫瘤手術(shù)治療140例臨床分析[A];中國抗癌協(xié)會婦科腫瘤專業(yè)委員會第六次全國學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2001年

6 劉力;李冰琳;張啟培;;836例卵巢腫瘤臨床病理分析[A];第八次全國婦產(chǎn)科學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2004年

7 陳曉玲;紀(jì)莉;吳曉燕;魚紅菊;王琳;;彩色多普勒超聲在卵巢腫瘤診斷中的應(yīng)用[A];第一屆全國婦產(chǎn)科超聲學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

8 許幼峰;郭e

本文編號：2591335