【摘要】： 目的研究2006年秋冬季腹瀉患兒輪狀病毒基因型。 方法收集昆明醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院2006年10月～2006年12月住院的腹瀉患兒的糞便標(biāo)本60份,采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)方法檢測RV抗原,逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)法以及巢式聚合酶鏈反應(yīng)(net-PCR)進(jìn)行VP7和VP4基因分型,從VP7陽性標(biāo)本中隨機(jī)挑選出4株重型腹瀉和4株輕型腹瀉患兒以及4株合并呼吸道感染的患兒的標(biāo)本通過逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增NSP4基因并進(jìn)行測序,測序結(jié)果應(yīng)用DNAassist和Clustal-mp以及MEG3.0軟件進(jìn)行序列分析。 結(jié)果(1)60份糞便標(biāo)本中,40份檢測到A組輪狀病毒RNA基因,陽性率為66.7%;(2)40份陽性標(biāo)本進(jìn)行VP7基因分型研究,其中33份擴(kuò)增出VP7基因全長片斷,對陽性標(biāo)本進(jìn)行VP7基因分型研究,G3型為18(54.5%),其中G1型3例(9%),G1和G3混合感染型6例(18.1%),G2和G3混合感染5例(15.1%),G1與G9混合感染1例(3.3%),未發(fā)現(xiàn)其他型;(3)43份陽性標(biāo)本40份擴(kuò)增出VP4基因全長片段,對陽性標(biāo)本進(jìn)行VP4基因研究,P8型為31例(77.5%),P6型4例(10%),P8和P6混合感染型1例(2.5%),未分型4例。(4)輪狀病毒G型和P型的組合G3P8型為主,占42.4%。(5)33份VP7陽性標(biāo)本均可以擴(kuò)增出NSP4的全長片段,在這12株昆明株中有9株與來自GenBank Database的人RV(Wa、KUN、AU-1、Ho-chi)和動物RV(EW、OSU、SA11)同源性分別為90%～94%、80～81%、77%～79%、60%～62%、60.5%～62%、86%～88%、79%～80%,與韓國、斯洛文尼亞以及中國各地區(qū)流行株同源性均在90%以上.3株昆明株與以上來GenBankDatabase的標(biāo)準(zhǔn)株和其他地區(qū)流行株核苷酸和氨基酸的同源性均低于80%. 結(jié)論昆明地區(qū)A組Rv以G3P8型為主要流行基因型,混合感染比例較往年有所增加,并出現(xiàn)新的基因型G9型,合并有呼吸道感染的多為G3P8型;12株昆明地區(qū)輪狀病毒株的NSP4基因9株為Wa型,3株出現(xiàn)變異.
【學(xué)位授予單位】：昆明醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2008
【分類號】：R725.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2684788