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應(yīng)用iTRAQ技術(shù)篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白質(zhì)

發(fā)布時(shí)間:2017-07-31 00:06

  本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用iTRAQ技術(shù)篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白質(zhì)


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【摘要】:目的:本文旨在篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中差異性表達(dá)的蛋白,從而以尋找其生物學(xué)標(biāo)志物以及治療的潛在靶點(diǎn)。方法:以兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織(皮質(zhì)發(fā)育障礙組)以及創(chuàng)傷后因顱內(nèi)高壓術(shù)后的兒童正常腦組織(對(duì)照組)為對(duì)象。采用同位素相對(duì)標(biāo)記與絕對(duì)定量技術(shù)(isobaric tag for relative and absolute quantification, iTRAQ)結(jié)合雙向液相色譜與串聯(lián)質(zhì)譜(2D liquid chromatograph electrospray tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)來(lái)鑒定兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白,對(duì)所獲得差異性蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,從而篩選出具有潛在研究?jī)r(jià)值的候選蛋白。最后應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR和蛋白質(zhì)免疫印跡,免疫組化方法驗(yàn)證這些候選蛋白在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中的表達(dá)情況。結(jié)果:通過(guò)iTRAQ及2D-LC-MS/MS方法,一共鑒定出153種蛋白質(zhì)在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織及兒童正常腦組織中有表達(dá)差異(其中在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織中64種蛋白質(zhì)上調(diào),89種蛋白質(zhì)下調(diào);P0.05)。通過(guò)GO (Gene ontology)功能分析提示153種差異性蛋白主要參與酶催化活性的調(diào)節(jié),蛋白質(zhì)功能相互作用網(wǎng)狀圖發(fā)現(xiàn)transferri(TF)-. apolipoprotein A1(APOA1)alpha-2-macroglobulin(A2M).ATPase(ATP6V 1 A).vimentin(VIM)處于網(wǎng)狀圖的交叉點(diǎn)。通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn),免疫印跡實(shí)驗(yàn)以及免疫組化實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證TF, APOA1,A2M,ATP6V1A以及VIM的表達(dá)水平,結(jié)果提示這5種候選蛋白在兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇腦組織中的表達(dá)趨勢(shì)與質(zhì)譜結(jié)果趨勢(shì)一致。結(jié)論:采用iTRA Q結(jié)合2D-LC-MS/MS技術(shù),能夠有效地篩選出兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇中差異表達(dá)的蛋白,從而在診斷及治療方面為該病提供了潛在的生物學(xué)靶點(diǎn)及方向。
【關(guān)鍵詞】:蛋白組學(xué) iTRAQ 癲癇 皮質(zhì)發(fā)育障礙
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R742.1
【目錄】:
  • 英漢縮略語(yǔ)名詞對(duì)照5-6
  • 中文摘要6-8
  • 英文摘要8-10
  • 前言10-12
  • 1 材料與方法12-17
  • 1.1 腦組織樣本收集12-13
  • 1.2 iTRAO定量蛋白質(zhì)組學(xué)13-15
  • 1.3 質(zhì)譜及生物信息學(xué)的分析15
  • 1.4 驗(yàn)證候選蛋白的表達(dá)水平15-17
  • 1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)部分17
  • 2 結(jié)果17-28
  • 2.1 iTRAQ核素標(biāo)記分組及質(zhì)譜結(jié)果17-24
  • 2.2 生物信息學(xué)分析結(jié)果24-26
  • 2.3 mRNA水平的表達(dá)驗(yàn)證26
  • 2.4 Western blot驗(yàn)證差異蛋白表達(dá)水平26-27
  • 2.5 免疫組化驗(yàn)證候選蛋白的表達(dá)水平27-28
  • 3 討論28-32
  • 全文小結(jié)32-33
  • 參考文獻(xiàn)33-36
  • 文獻(xiàn)綜述:iTRAQ技術(shù)及其在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的運(yùn)用36-44
  • 參考文獻(xiàn)41-44
  • 致謝44-45
  • 攻讀學(xué)位期間的研究成果及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄45

【相似文獻(xiàn)】

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1 文明;晏勇;;皮質(zhì)發(fā)育障礙的分子生物學(xué)研究現(xiàn)狀[J];國(guó)際神經(jīng)病學(xué)神經(jīng)外科學(xué)雜志;2005年06期

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10 晏勇;皮質(zhì)發(fā)育障礙與癲癇發(fā)作[J];重慶醫(yī)學(xué);2001年05期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

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2 晏勇;文明;何選麗;晏寧;黃華;馬勛太;官云里;蔣萍;;兩種皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠模型共同差異基因表達(dá)的研究[A];第九次全國(guó)神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編[C];2006年

3 馬勛泰;李小剛;呂洋;承歐梅;晏勇;;皮質(zhì)發(fā)育障礙性難治性癲癇的病理和神經(jīng)遞質(zhì)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十三次全國(guó)神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2010年

4 張建剛;宋延波;張毅;黃敏;馮占輝;賀興;晏勇;;X-射線照射損傷后皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠模型的研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十三次全國(guó)神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2010年

5 張進(jìn);;皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠海馬神經(jīng)元鈉通道和HVA鈣通道功能的研究[A];2006年浙江省神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2006年

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7 馮占輝;楚蘭;晏勇;黃敏;;X射線照射建立大鼠皮質(zhì)發(fā)育障礙模型研究[A];貴州省醫(yī)學(xué)會(huì)第八屆神經(jīng)病學(xué)年會(huì)論文集[C];2010年

8 張曼曼;郭誼;丁美萍;;卡莫司汀致大鼠皮質(zhì)發(fā)育不良模型癲癇易感性研究[A];2011年浙江省神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2011年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 劉照;皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠海馬神經(jīng)元鈉通道和鈣通道功能的變化[D];中南大學(xué);2006年

2 馮占輝;皮質(zhì)發(fā)育障礙模型鼠海馬基因芯片和蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2010年

3 李松;基質(zhì)金屬蛋白酶9在腦皮質(zhì)發(fā)育障礙中的作用研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2012年

4 黃華;皮質(zhì)發(fā)育障礙的致癇機(jī)制及所致難治性癲癇的臨床治療研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2009年

5 馬勛泰;皮質(zhì)發(fā)育障礙模型鼠大腦的病理特征和體視學(xué)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2008年

6 張建剛;X射線誘導(dǎo)皮質(zhì)發(fā)育障礙模型及相關(guān)致癲機(jī)制的研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年

7 張春青;血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子-C在大腦皮質(zhì)發(fā)育障礙中的作用及機(jī)制研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2010年

8 樹(shù)海峰;SVZ來(lái)源的神經(jīng)前體細(xì)胞參與皮質(zhì)發(fā)育障礙致癇機(jī)制的研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2010年

9 文明;RBFOX1高表達(dá)與皮質(zhì)發(fā)育障礙伴難治性癲癇發(fā)病機(jī)制的臨床及細(xì)胞學(xué)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年

10 賀教江;IL-17在大腦皮質(zhì)發(fā)育障礙癲癇發(fā)生中的作用研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 孫杰;IL-6在局灶性皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠腦皮質(zhì)中的表達(dá)[D];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院;2015年

2 陸林香;HHV6、HPV16、HSV在局灶性皮質(zhì)發(fā)育障礙中的表達(dá)[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

3 覃璐;應(yīng)用iTRAQ技術(shù)篩選兒童皮質(zhì)發(fā)育障礙性癲癇差異性表達(dá)蛋白質(zhì)[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

4 張曼曼;卡莫司汀致大鼠皮質(zhì)發(fā)育障礙模型癲癇易感性研究[D];浙江大學(xué);2011年

5 文明;兩種皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠模型形態(tài)學(xué)研究和相關(guān)基因篩選[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2006年

6 馬勛泰;皮質(zhì)發(fā)育障礙模型鼠大腦的病理學(xué)和主要神經(jīng)遞質(zhì)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2005年

7 馮飛;皮質(zhì)發(fā)育障礙大鼠海馬神經(jīng)元的體視學(xué)方法定量研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2013年

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10 郭為;骨形成蛋白-4在大腦皮質(zhì)發(fā)育障礙中的作用及機(jī)制研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2011年

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本文編號(hào):596605

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