發(fā)布時間：2021-11-20 07:33

　　目的:幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎（Juvenile idiopathic arthritis,JIA）是兒童時期最常見的慢性風(fēng)濕性疾病。全身型JIA（Systemic-onset JIA,SoJIA）是其最嚴(yán)重的亞型之一。盡管SoJIA的發(fā)病機(jī)制尚不清楚,但最近一些研究表明腸道菌群失調(diào)與JIA之間存在相關(guān)性,了解SoJIA腸道微生物組特點(diǎn)有助于了解SoJIA的發(fā)病機(jī)制,為治療甚至預(yù)防疾病的提供新的思路。本研究旨在探討全身型幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎（SoJIA）的腸道微生物特征,并評估其腸道微生物與臨床指標(biāo)之間的相關(guān)性。方法:本研究為一項(xiàng)單中心病例對照研究。連續(xù)入組2017年7月至2018年12月就診于北京協(xié)和醫(yī)院的SoJIA兒童,同期招募健康兒童作為對照組。SoJIA兒童在來醫(yī)院就診時采集新鮮糞便樣本并收集臨床資料,根據(jù)Wallace標(biāo)準(zhǔn)將SoJIA患兒分為活動組或非活動組。提取糞便基因組DNA,擴(kuò)增其16S rDNA的V4區(qū),并應(yīng)用Illumina HiSeq平臺測序,分析腸道菌群結(jié)構(gòu)。結(jié)果:本研究共納入SoJIA兒童32例,年齡6-16歲,其中活動SoJIA 17例（男性9例,女性8例）,非活動So... 

【文章來源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

患者流程圖

３．２．１糞便ＤＮＡ的提取結(jié)果??（１）糞便ＤＮＡ樣本定量及質(zhì)控提示提取的基因組ＤＮＡ濃度及純度良好，部??分樣本基因組ＤＮＡ的瓊脂凝膠電泳結(jié)果見圖３－２。??ｍｍ??圖３－２．部分糞便基因組ＤＮＡ的凝膠電泳??１９??

?博士學(xué)位論文??（２）?ＰＣＲ擴(kuò)增后的部分產(chǎn)物瓊脂凝膠電泳結(jié)果見圖３－３，其中標(biāo)本１０號和１３??號未檢測到目的條帶，余標(biāo)本ＰＣＲ產(chǎn)物電泳條帶清晰。對１０號和１３號標(biāo)本進(jìn)行??第２次擴(kuò)增，２次擴(kuò)增后目的產(chǎn)物條帶清晰，可進(jìn)行建庫測序，見圖３－４。??圖３－３．部分樣本ＰＣＲ產(chǎn)物的凝膠電泳??＿??圖３－４．二次擴(kuò)增后標(biāo)本１０號和１３號ＰＣＲ產(chǎn)物的凝膠電泳??３．２．２?ＯＴＵ的生成及物種注釋??基于Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ平臺測序所得的１６Ｓ?ｒＤＮＡ序列經(jīng)過Ｆｌａｓｈ軟件進(jìn)行拼接、??過濾和質(zhì)控后，６４例樣本共獲得５２７０３２８條有效序列，平均每個樣本有效序列數(shù)為??８２３４９條，最多９６７４１條／樣本，最少５２６５１條／樣本。以９７％的一致性將序列聚類成??２０??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]普拉梭菌及其上清液對葡聚糖酸鈉誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠Treg/Th17平衡的影響[J]. 張敏,于成功.  胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2017(12)
[2]不加權(quán)算術(shù)平均組對方法的改進(jìn)及應(yīng)用[J]. 李玉鑑,徐立業(yè).  北京工業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2007(12)



本文編號：3506861