ERBB4基因與中國漢族女性多囊卵巢綜合征的關(guān)聯(lián)性研究
本文關(guān)鍵詞: 多囊卵巢綜合征(PCOS) 全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS) ERBB4基因 單核苷酸多態(tài)性(SNP) 出處:《山東大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:研究背景多囊卵巢綜合征(Polycystic Ovary Syndrome,PCOS)是育齡期婦女最常見的具有高度異質(zhì)性的生殖內(nèi)分泌及代謝紊亂性疾病。臨床特征主要表現(xiàn)為稀發(fā)排卵或無排卵、高雄激素血癥以及卵巢多囊樣改變,同時伴有胰島素抵抗、肥胖,遠(yuǎn)期發(fā)生糖尿病、心血管疾病以及代謝綜合征的風(fēng)險增加,影響女性一生健康。全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)是發(fā)現(xiàn)復(fù)雜疾病致病基因的有效途徑。前期,我們課題組已在中國女性中發(fā)現(xiàn)了11個PCOS的易感區(qū)域,這些區(qū)域多數(shù)已在歐美PCOS人群得到驗證。近期,基于歐洲PCOS人群的GWAS新報道了 3個易感位點—2q34(ERRBB-4)、12q21.2(KRR1)和5q31.1(RSD50),它們與中國漢族人群PCOS的發(fā)病風(fēng)險是否也存在相關(guān)性亟需證實。研究目的分析歐洲人群GWAS新發(fā)現(xiàn)的3個PCOS易感區(qū)域是否也與中國漢族女性PCOS的發(fā)病相關(guān)。研究方法本研究納入了 1500例中國漢族PCOS患者和1220例年齡匹配的對照。采用TaqMan-MGB的方法對可代表這3個區(qū)域的標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)位點(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)rs1351592(2q34,ERBB4)、rs1275468(12q21.2,KRR1)和rs13164856(5q31.1,RAD50)進(jìn)行基因型分型。利用哈迪溫伯格平衡檢驗等位基因頻率分布,采用不同基因型遺傳分析模型包括加性模型、顯性模型和隱形模型比較基因型頻率。并對有統(tǒng)計學(xué)意義的位點進(jìn)行不同基因型患者的臨床指標(biāo)比較,選擇顯性模型對PCOS患者的基因型-表型進(jìn)行分析。服從正態(tài)分布的連續(xù)數(shù)值變量通過非配對t檢驗進(jìn)行分析,不服從正態(tài)分布的連續(xù)數(shù)值變量運用曼-惠特尼U檢驗。研究結(jié)果位于染色體2q34的ERBB4基因SNP rs1351592的等位基因頻率在病例組明顯高于對照組(P=1.05×10-3),校正BMI后統(tǒng)計學(xué)意義更加顯著(Padjusted=2.09× 1 0-4),提示ERBB4也是中國漢族PCOS的易感基因。但其它2個位點rs1275468(12q21.2,KRR1)和rs13164856(5q31.1,RAD50)的風(fēng)險等位基因頻率在兩組間的差異并無統(tǒng)計學(xué)意義。進(jìn)一步針對有意義的位點rs1351592進(jìn)行基因型與內(nèi)分泌、代謝等生化指標(biāo)的相關(guān)性分析,但未發(fā)現(xiàn)其基因分型與內(nèi)分泌和代謝指標(biāo)之間具有統(tǒng)計學(xué)意義。研究結(jié)論歐洲PCOS人群的易感位點2q34(ERBB4)同樣也是中國漢族PCOS遺傳易感位點,進(jìn)一步說明不同人種PCOS間存在共同的遺傳發(fā)病風(fēng)險。
[Abstract]:The research background of polycystic ovary syndrome (Polycystic Ovary, Syndrome, PCOS) is a disease of reproductive endocrine and metabolic disorder with a high degree of heterogeneity of the most common in women of childbearing age. The main clinical features are dilute ovulation or anovulation, Kaohsiung and hormone level of polycystic ovaries, accompanied by insulin resistance, obesity, long-term diabetes and the risk of cardiovascular disease and metabolic syndrome increased influence of female life health. A genome-wide association study (Genome-wide association study, GWAS) is the effective approach to discover the complex disease gene. Early, our research group has found that women in the China 11 PCOS susceptibility regions, these regions have been confirmed in most Europe and the United States PCOS population. Recently, based on the European PCOS GWAS group reported 3 new susceptibility loci 2q34 (ERRBB-4), 12q21.2 (KRR1) and 5q31.1 (RSD50), which The risk of PCOS and Chinese Han population whether there is correlation to confirm. The purpose of this paper is the 3 new PCOS GWAS found in European populations susceptible region is also China incidence and Han female PCOS. This study included 1500 cases of the control Chinese Han PCOS patients and 1220 age matched with TaqMan-MGB. The method of tag single nucleotide polymorphisms may represent the 3 regions (single-nucleotide, polymorphisms, SNPs) rs1351592 (2q34, ERBB4), rs1275468 (12q21.2, KRR1) and rs13164856 (5q31.1, RAD50) genotype distribution. By using the Hardy Weinberg equilibrium test allele frequency with different genotype genetic analysis models including the additive model, dominant model and contact model. Comparison of genotype frequencies and the significant loci were clinical indicators of different genotypes were compared, The selection of the dominant model genotype in patients with PCOS phenotype were analyzed. It follows the normal distribution of continuous variables by non paired t test analysis, does not obey the normal distribution of continuous variables using the Mann Whitney U test. Results the ERBB4 gene is located on chromosome 2q34 SNP rs1351592 allele frequency in case group significantly higher than the control group (P=1.05 * 10-3), statistical significance was more significant after correction for BMI (Padjusted=2.09 * 10-4), suggesting that ERBB4 is susceptible Chinese Han PCOS gene. But the other 2 loci rs1275468 (12q21.2, KRR1) and rs13164856 (5q31.1, RAD50) the risk allele frequency differences among the two groups there was no statistically significant. Further genotype and endocrine for locus rs1351592 significant, correlation analysis of biochemical metabolism, but did not find the gene type and internal secretion and metabolism Conclusion the susceptibility locus 2q34 (ERBB4) in European PCOS population is also the PCOS susceptibility locus in Chinese Han nationality, which further indicates that there is a common genetic risk among different races PCOS.
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R711.75
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