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CYP3A5和MDR1的基因多態(tài)性與兒童急性淋巴細(xì)胞白血病的相關(guān)性研究

發(fā)布時間:2020-05-19 22:38
【摘要】: 目的:通過檢測急性淋巴細(xì)胞白血病(Acute lymphoblastic leukemia ,ALL)患兒和對照組兒童中的細(xì)胞色素P450 3A亞家族(Cytochrome P450 subfamilyⅢA ,CYP3A) -6986A/G位點(diǎn)和多藥耐藥基因(Drug resisitance gene1,MDR1) C3435T、C1236T、G2677T/A位點(diǎn)的基因型分布特點(diǎn),探討CYP3A5、MDR1基因多態(tài)性與兒童急性淋巴細(xì)胞白血病易感性和臨床特點(diǎn)的相關(guān)性;檢測ALL患兒的P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)在不同時間點(diǎn)的表達(dá)活性,探討MDR1基因多態(tài)性對P-gp活性的影響。 方法:1、采用病例—對照研究,應(yīng)用單堿基延伸(Single Nucleotide Polymorphisms-shot,SNP-shot)方法,測定176例ALL患兒和170例正常對照組兒童的CYP3A5 -6986A/G和在同一染色體上的MDR1 C3435T、C1236T、G2677T/A的基因型分布、等位基因頻率以及單倍型頻率(同時結(jié)合2007年對CYP3A5 -6986A/G位點(diǎn)的SNPs研究結(jié)果)。2、運(yùn)用流式細(xì)胞儀(Flow cytometry ,FCM)檢測54例ALL患兒分別在初診、強(qiáng)的松誘導(dǎo)后、VDLD化療后的P-gp活性變化。3、將MDR1 C3435T、C1236T、G2677T/A的基因型分布和P-gp活性結(jié)合ALL患兒的性別、年齡、免疫表型、染色體數(shù)量、融合基因等指標(biāo)進(jìn)行臨床相關(guān)性分析。 結(jié)果:1、ALL患兒與正常對照組兒童的CYP3A5 -6986A/G位點(diǎn)存在G/A、G/G和A/A三種基因型;MDR1 C3435T位點(diǎn)存在C/C、C/T和T/T三種基因型;MDR1 C1236T位點(diǎn)存在C/C、C/T和T/T三種基因型;MDR1 G2677T/A位點(diǎn)存在A/A、G/A、G/G、G/T、T/T和T/A六種基因型。 2、ALL患兒與正常對照組兒童在CYP3A5 -6986A/G位點(diǎn)的A/A基因型分布頻率存在顯著差異(22/267 vs 43/290,p=0.030);ALL患兒與正常對照組兒童在MDR1 C3435T位點(diǎn)的T/T基因型分布頻率存在顯著差異(85/176 vs 20/170,p0.0001)。 3、MDR1 C3435T、C1236T、G2677T/A的單倍型TTT/TTT在ALL的高;純旱姆植碱l率較高(7/42 vs 6/88 vs1/46,p=0.037)。 4、MDR1 C3435T、C1236T、G2677T/A的單倍型CTG/CCA在年齡≥10歲的ALL患兒的分布多于年齡10歲的ALL患兒(5/20 vs 7/146,p=0.006);MDR1 C1236T的CT雜合子在年齡≥6歲的ALL患兒的分布多于年齡6歲的ALL患兒(36/26 vs 46/65,p=0.036)。 5、MDR1 C3435T中攜帶TT基因型的ALL患兒其3年長期無病生存(Event-Free Survival,EFS)較低(p=0.03);MDR1 C1236T中攜帶CC基因型的ALL患兒其3年EFS較低(p=0.047)。 6、本研究并未發(fā)現(xiàn)MDR1的SNPs間P-gp的活性存在明顯差異。小結(jié):1、CYP3A5 -6986A/G的基因多態(tài)性與兒童ALL的患病易感性相關(guān);MDR1 C3435T的基因多態(tài)性與兒童ALL的患病易感性相關(guān)。 2、MDR1的基因多態(tài)性的單倍型可以考慮作為評判ALL危險度的指標(biāo)之一。 3、MDR1的基因多態(tài)性可能與ALL患兒的EFS有關(guān)。 4、MDR1的基因多態(tài)性對P-gp的活性的影響有待進(jìn)一步研究。
【圖文】:

單樣本,分型,位點(diǎn),基因頻率


圖 1:隨機(jī)單樣本位點(diǎn)分型圖電泳峰形圖:橙色峰為標(biāo)準(zhǔn)尺寸(SIZE STANDARD),藍(lán)色、綠色、紅色、黑色峰分別代表延伸加入 ddGTP、ddATP、ddTTP 和 ddCTP 的延伸產(chǎn)物,峰下面標(biāo)注的等位基因(如果用的延伸引物是正向的,則跟延伸加入的堿基一致,如果是反向的,則跟延伸加入的堿基互補(bǔ))。二、MDR1 C3435T、MDR1 C1236T、MDR1 G2677T/A 和 CYP3A5 -6986A/G 的位點(diǎn)驗(yàn)證:實(shí)驗(yàn)結(jié)果與美國國立生物信息中心(The National Center for BiotechnologyInformation ,NCBI)的相應(yīng)的 MDR1 C3435T、MDR1 C1236T、MDR1 G2677T/A 和CYP3A5 -6986A/G 的位點(diǎn)通過哈迪—溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE檢驗(yàn),p 值 > 0.05,基因頻率與其報(bào)道無顯著性差異(見表 1)。表 1:本實(shí)驗(yàn)各基因型頻率與基因組單體型圖(Hapmap)的對比基因型基因頻率(本實(shí)驗(yàn)值)基因頻率(Hapmap)HWEP 值
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號】:R733.7

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本文編號:2671589

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