空氣污染與哮喘相關(guān)基因多態(tài)性對(duì)兒童哮喘影響的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-09-10 07:42
研究目的:研究TRPV1、SOCS3和STAT6基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與北京漢族兒童哮喘遺傳易感性的關(guān)系;評(píng)估遺傳因素、過敏原、空氣污染及其他環(huán)境因素對(duì)北京漢族兒童哮喘影響的貢獻(xiàn)率。 研究方法:本研究采用成組的病例對(duì)照調(diào)查(221名病例,205名對(duì)照),病例為北京兒童醫(yī)院及首都兒科研究所確診的新發(fā)哮喘患者,對(duì)照為同一醫(yī)院非哮喘、且無呼吸系統(tǒng)炎癥患者。SNP的檢測(cè)采用PCR純化產(chǎn)物直接測(cè)序法,SNP特征通過卡方檢驗(yàn)和Logistic回歸分析SNP的等位基因頻率(MAF)、基因型(genotype)及單倍型。室外空氣污染物的濃度計(jì)算通過大氣污染指數(shù)(API)值進(jìn)行轉(zhuǎn)換為濃度值,取5日連續(xù)平均濃度并進(jìn)行對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換;通過非條件Logistic逐步回歸(向后法,α=0.10)檢驗(yàn)遺傳因素、過敏因素、空氣污染及其他環(huán)境因素對(duì)北京漢族兒童哮喘影響的貢獻(xiàn)率。 研究結(jié)果: 1)經(jīng)序列比對(duì),北京漢族兒童TRPV1基因3'-非翻譯區(qū)(UTR)的SNP包括4個(gè)SNP:rs4790522、rs4790521、rs402369及ENSSNP11193515.哮喘兒童和對(duì)照兒童rs4790521的等位基因頻率存在顯著差異(p0.05); 經(jīng)模型擬合,rs4790521和rs4790522的基因型與兒童哮喘及特應(yīng)性陽性相關(guān)(p0.05),rs4790521和rs4790522兩SNP之間存在連鎖不平衡;此2位點(diǎn)SNP構(gòu)建的3個(gè)單倍型與兒童哮喘的易感性無顯著相關(guān)性。調(diào)整混雜因素后rs4790521基因多態(tài)性、單倍型CC、5日平均空氣污染物SO2濃度、家族遺傳史、個(gè)體特應(yīng)性狀態(tài)(atopic status)及家族成員吸煙均為影響兒童哮喘的重要因素(p0.05)。 2)經(jīng)序列比對(duì),北京漢族兒童SOCS3基因的3'-UTR的SNP包括3個(gè)SNP:rs2280148、rs4969169及rs4969168,經(jīng)檢驗(yàn)哮喘兒童與對(duì)照兒童rs4969168的MAF差異經(jīng)x2檢驗(yàn)有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。 經(jīng)模型擬合及分層卡方檢驗(yàn)(Cochran-Mantel-Haenszel)哮喘兒童與對(duì)照兒童rs4969168、rs4969169的基因型分布存在一定的差異(p0.05); rs4969169基因型與特應(yīng)性陽性相關(guān);rs4969168與特應(yīng)性陽性無顯著相關(guān)性,rs4969169和rs4969168與血清總IgE水平無顯著相關(guān)性(p0.05)。調(diào)整混雜因素后,rs4969169、空氣污染物SO2、家族遺傳史及特應(yīng)性狀態(tài)均為影響兒童哮喘的重要因素(p0.05)。 3) TRPV1基因3'-UTR和SOCS3基因3'-UTR基因SNP關(guān)聯(lián)分析顯示SNP之間存在較強(qiáng)的連鎖不平衡,哮喘兒童與對(duì)照兒童單倍型Hap-C/C的分布差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(p0.05)。 4)經(jīng)序列比對(duì),北京漢族兒童STAT6基因5'-UTR僅見1個(gè)SNP:rs71802646.北京漢族兒童rs71802646二核苷酸(GT)重復(fù)序列多態(tài)性包括3種:13GT(A1)、14GT(A2)和15GT(A3)。 經(jīng)分層卡方x2檢驗(yàn),哮喘兒童與對(duì)照兒童rs71802646的GT重復(fù)片段多態(tài)性差異無顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);rs71802646的GT重復(fù)片段多態(tài)性與特應(yīng)性陽性(atopy)及血清總IgE水平無顯著的相關(guān)性(P0.05)。 5)經(jīng)序列比對(duì),北京漢族兒童STAT6基因3'-UTR未見已知的SNP位點(diǎn),經(jīng)BLAST (BASIC LOCAL ALIGNMENT SEARCH TOOL)比對(duì)發(fā)現(xiàn)在STAT6 3'-UTR區(qū)域的185319345位點(diǎn)(C258T)及185319352位點(diǎn)(T710C)為2個(gè)新的SNP(已注冊(cè))。 經(jīng)卡方檢驗(yàn)哮喘兒童與對(duì)照兒童C258T及T710C等位基因頻率(MAF)差異無顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);經(jīng)基因型擬合,哮喘兒童、特應(yīng)性陽性(atopy)兒童與對(duì)照兒童C258T及T710C基因型分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(p0.05);T710C基因型與血清總IgE水平相關(guān)(P0.05);調(diào)整混雜因素后,T710C基因型對(duì)兒童哮喘影響的貢獻(xiàn)不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(p0.05)。 6)經(jīng)非條件Logistic逐步回歸(向后法,α=0.05)檢驗(yàn),TRPV1及GATA3基因的SNP、家族遺傳史、個(gè)體特應(yīng)性狀態(tài)(atopic)、呼吸道感染和室內(nèi)空氣污染物TVOC濃度為影響兒童哮喘的重要危險(xiǎn)因素。 結(jié)論:TRPV1及SOCS3可能是與兒童哮喘相關(guān)的新的哮喘候選基因;STAT6非翻譯區(qū)基因多態(tài)性與北京漢族兒童哮喘的關(guān)聯(lián)不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性;影響漢族兒童哮喘的主要危險(xiǎn)因素為遺傳因素(貢獻(xiàn)率為40%)和過敏因素(貢獻(xiàn)率為38%);在一定的遺傳背景下,空氣污染的短期波動(dòng)可能對(duì)哮喘有一定的觸發(fā)作用。
【學(xué)位單位】:中國(guó)疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2010
【中圖分類】:R725.6
本文編號(hào):2815560
【學(xué)位單位】:中國(guó)疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2010
【中圖分類】:R725.6
【引證文獻(xiàn)】
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2 宋道嵐;王輔齊;程中;;小兒支氣管哮喘家長(zhǎng)全程健康教育的效果分析[J];醫(yī)學(xué)理論與實(shí)踐;2014年13期
本文編號(hào):2815560
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