應(yīng)用iTRAQ技術(shù)篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白質(zhì)
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更多相關(guān)文章: 蛋白組學(xué) iTRAQ 癲癇 皮質(zhì)發(fā)育障礙
【摘要】:目的:本文旨在篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中差異性表達(dá)的蛋白,從而以尋找其生物學(xué)標(biāo)志物以及治療的潛在靶點(diǎn)。方法:以兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織(皮質(zhì)發(fā)育障礙組)以及創(chuàng)傷后因顱內(nèi)高壓術(shù)后的兒童正常腦組織(對(duì)照組)為對(duì)象。采用同位素相對(duì)標(biāo)記與絕對(duì)定量技術(shù)(isobaric tag for relative and absolute quantification, iTRAQ)結(jié)合雙向液相色譜與串聯(lián)質(zhì)譜(2D liquid chromatograph electrospray tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)來(lái)鑒定兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白,對(duì)所獲得差異性蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,從而篩選出具有潛在研究?jī)r(jià)值的候選蛋白。最后應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡,免疫組化方法驗(yàn)證這些候選蛋白在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中的表達(dá)情況。結(jié)果:通過(guò)iTRAQ及2D-LC-MS/MS方法,一共鑒定出153種蛋白質(zhì)在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織及兒童正常腦組織中有表達(dá)差異(其中在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織中64種蛋白質(zhì)上調(diào),89種蛋白質(zhì)下調(diào);P0.05)。通過(guò)GO (Gene ontology)功能分析提示153種差異性蛋白主要參與酶催化活性的調(diào)節(jié),蛋白質(zhì)功能相互作用網(wǎng)狀圖發(fā)現(xiàn)transferri(TF)-. apolipoprotein A1(APOA1)alpha-2-macroglobulin(A2M).ATPase(ATP6V 1 A).vimentin(VIM)處于網(wǎng)狀圖的交叉點(diǎn)。通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn),免疫印跡實(shí)驗(yàn)以及免疫組化實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證TF, APOA1,A2M,ATP6V1A以及VIM的表達(dá)水平,結(jié)果提示這5種候選蛋白在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織中的表達(dá)趨勢(shì)與質(zhì)譜結(jié)果趨勢(shì)一致。結(jié)論:采用iTRA Q結(jié)合2D-LC-MS/MS技術(shù),能夠有效地篩選出兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中差異表達(dá)的蛋白,從而在診斷及治療方面為該病提供了潛在的生物學(xué)靶點(diǎn)及方向。
【關(guān)鍵詞】:蛋白組學(xué) iTRAQ 癲癇 皮質(zhì)發(fā)育障礙
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R742.1
【目錄】:
- 英漢縮略語(yǔ)名詞對(duì)照5-6
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 前言10-12
- 1 材料與方法12-17
- 1.1 腦組織樣本收集12-13
- 1.2 iTRAO定量蛋白質(zhì)組學(xué)13-15
- 1.3 質(zhì)譜及生物信息學(xué)的分析15
- 1.4 驗(yàn)證候選蛋白的表達(dá)水平15-17
- 1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)部分17
- 2 結(jié)果17-28
- 2.1 iTRAQ核素標(biāo)記分組及質(zhì)譜結(jié)果17-24
- 2.2 生物信息學(xué)分析結(jié)果24-26
- 2.3 mRNA水平的表達(dá)驗(yàn)證26
- 2.4 Western blot驗(yàn)證差異蛋白表達(dá)水平26-27
- 2.5 免疫組化驗(yàn)證候選蛋白的表達(dá)水平27-28
- 3 討論28-32
- 全文小結(jié)32-33
- 參考文獻(xiàn)33-36
- 文獻(xiàn)綜述:iTRAQ技術(shù)及其在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的運(yùn)用36-44
- 參考文獻(xiàn)41-44
- 致謝44-45
- 攻讀學(xué)位期間的研究成果及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄45
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):596605
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