FMR1基因與秦巴山區(qū)兒童精神發(fā)育遲滯的相關性研究
發(fā)布時間:2022-01-21 07:37
精神發(fā)育遲滯(Mental Retardation,MR)是嚴重危害兒童身心健康的重大精神、神經(jīng)類疾病,在人群中的患病率約為1%~3%,其病因十分復雜。諸多研究結果證明,FMR1基因的遺傳變異與MR的形成有關。為了研究陜南秦巴山區(qū)柞水、安康兩試驗點兒童MR的發(fā)病原因,課題組在家系調查和臨床檢查的基礎上,對這兩個試驗點的MR患者及其家系成員的FMR1基因的CGG重復和CpG島的甲基化進行了檢測。除發(fā)現(xiàn)3個CpG島異常甲基化的患者外,并未發(fā)現(xiàn)(CGG)n重復序列異常擴增的個體。該結果說明,FMR1基因的CpG島異常甲基化可能是這3個MR兒童發(fā)病的一個致病因素。已有研究表明,FMR1基因上存在多種類型的突變與MR有關。因此,在本課題組先期研究的基礎上,本研究采用病例-對照的方法,在FMR1基因上選擇遺傳標記位點,進一步探討在FMR1基因上其它類型的突變與陜南秦巴山區(qū)柞水、安康兩試驗點兒童的精神發(fā)育遲滯之間的關系。本研究以上述兩個試驗點的128名MR兒童、126名邊緣兒童和342名正常對照兒童作為研究對象。在FMR1基因上選擇三個SNPs位點rs4949,rs25714和rs25704,用聚合...
【文章來源】:西北大學陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 研究背景和意義
1.1 精神發(fā)育遲滯概述
1.1.1 精神發(fā)育遲滯的定義、診斷標準及分級標準
1.1.2 精神發(fā)育遲滯的患病率
1.1.3 精神發(fā)育遲滯的病因
1.1.4 與X連鎖精神發(fā)育遲滯相關的基因
1.2 對秦巴山區(qū)的MR調查
1.2.1 本課題組對秦巴山區(qū)的MR調查結果
1.2.2 本課題組所采用的精神發(fā)育遲滯診斷方法及分級標準
1.2.3 本課題組選用的幾種智力測驗和社會適應行為評定量表
1.3 本研究的意義
第二章 DNA多態(tài)性與分子遺傳標記
2.1 DNA多態(tài)性
2.1.1 DNA多態(tài)性的定義
2.1.2 DNA多態(tài)性的兩種類型
2.2 分子遺傳標記
2.2.1 分子遺傳標記概述
2.2.2 三代分子遺傳標記簡介
2.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
2.3.1 衡量 SNPs多態(tài)性的參數(shù)
2.3.2 研究單核苷酸多態(tài)性的意義
第三章 研究中采用的遺傳學理論及方法
3.1 哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡法則
3.1.1 Hardy-Weinberg定律的內容
3.1.2 Hardy-Weinberg吻合度檢驗
3.2 關聯(lián)分析的理論
3.2.1 關聯(lián)分析理論概述
3.2.2 關聯(lián)分析的局限性
3.3 遺傳學病例-對照關聯(lián)分析常用軟件—CLUMP
3.4 統(tǒng)計效力和樣本量
第四章 目標基因簡介及SNP位點的選擇
4.1 FMR1基因簡介
4.1.1 FMR1基因結構
4.1.2 FMRP蛋白結構及生理功能
4.1.3 FMR1基因與精神發(fā)育遲滯的相關研究
4.2 SNP位點的選擇
第五章 實驗材料、方法和步驟
5.1 實驗材料
5.1.1 研究對象
5.1.2 實驗儀器
5.1.3 實驗藥品
5.2 實驗方法及步驟
5.2.1 血樣的采集及基因組DNA的提取
5.2.2 DNA濃度的測定
5.2.3 PCR擴增目的片段
5.2.4 電泳及分型
5.2.5 統(tǒng)計分析
第六章 實驗結果分析
6.1 FMR1基因上的三個 SNP位點的基因分型結果
6.1.1 rs4949位點的基因分型結果分析
6.1.2 rs25714位點的基因分型結果分析
6.1.3 rs25704位點的基因分型結果分析
6.2 FMR1基因上的三個SNP位點的數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
6.2.1 三個 SNP位點的地域差異檢驗
6.2.2 三個 SNP位點的HWE檢驗
6.2.3 三個 SNP位點在樣本人群中的等位基因頻率和基因型頻率
6.2.4 三個 SNP位點在不同性別樣本人群中的等位基因頻率分布
6.2.5 三個 SNP位點多態(tài)性與總體樣本人群精神發(fā)育遲滯的相關性
6.2.6 三個 SNP位點多態(tài)性與不同性別兒童精神發(fā)育遲滯的相關性
6.3 統(tǒng)計效力分析
6.4 討論
6.4.1 實驗結果討論
6.4.2 本論文研究工作的局限性及進一步的工作的建議
結論
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間取得的科研成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]X連鎖非特異性精神發(fā)育遲滯相關基因功能研究進展[J]. 張科進,張富昌,高曉彩. 遺傳. 2006(04)
[2]安康試驗點精神發(fā)育遲滯遺傳方式的探討[J]. 張淑苗,張富昌,龔平原,張科進,楊興中,何剛,李楠. 西北大學學報(自然科學版). 2006(01)
[3]柞水試驗區(qū)精神發(fā)育遲滯多發(fā)家庭的遺傳分析[J]. 張科進,張富昌,鄭子健,龔平原,何剛,南亞平,張蕊,馬捷. 西北大學學報(自然科學版). 2005(05)
[4]脆性X綜合征與脆性X智障蛋白的相關性研究進展[J]. 楊芳,白玉杰,李家林. 國外醫(yī)學.臨床生物化學與檢驗學分冊. 2005(05)
[5]脆性X綜合征[J]. 李東至,廖燦. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2005(05)
[6]脆X綜合征的分子基礎及其認知研究進展[J]. 詹建英,趙正言. 國外醫(yī)學(兒科學分冊). 2005(02)
[7]秦巴山區(qū)(寧強、柞水、安康試驗區(qū))0~14歲兒童精神發(fā)育遲滯患病狀況調查[J]. 張富昌,李瑞林,高曉彩,鄭子健,黃紹平,宋合義,席恒,李芬. 第四軍醫(yī)大學學報. 2004(06)
[8]秦巴山區(qū)精神發(fā)育遲滯兒童生物醫(yī)學因素分析[J]. 李瑞林,張富昌,陳征起,黃紹平,周戩平,李占魁,侯偉,郭亞樂. 西安交通大學學報(醫(yī)學版). 2003(04)
[9]精神發(fā)育遲滯者與染色體脆性部位相關性的研究[J]. 高文和. 天津醫(yī)科大學學報. 2001(01)
[10]脆性X智力低下蛋白的研究進展[J]. 張傳倉,姚英民. 國外醫(yī)學(兒科學分冊). 2001(02)
本文編號:3599847
【文章來源】:西北大學陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 研究背景和意義
1.1 精神發(fā)育遲滯概述
1.1.1 精神發(fā)育遲滯的定義、診斷標準及分級標準
1.1.2 精神發(fā)育遲滯的患病率
1.1.3 精神發(fā)育遲滯的病因
1.1.4 與X連鎖精神發(fā)育遲滯相關的基因
1.2 對秦巴山區(qū)的MR調查
1.2.1 本課題組對秦巴山區(qū)的MR調查結果
1.2.2 本課題組所采用的精神發(fā)育遲滯診斷方法及分級標準
1.2.3 本課題組選用的幾種智力測驗和社會適應行為評定量表
1.3 本研究的意義
第二章 DNA多態(tài)性與分子遺傳標記
2.1 DNA多態(tài)性
2.1.1 DNA多態(tài)性的定義
2.1.2 DNA多態(tài)性的兩種類型
2.2 分子遺傳標記
2.2.1 分子遺傳標記概述
2.2.2 三代分子遺傳標記簡介
2.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
2.3.1 衡量 SNPs多態(tài)性的參數(shù)
2.3.2 研究單核苷酸多態(tài)性的意義
第三章 研究中采用的遺傳學理論及方法
3.1 哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡法則
3.1.1 Hardy-Weinberg定律的內容
3.1.2 Hardy-Weinberg吻合度檢驗
3.2 關聯(lián)分析的理論
3.2.1 關聯(lián)分析理論概述
3.2.2 關聯(lián)分析的局限性
3.3 遺傳學病例-對照關聯(lián)分析常用軟件—CLUMP
3.4 統(tǒng)計效力和樣本量
第四章 目標基因簡介及SNP位點的選擇
4.1 FMR1基因簡介
4.1.1 FMR1基因結構
4.1.2 FMRP蛋白結構及生理功能
4.1.3 FMR1基因與精神發(fā)育遲滯的相關研究
4.2 SNP位點的選擇
第五章 實驗材料、方法和步驟
5.1 實驗材料
5.1.1 研究對象
5.1.2 實驗儀器
5.1.3 實驗藥品
5.2 實驗方法及步驟
5.2.1 血樣的采集及基因組DNA的提取
5.2.2 DNA濃度的測定
5.2.3 PCR擴增目的片段
5.2.4 電泳及分型
5.2.5 統(tǒng)計分析
第六章 實驗結果分析
6.1 FMR1基因上的三個 SNP位點的基因分型結果
6.1.1 rs4949位點的基因分型結果分析
6.1.2 rs25714位點的基因分型結果分析
6.1.3 rs25704位點的基因分型結果分析
6.2 FMR1基因上的三個SNP位點的數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
6.2.1 三個 SNP位點的地域差異檢驗
6.2.2 三個 SNP位點的HWE檢驗
6.2.3 三個 SNP位點在樣本人群中的等位基因頻率和基因型頻率
6.2.4 三個 SNP位點在不同性別樣本人群中的等位基因頻率分布
6.2.5 三個 SNP位點多態(tài)性與總體樣本人群精神發(fā)育遲滯的相關性
6.2.6 三個 SNP位點多態(tài)性與不同性別兒童精神發(fā)育遲滯的相關性
6.3 統(tǒng)計效力分析
6.4 討論
6.4.1 實驗結果討論
6.4.2 本論文研究工作的局限性及進一步的工作的建議
結論
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間取得的科研成果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]X連鎖非特異性精神發(fā)育遲滯相關基因功能研究進展[J]. 張科進,張富昌,高曉彩. 遺傳. 2006(04)
[2]安康試驗點精神發(fā)育遲滯遺傳方式的探討[J]. 張淑苗,張富昌,龔平原,張科進,楊興中,何剛,李楠. 西北大學學報(自然科學版). 2006(01)
[3]柞水試驗區(qū)精神發(fā)育遲滯多發(fā)家庭的遺傳分析[J]. 張科進,張富昌,鄭子健,龔平原,何剛,南亞平,張蕊,馬捷. 西北大學學報(自然科學版). 2005(05)
[4]脆性X綜合征與脆性X智障蛋白的相關性研究進展[J]. 楊芳,白玉杰,李家林. 國外醫(yī)學.臨床生物化學與檢驗學分冊. 2005(05)
[5]脆性X綜合征[J]. 李東至,廖燦. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2005(05)
[6]脆X綜合征的分子基礎及其認知研究進展[J]. 詹建英,趙正言. 國外醫(yī)學(兒科學分冊). 2005(02)
[7]秦巴山區(qū)(寧強、柞水、安康試驗區(qū))0~14歲兒童精神發(fā)育遲滯患病狀況調查[J]. 張富昌,李瑞林,高曉彩,鄭子健,黃紹平,宋合義,席恒,李芬. 第四軍醫(yī)大學學報. 2004(06)
[8]秦巴山區(qū)精神發(fā)育遲滯兒童生物醫(yī)學因素分析[J]. 李瑞林,張富昌,陳征起,黃紹平,周戩平,李占魁,侯偉,郭亞樂. 西安交通大學學報(醫(yī)學版). 2003(04)
[9]精神發(fā)育遲滯者與染色體脆性部位相關性的研究[J]. 高文和. 天津醫(yī)科大學學報. 2001(01)
[10]脆性X智力低下蛋白的研究進展[J]. 張傳倉,姚英民. 國外醫(yī)學(兒科學分冊). 2001(02)
本文編號:3599847
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