影響棕色和白色脂肪分化相關(guān)長鏈非編碼RNA表達(dá)譜特征研究
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更多相關(guān)文章: 棕色脂肪組織 白色脂肪組織 長鏈非編碼RNA 脂肪形成
【摘要】:背景長鏈非編碼RNA(LncRNAs)是參與多種生物功能普遍存在的一類重要基因,它可以作為參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵共活化因子。眾所周知,白色脂肪的功能是貯存能量而棕色脂肪是消耗能量。白色和棕色脂肪細(xì)胞均起源于中胚層。然而,目前尚不清楚LncRNAs是否在棕色脂肪和白色脂肪的能量代謝和成脂分化中起到作用。目的研究LncRNAs在棕色和白色脂肪中表達(dá)譜的差異特征,明確LncRNAs是否參與棕色脂肪和白色脂肪的能量代謝和成脂分化這一生物過程。為今后在治療肥胖提供了理論基礎(chǔ)。方法首先,采用免疫組化法來鑒別棕色脂肪,隨后分別提取棕色脂肪和白色脂肪的總RNA并對總RNA的質(zhì)量鑒定;采用實時熒光定量PCR,對這些差異倍數(shù)大的LncRNAs進(jìn)行驗證;為了揭示這些LncRNAs的潛在功能,通過GO和Pathway分析方法,對這些表達(dá)差異的LncRNAs進(jìn)行了分析,并且通過斯皮爾曼相關(guān)分析和生物信息學(xué)分析對基因AK142386和AK133540的潛在相關(guān)靶基因進(jìn)行了預(yù)測;結(jié)果解偶聯(lián)蛋白-1(uncoupling protein-1 UCP-1)免疫組化顯示陽性著色較深的為棕色脂肪組織;利用第二代測序技術(shù)和芯片技術(shù),通過比較棕色脂肪組織和白色脂肪組織分化相關(guān)LncRNA表達(dá)譜特征,發(fā)現(xiàn)了735個上調(diào)和877個下調(diào)的LncRNA(差異倍數(shù)大于4)。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示所挑選出的基因差異性表達(dá)符合芯片結(jié)果;GO和Pathway分析,發(fā)現(xiàn)了AK142386和AK133540影響了脂肪生成和能量代謝;斯皮爾曼和生物信息學(xué)分析,Hoxa3和Acad10分別是基因AK142386和AK133540的相關(guān)靶基因,推測可能通過其影響能量代謝。結(jié)論通過實驗驗證和生物信息學(xué)的方法,分析了棕色脂肪和白色脂肪LncRNA的差異表達(dá)譜特征,也證實本研究芯片數(shù)據(jù)有較高的可重復(fù)性,總之通過芯片結(jié)果已經(jīng)確定了大量的LncRNAs,這些LncRNAs在脂肪形成和能量代謝中具有重要的調(diào)控功能。
【關(guān)鍵詞】:棕色脂肪組織 白色脂肪組織 長鏈非編碼RNA 脂肪形成
【學(xué)位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R723.14
【目錄】:
- 摘要5-6
- Abstract6-8
- 前言8-11
- 材料與方法11-24
- 結(jié)果24-28
- 討論28-34
- 小結(jié)34-35
- 附圖35-40
- 參考文獻(xiàn)40-45
- 綜述:LncRNA的功能及在肥胖和其他疾病中的研究進(jìn)展45-60
- 參考文獻(xiàn)55-60
- 附錄60-62
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況62-64
- 致謝64-66
- 個人簡歷66-67
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,本文編號:927500
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