基于磁共振成像的大腦白質(zhì)纖維束形態(tài)分析方法研究
本文關(guān)鍵詞:基于磁共振成像的大腦白質(zhì)纖維束形態(tài)分析方法研究
更多相關(guān)文章: 大腦白質(zhì)纖維束 大腦皮層褶皺 白質(zhì)纖維形狀 皮層褶皺形態(tài) 磁共振成像 腦功能區(qū)域 腦功能區(qū)域預(yù)測 聯(lián)合分析
【摘要】:大腦作為神經(jīng)系統(tǒng)的中樞,具有極為復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和功能。其中大腦白質(zhì)纖維束負責(zé)神經(jīng)元之間信號的傳遞交換,從而在大腦功能網(wǎng)絡(luò)中扮演著極為重要的角色。另外,在大腦的發(fā)育過程以及物種的進化過程中,白質(zhì)纖維束與皮層褶皺模態(tài)的形成也極為相關(guān)。因此,對白質(zhì)纖維束的研究也一直是腦科學(xué)研究中的熱點。然而,到目前為止,少有在全腦上針對這兩個問題展開的大規(guī)模系統(tǒng)研究。除了缺少有效的聯(lián)合分析方法外,傳統(tǒng)方法中所使用的數(shù)據(jù)類型,如解剖切片纖維數(shù)據(jù)等,由于其侵入性等原因,也成為限制研究的一個因素。近年來,特別是隨著多模態(tài)磁共振成像方法在腦科學(xué)用的廣泛應(yīng)用,例如能反映腦組織結(jié)構(gòu)的T1加權(quán)磁共振成像(T1-weighted MRI),能宏觀反映白質(zhì)纖維束形態(tài)的彌散磁共振成像(dMRI)以及能用來宏觀檢測腦功能區(qū)域的功能磁共振成像(fMRI)等,使得在大規(guī)模數(shù)據(jù)上進行宏觀的研究成為可能。因此,本論文以多模態(tài)磁共振圖像為載體,開發(fā)了全新的且被證明有效的多種分析方法,著重對上述兩個方面進行了深入的研究,主要研究內(nèi)容,創(chuàng)新點和結(jié)果總結(jié)如下: 為了研究大腦皮層褶皺和白質(zhì)纖維束之間的關(guān)系,我們首先提出了一下兩種算法: 大腦皮層褶皺模態(tài)的參數(shù)化表達算法。該算法建立在T1加權(quán)磁共振成像重建表面的局部坐標(biāo)系上,用多項式對局部表面點陣進行擬合。該算法的創(chuàng)新點在于局部坐標(biāo)系的使用能夠有效的將復(fù)雜的局部表面統(tǒng)一到同一空間,從而使它們具有可比性且更易于對它們的褶皺模式進行統(tǒng)一的參數(shù)化分析。另外,也使得不同磁共振數(shù)據(jù)庫得到的表面也具有可比性。同時,用多項式擬合來進行的參數(shù)化使局部表面得到十分簡潔的表達,便于在后續(xù)的大規(guī)模數(shù)據(jù)上進行分析,,比如數(shù)據(jù)驅(qū)動以及模型驅(qū)動的聚類等。大腦表面的褶皺模式最終被聚類為八種基本形態(tài)。 大腦白質(zhì)纖維束形態(tài)的參數(shù)化表達算法。該參數(shù)化算法以dMRI重構(gòu)出來的每一根纖維為個體,通過提出的歸一化算法將它們統(tǒng)一到同一空間,并在其上提取了四大類形狀描述特征。該算法的創(chuàng)新點在于纖維形狀特征建立在以每一個纖維為單位的基礎(chǔ)上,使得該算法可獨立的運用在不同的磁共振數(shù)據(jù)得到的纖維上,而不受數(shù)據(jù)獲取參數(shù)的影響。另外,將每一根纖維參數(shù)化使得進行大規(guī)模的跨數(shù)據(jù)庫分析,比如形態(tài)的聚類等,成為可能。纖維最終被聚類為四種基本形態(tài)。 在以上兩種算法的基礎(chǔ)上,我們采用聯(lián)合分析的方法對大腦皮層褶皺模態(tài)和白質(zhì)纖維形態(tài)進行了大規(guī)模系統(tǒng)的分析。我們將聯(lián)合分析法用在三類靈長類(恒河猴,猩猩和人類)大腦的多模態(tài)dMRI數(shù)據(jù)上,發(fā)現(xiàn)纖維形態(tài)和皮層褶皺形態(tài)非常相關(guān)。重要的結(jié)論有:在輻射方向上,連接到腦回區(qū)域的纖維束密度要大于連接到腦溝區(qū)域;在切向方向上,纖維束的走向和腦回的彎曲走向有著顯著的相關(guān)性;腦溝底部存在著大量的連接到近鄰腦回的U型纖維束;相較于直線型纖維束,U型纖維束連接的皮層區(qū)域的褶皺模態(tài)更為復(fù)雜。更為重要的是,這些關(guān)于纖維形態(tài)和皮層褶皺形態(tài)關(guān)系的結(jié)論在靈長類大腦中普遍存在。另外,在不同的物種的數(shù)據(jù)上,纖維和褶皺之間關(guān)系的強弱程度也存在著一定的差異。這些差異性在一定程度上揭示了不同形態(tài)的纖維束在物種進化中的作用。 在研究白質(zhì)纖維束和腦功能之間的關(guān)系時,提出了用白質(zhì)纖維束形態(tài)來預(yù)測腦功能區(qū)域的新方法。通過該方法,我們對具有特定功能的腦區(qū)域的白質(zhì)纖維束形態(tài)建立模型,從而能夠使用這一模型在新的被試上預(yù)測該腦功能區(qū)域的位置。該方法的價值不僅僅體現(xiàn)在它進一步證明了腦結(jié)構(gòu)和腦功能之間的緊密關(guān)系,也體現(xiàn)在其具有很好的應(yīng)用前景:僅需要數(shù)據(jù)量小且代價低廉的腦結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)便可預(yù)測得到較為精準(zhǔn)的腦功能區(qū)域。而這些功能區(qū)域在傳統(tǒng)的方法中需要從代價昂貴且數(shù)據(jù)量極大的腦功能數(shù)據(jù)上獲取。 最后,基于上述腦功能區(qū)域預(yù)測的思想,提出了通過將褶皺形態(tài)和纖維束形態(tài)信息融合而進一步提高對大腦功能區(qū)域位置預(yù)測的準(zhǔn)確度的全新算法。這一方法有效的提高了大腦功能區(qū)域位置預(yù)測的準(zhǔn)確度,并且同樣具有上述算法的應(yīng)用前景。另外,它也在探索皮層褶皺形態(tài),纖維束形態(tài)和大腦功能三者之間關(guān)系的道路上邁進了一步。
【關(guān)鍵詞】:大腦白質(zhì)纖維束 大腦皮層褶皺 白質(zhì)纖維形狀 皮層褶皺形態(tài) 磁共振成像 腦功能區(qū)域 腦功能區(qū)域預(yù)測 聯(lián)合分析
【學(xué)位授予單位】:西北工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R445.2
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-9
- 目錄9-11
- 第1章 緒論11-21
- 1.1 大腦白質(zhì)纖維束是腦成像科學(xué)研究的重點11-14
- 1.2 已有的工作以及存在的問題14-18
- 1.3 本論文的研究內(nèi)容和主要貢獻18-19
- 1.5 論文章節(jié)安排19-21
- 第2章 MRI 腦成像簡述21-29
- 2.1 磁共振腦成像基本原理21-22
- 2.2 彌散 MRI 成像22-24
- 2.2.1 DWI 的成像原理22
- 2.2.2 dMRI 的成像原理和白質(zhì)神經(jīng)纖維束追蹤方法22-24
- 2.3 功能磁共振成像24-26
- 2.4 腦結(jié)構(gòu)圖像的預(yù)處理26-29
- 第3章 白質(zhì)纖維束和皮層褶皺的關(guān)系29-63
- 3.1 引言29-32
- 3.2 實驗數(shù)據(jù)的獲取和預(yù)處理32-34
- 3.3 大腦白質(zhì)表面和纖維束聯(lián)合表達和分析方法34-46
- 3.3.1 大腦白質(zhì)表面的參數(shù)化表達34-38
- 3.3.2 大腦白質(zhì)纖維的參數(shù)化表達及形狀聚類分析38-41
- 3.3.3 腦回頂脊線和腦溝低基線的提取41-43
- 3.3.4 大腦白質(zhì)纖維束和大腦白質(zhì)表面褶皺的聯(lián)合分析43-46
- 3.4 皮層褶皺模態(tài)參數(shù)化和白質(zhì)形狀聚類結(jié)果46-50
- 3.4.1 皮層褶皺模態(tài)分類參數(shù)化結(jié)果評估46-48
- 3.4.2 皮層褶皺模態(tài)分類在自閉癥患者上的評估48-50
- 3.4.3 白質(zhì)纖維束形狀聚類結(jié)果評估50
- 3.5 聯(lián)合分析結(jié)果50-60
- 3.5.1 白質(zhì)纖維束和腦回的關(guān)系50-52
- 3.5.2 白質(zhì)纖維束和腦溝的關(guān)系52-58
- 3.5.3 白質(zhì)纖維束形狀和皮層褶皺模態(tài)的關(guān)系58-59
- 3.5.4 像素級別的彌散方向和皮層褶皺聯(lián)合可視化分析59-60
- 3.6 本章小結(jié)60-63
- 第4章 白質(zhì)纖維束和皮層褶皺在物種進化中的表現(xiàn)63-73
- 4.1 引言63-64
- 4.2 數(shù)據(jù)描述64-65
- 4.3 實驗結(jié)果65-72
- 4.3.1 腦回和纖維束的關(guān)系在物種間的差異65-68
- 4.3.2 腦溝和纖維束的關(guān)系在物種間的差異68-72
- 4.4 本章小結(jié)72-73
- 第5章 白質(zhì)纖維束對大腦功能區(qū)域位置的預(yù)測73-89
- 5.1 引言73-75
- 5.2 算法思想75-76
- 5.3 實驗數(shù)據(jù)的獲取和預(yù)處理76-78
- 5.4 實驗方法78-81
- 5.4.1 訓(xùn)練階段78-79
- 5.4.2 預(yù)測階段79-81
- 5.5 實驗結(jié)果81-87
- 5.5.1 ROI 預(yù)測結(jié)果評估81-86
- 5.5.2 和配準(zhǔn)方法的比較86-87
- 5.6 本章小結(jié)87-89
- 第6章 白質(zhì)纖維束和皮層褶皺對大腦功能區(qū)域位置的預(yù)測89-115
- 6.1 引言89
- 6.2 算法思想89-90
- 6.3 算法實現(xiàn)90-101
- 6.3.1 實驗數(shù)據(jù)及預(yù)處理90-93
- 6.3.2 訓(xùn)練階段93-98
- 6.3.3 預(yù)測階段98-101
- 6.4 實驗結(jié)果101-112
- 6.4.1 特征的有效性101-105
- 6.4.2 訓(xùn)練和預(yù)測模型中的參數(shù)105-107
- 6.4.3 預(yù)測效果評估107-109
- 6.4.4 同配準(zhǔn)方法的比較109-110
- 6.4.5 在 MCI 數(shù)據(jù)上的可重復(fù)實驗110-112
- 6.5 本章討論與小結(jié)112-115
- 第7章 總結(jié)與展望115-117
- 7.1 論文工作總結(jié)115-116
- 7.2 論文工作展望116-117
- 參考文獻117-127
- 博士期間的工作成果127-132
- 發(fā)表的雜志文章127-129
- 發(fā)表的會議文章129-131
- 發(fā)明專利131-132
- 致謝132-133
【共引文獻】
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