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兒童川崎病免疫球蛋白治療反應(yīng)性的遺傳學(xué)預(yù)測體系研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-08 14:51
   目的:在中國北方川崎病(Kawasaki Disease,KD)患兒中通過多個(gè)單核苷酸位點(diǎn)多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)比較,分析基因多態(tài)性累積積分對(duì)兒童KD治療反應(yīng)預(yù)測價(jià)值。研究對(duì)象及方法:1.以2009年6月-2017年10月在首都兒科研究所附屬兒童醫(yī)院診斷KD并住院應(yīng)用靜脈注射人免疫球蛋白(Intravenous Immunoglobulin,IVIG)治療(2g/kg)的患兒為研究對(duì)象。2.根據(jù)KD患兒對(duì)IVIG治療反應(yīng)性,分為有反應(yīng)組和無反應(yīng)組。3.通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)及 TaqMan 探針檢測已報(bào)道與IVIG反應(yīng)相關(guān)的SNP。4.通過FISHER確切概率法檢驗(yàn)SNP在反應(yīng)組和無反應(yīng)組之間的差異(SPSS 20.0)。分析所有SNP位點(diǎn)的連鎖關(guān)系(HAPLOVIEW軟件)。通過多因素logistic回歸檢測與IVIG反應(yīng)有關(guān)的SNP(SPSS 20.0)。并將上述與IVIG反應(yīng)有關(guān)SNP位點(diǎn)制作IVIG反應(yīng)性列線圖(Nomogram)用于預(yù)測KD患兒發(fā)生IVIG反應(yīng)性(R軟件)。通過計(jì)算受試者工作特征曲線下面積(Under the Receiver-operating Characteristic(ROC)Curve,AUC)評(píng)估IVIG反應(yīng)性列線圖對(duì)于發(fā)生IVIG反應(yīng)預(yù)測性的最佳界值,并評(píng)估敏感度及特異度(SPSS 20.0)。結(jié)果:1.共有KD患兒161例,無反應(yīng)組51例,有反應(yīng)組110例。無反應(yīng)組男女比例9.4:1,平均年齡2.13±1.58歲,有反應(yīng)組男女比例6.36:1,平均年齡2.13±1.58歲。2.通過NCBI網(wǎng)站查閱文獻(xiàn)并獲取相關(guān)原文,檢索到可能與IVIG反應(yīng)相關(guān)的18個(gè)SNP作為本次試驗(yàn)的目標(biāo)SNP。3.通過Fisher確切概率法檢驗(yàn)18個(gè)SNP的基因及基因型頻率在反應(yīng)組和無反應(yīng)組之間無顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。4.FCGR基因 rs396991 和 rs3219018 及 rs1801274 和 rs3219018 存在連鎖不平衡。IL-1B基因rs16944和rs1143627存在完全連鎖關(guān)系。SMAD5基因rs10056474和rs746994存在連鎖關(guān)系。5.通過多因素 logistic 回歸分析輸出含有rsl6944、rs76863441、rs10056474、rs746994、rs113420705、rs28493229 的 6 個(gè) SNP 位點(diǎn)與 KD 對(duì) IVIG 反應(yīng)性有顯著關(guān)系(P 0.011)。6.用上述6個(gè)SNP位點(diǎn)構(gòu)建IVIG反應(yīng)性列線圖獲得KD患兒個(gè)體對(duì)IVIG反應(yīng)性預(yù)測。通過ROC曲線評(píng)價(jià)IVIG反應(yīng)性列線圖的預(yù)測,曲線下面積為0.701。且當(dāng)KD個(gè)體6個(gè)SNP位點(diǎn)得分為18.25時(shí),發(fā)生IVIG反應(yīng)敏感度為53.6%,特異度為80.4%。結(jié)論:將IL-1B的rs16944 位點(diǎn)、SMAD5的rs10056474、rs746994 位點(diǎn)、PLA2G7的 76863441 位點(diǎn)、ITPKC的 rs28493229 聯(lián)合 CASPASE-3 的 rs113420705 積分累積,可預(yù)測KD患兒對(duì)IVIG治療反應(yīng)性,指導(dǎo)臨床醫(yī)生選擇個(gè)體化的初始治療方案,預(yù)防和減少KD合并冠狀動(dòng)脈并發(fā)癥。
【學(xué)位單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R725.4
【部分圖文】:

基因連鎖,基因


.,..。6.邋36:1,平均年齡邋2.邋13±1.邋58邋歲。逡逑二.有反應(yīng)組和無反應(yīng)組間基因和基因型分布差異逡逑除邋rs403016邋及邋rs447536邋不符合邋Hardy-Weinberg邋平衡(P<1邋X邋1CT),余邋16邋個(gè)逡逑SNP位點(diǎn)均符合。通過Fisher確切概率檢驗(yàn)尚未發(fā)現(xiàn)有反應(yīng)組和無反應(yīng)組16個(gè)SNP逡逑的等位基因及基因型頻率存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.邋05)(表3,邋4)。逡逑三.SNP關(guān)聯(lián)分析及Hardy-Weinberg平衡逡逑考慮到分布在同一基因上不同的SNP位點(diǎn)可能存在連鎖不平衡。通過HAPLOVIEW逡逑4.邋2軟件分別繪制了凡汾?,71-75,5^伯5±的SNP關(guān)聯(lián)性并同時(shí)檢測是否符合逡逑Hardy-Weinberg邋平衡。凡7⑶基因邋rs396991邋和邋rs3219018邋(D,1.0,r2邋0.007)及逡逑rsl801274邋和邋rs3219018邋(D,1.0,邋r2邋0.邋001)存在連鎖不平衡(圖邋1);蝈义希颍螅欤叮梗矗春停颍螅欤欤矗常叮玻反嬖谕耆B鎖關(guān)系(D,1.0,/邋0.邋963)(圖2)。枚基因逡逑rsl0056474邋和邋rs746994邋存在連鎖關(guān)系(D,1.0,r20.邋213)(圖邋3)。逡逑

基因連鎖,基因


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基因連鎖,基因


.,..。6.邋36:1,平均年齡邋2.邋13±1.邋58邋歲。逡逑二.有反應(yīng)組和無反應(yīng)組間基因和基因型分布差異逡逑除邋rs403016邋及邋rs447536邋不符合邋Hardy-Weinberg邋平衡(P<1邋X邋1CT),余邋16邋個(gè)逡逑SNP位點(diǎn)均符合。通過Fisher確切概率檢驗(yàn)尚未發(fā)現(xiàn)有反應(yīng)組和無反應(yīng)組16個(gè)SNP逡逑的等位基因及基因型頻率存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.邋05)(表3,邋4)。逡逑三.SNP關(guān)聯(lián)分析及Hardy-Weinberg平衡逡逑考慮到分布在同一基因上不同的SNP位點(diǎn)可能存在連鎖不平衡。通過HAPLOVIEW逡逑4.邋2軟件分別繪制了凡汾?,71-75,5^伯5±的SNP關(guān)聯(lián)性并同時(shí)檢測是否符合逡逑Hardy-Weinberg邋平衡。凡7⑶基因邋rs396991邋和邋rs3219018邋(D,1.0,r2邋0.007)及逡逑rsl801274邋和邋rs3219018邋(D,1.0,邋r2邋0.邋001)存在連鎖不平衡(圖邋1);蝈义希颍螅欤叮梗矗春停颍螅欤欤矗常叮玻反嬖谕耆B鎖關(guān)系(D,1.0,/邋0.邋963)(圖2)。枚基因逡逑rsl0056474邋和邋rs746994邋存在連鎖關(guān)系(D,1.0,r20.邋213)(圖邋3)。逡逑

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2814306

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