PAK3、RAC1基因多態(tài)性與秦巴山區(qū)兒童精神發(fā)育遲滯相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2020-09-08 22:49
秦巴山區(qū)是我國(guó)精神發(fā)育遲滯病癥的高發(fā)區(qū)之一。調(diào)查發(fā)現(xiàn),秦巴山區(qū)精神發(fā)育遲滯具有一定的家族聚集性,提示遺傳因素可能是其病因之一。因此,在秦巴山區(qū)人群中查找精神發(fā)育遲滯相關(guān)致病基因?qū)Ψ乐卧摰貐^(qū)的精神發(fā)育遲滯有重要實(shí)際意義。 多年以來就已觀察到MR患者存在異常的樹突和樹突棘。可能這些異常的結(jié)構(gòu)影響了細(xì)胞和網(wǎng)絡(luò)水平的信息處理。PAK3蛋白是連接Rho GTP酶與細(xì)胞骨架重組及核信號(hào)的重要效應(yīng)因子,在樹突發(fā)育和涉及突觸可塑性的樹突棘中參與細(xì)胞骨架的重組。為了研究PAK3基因在秦巴山區(qū)MR患病中可能的遺傳作用,在PAK3基因處選擇了三個(gè)常見SNPs(rs17327259,rs17327273,rs11152658)進(jìn)行病例對(duì)照研究,rs17327273位于PAK3基因第五內(nèi)含子中,rs17327259位于基因的上游區(qū),rs11152658位于基因的下游區(qū)。采用PCR-SSCP對(duì)各位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行研究。所有基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。病例對(duì)照分析結(jié)果表明各SNP無論在等位基因還是基因型上在病例組和對(duì)照組之間均無顯著性差異。連鎖不平衡分析表明三點(diǎn)間不存在較顯著的連鎖不平衡。 RAC1基因編碼的蛋白為Rho家族小G蛋白,參與調(diào)節(jié)包括細(xì)胞生長(zhǎng)、細(xì)胞骨架重組、蛋白激酶活化在內(nèi)的一系列細(xì)胞事件,且RAC1為PAK3的上游調(diào)控因子。為了研究RAC1基因在秦巴山區(qū)MR患病中可能的遺傳作用,在基因內(nèi)選擇了三個(gè)常見SNPs(rs1647224、rs836488、rs702482)進(jìn)行病例對(duì)照研究。利用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)各位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行研究。各點(diǎn)基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。連鎖不平衡分析表明三點(diǎn)處于連鎖不平衡。病例對(duì)照分析結(jié)果表明各SNP無論在等位基因還是基因型分布上在病例組和對(duì)照組之間均無顯著性差異,但在單倍型分析中表明G-C-A單倍型在病例組和對(duì)照組之間存在顯著性差異,提示RAC1基因G-C-A單倍型為秦巴山區(qū)兒童精神發(fā)育遲滯的易感單倍型。
【學(xué)位單位】:西北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2007
【中圖分類】:R749.94
【部分圖文】:
由于重度精神發(fā)育遲滯兒童可通過相關(guān)臨床診斷確診且其智測(cè)數(shù)據(jù)較難完整獲取及其它因素致使部分血樣缺少對(duì)應(yīng)IQ數(shù)據(jù),此外,由于該批血樣DNA己多年供多人次實(shí)驗(yàn)使用,導(dǎo)致部分DNA樣品耗竭或品質(zhì)下降,在本次研究中不能較好獲取相關(guān)位點(diǎn)分型數(shù)據(jù),致使存在一定數(shù)量缺失值。另外本批次血樣DNA樣品中包含部分具有相同血緣關(guān)系樣品,為防止對(duì)相關(guān)分析的影響,本次研究所用樣本減去具有相同血緣關(guān)系樣品,為無血緣相關(guān)性樣品。且對(duì)由于腦損傷、產(chǎn)時(shí)窒息等明顯非遺傳病因引發(fā)的MR病例不計(jì)入分析。第二章PAK3基因與秦巴山區(qū)MR的相關(guān)性分析人類基因組中與MR相關(guān)的基因分布:通過NCBI檢索到的與精神發(fā)育遲滯(MentaiRetardation)相關(guān)的己知位點(diǎn)有107個(gè),如圖所示。
使PAK3蛋白活化,如下圖所示(Zhou一 shenZHAO2005)。毒,飛歡心1奮丫‘仁(、吸,之冬、1仁x一一一一一鉚卜筑cl.虧丫c多補(bǔ)、K圖2一 2PAK蛋白二聚體
毛毛】r‘“一口:比r姚:,1014盯已5,102刊加弓 弓.,,Ex哪歲氣“口 ~~~如如d閱敘哪月,傭:。份蔥,fof72月7李個(gè)1日ZGS日ZDDD翻貶、側(cè)矛。目.05“內(nèi)..山丫目子d目.‘S“陀陀圖2一 4sNP在PAK3基因中的位置 (httP://snPper.chip.org)三個(gè)SNP位點(diǎn) rs3813180、rs2297874、rsl7327273的基本信息:(l)rs17327273s(C/G) rs17327273所在上下游序列二5,一GGAAGCCTGCCCCCACCArGGC戶a,GTGTACCI一l’IAGCAGCACACAGCI’A1,CTAGCTTGTCTTCTCACACCTTTITTTSTTGTGTC戌仃CAACTAI,TCAAAAACCTTTCTCAGCATATTTTGrl談Jl…ACI’ ACCTCCGATI,TCATCTT習(xí)…CTTCCCTTCCTGAI,TTCCAAGGCT一3,相關(guān)多樣性頻率列表:階味舜…奢謂癸豁{場(chǎng):越豪齊奉?yuàn)^術(shù)茲一}0叫 309習(xí)O力DID加30夕j7卜...............進(jìn)月口.............1以艾1衛(wèi)00..曰.....曰........口............... 011003D40戈犯D乃ID二國(guó)〕口夕17產(chǎn)二個(gè)二弓.卜護(hù)護(hù)書.刀....曰...:認(rèn)::吃門......日.....DD330籠
本文編號(hào):2814730
【學(xué)位單位】:西北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2007
【中圖分類】:R749.94
【部分圖文】:
由于重度精神發(fā)育遲滯兒童可通過相關(guān)臨床診斷確診且其智測(cè)數(shù)據(jù)較難完整獲取及其它因素致使部分血樣缺少對(duì)應(yīng)IQ數(shù)據(jù),此外,由于該批血樣DNA己多年供多人次實(shí)驗(yàn)使用,導(dǎo)致部分DNA樣品耗竭或品質(zhì)下降,在本次研究中不能較好獲取相關(guān)位點(diǎn)分型數(shù)據(jù),致使存在一定數(shù)量缺失值。另外本批次血樣DNA樣品中包含部分具有相同血緣關(guān)系樣品,為防止對(duì)相關(guān)分析的影響,本次研究所用樣本減去具有相同血緣關(guān)系樣品,為無血緣相關(guān)性樣品。且對(duì)由于腦損傷、產(chǎn)時(shí)窒息等明顯非遺傳病因引發(fā)的MR病例不計(jì)入分析。第二章PAK3基因與秦巴山區(qū)MR的相關(guān)性分析人類基因組中與MR相關(guān)的基因分布:通過NCBI檢索到的與精神發(fā)育遲滯(MentaiRetardation)相關(guān)的己知位點(diǎn)有107個(gè),如圖所示。
使PAK3蛋白活化,如下圖所示(Zhou一 shenZHAO2005)。毒,飛歡心1奮丫‘仁(、吸,之冬、1仁x一一一一一鉚卜筑cl.虧丫c多補(bǔ)、K圖2一 2PAK蛋白二聚體
毛毛】r‘“一口:比r姚:,1014盯已5,102刊加弓 弓.,,Ex哪歲氣“口 ~~~如如d閱敘哪月,傭:。份蔥,fof72月7李個(gè)1日ZGS日ZDDD翻貶、側(cè)矛。目.05“內(nèi)..山丫目子d目.‘S“陀陀圖2一 4sNP在PAK3基因中的位置 (httP://snPper.chip.org)三個(gè)SNP位點(diǎn) rs3813180、rs2297874、rsl7327273的基本信息:(l)rs17327273s(C/G) rs17327273所在上下游序列二5,一GGAAGCCTGCCCCCACCArGGC戶a,GTGTACCI一l’IAGCAGCACACAGCI’A1,CTAGCTTGTCTTCTCACACCTTTITTTSTTGTGTC戌仃CAACTAI,TCAAAAACCTTTCTCAGCATATTTTGrl談Jl…ACI’ ACCTCCGATI,TCATCTT習(xí)…CTTCCCTTCCTGAI,TTCCAAGGCT一3,相關(guān)多樣性頻率列表:階味舜…奢謂癸豁{場(chǎng):越豪齊奉?yuàn)^術(shù)茲一}0叫 309習(xí)O力DID加30夕j7卜...............進(jìn)月口.............1以艾1衛(wèi)00..曰.....曰........口............... 011003D40戈犯D乃ID二國(guó)〕口夕17產(chǎn)二個(gè)二弓.卜護(hù)護(hù)書.刀....曰...:認(rèn)::吃門......日.....DD330籠
【引證文獻(xiàn)】
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條
1 鄭振興;寧夏普供碘鹽監(jiān)測(cè)分析暨碘、氟、硒元素生態(tài)學(xué)效應(yīng)的探討[D];寧夏醫(yī)科大學(xué);2010年
本文編號(hào):2814730
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