【摘要】： 背景:神經(jīng)管畸形的發(fā)生是由遺傳因素與環(huán)境因素共同作用產(chǎn)生的。平面細(xì)胞極性(planar cell polarity, PCP)途徑對(duì)脊椎動(dòng)物神經(jīng)胚形成非常重要,而PCP基因表達(dá)量及產(chǎn)物的不對(duì)稱(chēng)分布將影響PCP。該途徑中基因的任何突變都可能導(dǎo)致神經(jīng)管不能閉合,其表型與人類(lèi)的顱脊柱裂相似。但是,環(huán)境因素是否影響以及如何影響PCP途徑基因的時(shí)空表達(dá)到目前為止仍然不清楚。 目的:研究維甲酸對(duì)胎鼠Vangl1及Vangl2基因表達(dá)的時(shí)空特征的影響。 方法:全反式維甲酸橄欖油混懸液按120 mg/kg在BALB/C小鼠懷孕第9.5天(E9.5)(G1組)或E10.5(G2組)灌胃。兩組的對(duì)照組(G1c、G2c)在相同時(shí)期僅用等量純橄欖油灌胃。分別取E10.5、E11.5、E13.5、E15.5、E17.5、E19.5胎鼠,Vangl1及Vangl2基因表達(dá)量采用逆轉(zhuǎn)錄酶PCR(RT-PCR)檢測(cè),其時(shí)空表達(dá)采用全胚胎原位雜交(whole-mount in situ hybridization, WISH)檢測(cè)。 結(jié)果:活產(chǎn)NTDs的發(fā)生率及顱面部NTDs發(fā)生率G1組(100%、25.6%)均高于G2組(78.2%、5.7%),P均 0.05。正常情況下Vangl1及Vangl2基因在整個(gè)神經(jīng)胚形成過(guò)程中都有強(qiáng)表達(dá)。而G1組同期對(duì)照組比較,從胎鼠的腦到后神經(jīng)孔Vangl1及Vangl2基因表達(dá)顯著下調(diào)(P均 0.05)。G2組則不同,二基因表達(dá)在全胚胎(從E11.5到E13.5)及神經(jīng)管脊柱區(qū)(從E15.5到E19.5)顯著下調(diào)并維持低表達(dá)水平,但在神經(jīng)管的顱區(qū)(E15.5到E19.5)僅中度下調(diào)(P均 0.05)。 結(jié)論:結(jié)果提示,維甲酸誘導(dǎo)的神經(jīng)管畸形的發(fā)生可能與Vangl1及Vangl2基因轉(zhuǎn)錄子下調(diào)有關(guān)。 背景:神經(jīng)管缺陷(neural tube defects, NTDs)是由環(huán)境危險(xiǎn)因素與遺傳危險(xiǎn)因素間復(fù)雜的相互作用引起的。其潛在的發(fā)病機(jī)理仍然不清楚。從遺傳和環(huán)境角度看,葉酸代謝相關(guān)基因都是NTDs的令人關(guān)注的候選基因。目前葉酸代謝相關(guān)基因間以及基因與環(huán)境間交互作用的研究較少,已有的文獻(xiàn)間還存在相互矛盾。 目的:通過(guò)對(duì)葉酸代謝相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNPs)與多重環(huán)境危險(xiǎn)因子交互作用的關(guān)聯(lián)分析,尋找NTDs致病基因及環(huán)境危險(xiǎn)因素。 方法:收集NTDs流產(chǎn)胎兒組織標(biāo)本或者患者血標(biāo)本(共117例)以及其雙親的血標(biāo)本(共216例),記錄圍孕期補(bǔ)充葉酸、妊娠糖尿病、孕期服藥史等情況。采用CEQ 8800系統(tǒng)進(jìn)行多重SNP分析,對(duì)所有樣本葉酸代謝相關(guān)的12個(gè)基因共28個(gè)SNPs測(cè)序。這些基因是:葉酸受體1及2、溶質(zhì)載體家族19成員1、運(yùn)鈷胺蛋白II、亞甲四氫葉酸脫氫酶1、絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶1、5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶、5-甲基四氫葉酸-同型半胱氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶、5-甲基四氫葉酸-同型半胱氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶還原酶、甜菜堿同型半胱氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶、胱硫醚β合酶和內(nèi)皮一氧化氮合酶3。 通過(guò)病例-雙親對(duì)照研究(case-parent control study)及傳遞/不平衡檢驗(yàn)(transmission/ disequilibrium tests, TDT),分析SNPs與環(huán)境危險(xiǎn)因子(孕期補(bǔ)充葉酸、妊娠糖尿病和孕期服藥史)交互作用對(duì)NTDs發(fā)病的影響。 結(jié)果:亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)rs1801133與NTDs的關(guān)聯(lián)具有顯著性意義(P 0.05),而且環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)因子(未補(bǔ)充葉酸、妊娠糖尿病)對(duì)NTDs的發(fā)生起增效作用;而甜菜堿同型半胱氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(BHMT)rs3733890僅在未補(bǔ)充葉酸層與NTDs存在連鎖不平衡(P 0.05),基因型本身并不能單獨(dú)導(dǎo)致疾病;而其他基因的SNPs與NTDs的發(fā)生沒(méi)有顯著性關(guān)聯(lián)(P均 0.05)。 結(jié)論: MTHFR rs1801133是NTDs的危險(xiǎn)因子,而B(niǎo)HMT rs3733890不是NTDs獨(dú)立的危險(xiǎn)因子。未來(lái)尚需要對(duì)更大的樣本進(jìn)行基因與基因、基因與環(huán)境交互作用的研究。 背景:骨齡評(píng)估對(duì)內(nèi)分泌障礙與生長(zhǎng)落后等疾病的診斷與治療、預(yù)測(cè)成人身高等有重要指導(dǎo)意義。常用的骨齡評(píng)估方法中,Greulich-Pyle法具有主觀性,而Tanner-Whitehouse(TW3)法操作起來(lái)較為復(fù)雜。十多年來(lái)人們一直在探索自動(dòng)化骨齡評(píng)估(automatic bone age assessment, ABAA),但興趣區(qū)(regions of interest, ROI)分割與邊界的識(shí)別仍然是目前限制ABAA的富有挑戰(zhàn)性的難題。 目的:應(yīng)用兩種新的算法即粒子群優(yōu)化(PSO)及人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)以提高自動(dòng)化骨齡評(píng)估的準(zhǔn)確性和實(shí)用性。 方法:建立基于目標(biāo)的ROI。按照Tanner-Whitehouse (TW3)法將ROI分為RUS(包括尺橈骨及掌指骨)ROI及腕骨ROI。每個(gè)興趣區(qū)提取5項(xiàng)特征(包括大小、形態(tài)及融合狀態(tài))輸入人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(artificial neural networks, ANN)分類(lèi)器,ANN建立在前饋的多層網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)上,并以反向傳播算法規(guī)則訓(xùn)練ANN以分別處理RUS及腕骨特征。約1,046份左手及腕的數(shù)字X光片被隨機(jī)分成兩部分,一半用以訓(xùn)練ANN,另一半用以ABAA,而之前全部采用修訂的Greulich-Pyle法人工判讀骨齡。 結(jié)果:人工閱讀骨齡與ABAA比較,RUS骨齡95%的可信區(qū)間是-0.010歲 0.084歲,腕骨骨齡95%的可信區(qū)間是-0.055歲 0.015歲。RUS及腕骨自動(dòng)化骨齡評(píng)估結(jié)果與Greulich-Pyle法比較均具有很高的一致率(分別為97.9%與96.5%),變異系數(shù)相似(3.4與3.7),并且與人工閱讀相比均無(wú)顯著性差異(t=1.563與-1.123,P均 0.05)。 結(jié)論:PSO對(duì)圖像分割與特征的提取更為有效和準(zhǔn)確。該ANN經(jīng)訓(xùn)練后能更全面地處理影像特征信息,準(zhǔn)確判斷骨齡。基于智能算法的ABAA系統(tǒng)成功地應(yīng)用于骨齡0 18歲所有病例。
【圖文】：

G2 組有更高的胎兒流產(chǎn)與吸收比例。3.2 RT-PCR 結(jié)果結(jié)果（圖1-1）表明對(duì)照組從E10.5到E19.5整個(gè)胚胎均能見(jiàn)到Vangl1及Vangl2基因的表達(dá)，只是早期（E10.5）Vangl1 表達(dá)較低。與對(duì)照組不同的是，G1 組 Vangl1 與 Vangl2 基因從 E10.5 到 E19.5 表達(dá)顯著32

原位雜交分析Vangl1與Vangl2在鼠胚胎中的表達(dá)
【學(xué)位授予單位】：華中科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2008
【分類(lèi)號(hào)】：R748

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本文編號(hào)：2690949