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嬰幼兒時(shí)期使用抗菌藥物對(duì)菌群影響的初步觀察

發(fā)布時(shí)間:2020-05-11 11:08
【摘要】:目的:初步觀察使用抗菌藥物對(duì)肺炎嬰幼兒呼吸道及腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性的影響。方法:選取6例1歲以內(nèi)因社區(qū)獲得性肺炎住院的患兒,收集抗菌藥物治療前及治療后5-7天、1個(gè)月、3個(gè)月的鼻咽拭子、口咽拭子和糞便樣本。利用Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái),對(duì)細(xì)菌的16S rRNA基因V3-V4區(qū)進(jìn)行高通量測(cè)序,并對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果:在抗菌藥物使用后5-7天,(1)嬰幼兒口咽部及腸道菌群的多樣性呈下降趨勢(shì),鼻咽部菌群多樣性呈上升趨勢(shì)。口咽部、鼻咽部及腸道的厚壁菌門的平均相對(duì)豐度呈上升趨勢(shì),變形菌門、梭桿菌門的平均相對(duì)豐度呈下降趨勢(shì)。(2)口咽部的鏈球菌屬、羅氏菌屬平均相對(duì)豐度呈上升趨勢(shì),而韋榮球菌屬、普雷沃屬、嗜血菌屬、莫拉氏菌屬、兼性雙球菌、放線菌屬、纖毛菌屬、奈瑟氏菌屬、奇異菌屬、梭菌屬平均相對(duì)豐度呈下降趨勢(shì);鼻咽部的鏈球菌屬、羅氏菌屬、韋榮球菌屬、放線菌屬、雙歧桿菌屬、芽孢桿菌屬、梭菌屬、Dysgonomonas、氨基酸球菌屬、巨型球菌屬平均相對(duì)豐度呈上升趨勢(shì),而嗜血菌屬、莫拉氏菌屬、奈瑟氏菌屬、葡萄球菌平均相對(duì)豐度呈下降趨勢(shì)。(3)腸道中的大腸桿菌屬、腸球菌屬、羅氏菌屬、莫拉氏菌屬、顆粒鏈菌屬平均相對(duì)豐度呈上升趨勢(shì),嗜血菌屬、普雷沃菌屬、梭菌屬、雙歧桿菌屬、巨型球菌屬、Hungatell-a、丹毒梭菌、Blautia平均相對(duì)豐度呈下降趨勢(shì);部分患兒菌群的多樣性、結(jié)構(gòu)3個(gè)月未能恢復(fù)至正常水平。結(jié)論:嬰幼兒使用抗菌藥物治療肺炎5-7天后,口咽部及腸道菌群的多樣性呈下降趨勢(shì),鼻咽部菌群多樣性呈上升趨勢(shì);菌群結(jié)構(gòu)失調(diào),部分患兒的菌群多樣性、結(jié)構(gòu)3個(gè)月未能恢復(fù)至正常水平。
【圖文】:

序列,PCR擴(kuò)增,文庫(kù)構(gòu)建,磁珠


O............................................................ 7.5-X μLTotal................................................................. 25μL利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,具體結(jié)果見(jiàn)圖1,瓊脂糖凝膠參數(shù):膠濃度:1%;電壓:170V; 電泳時(shí)間:30min;圖1 部分樣本PCR擴(kuò)增結(jié)果鑒定膠圖1.2.2.3 PCR產(chǎn)物定量和均一化參照電泳初步定量結(jié)果,,將 PCR 產(chǎn)物藍(lán)色熒光定量系統(tǒng)進(jìn)行檢測(cè)定量。1.2.2.4 測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建1) 對(duì)每個(gè)樣本的16S rDNA V3-4序列加上特異的Index 序列2) 連接“Y”字形接頭Adaptor3) 使用磁珠篩選去除接頭自連片段4) 利用PCR擴(kuò)增進(jìn)行文庫(kù)模板的富集
【學(xué)位授予單位】:遵義醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R725

【參考文獻(xiàn)】

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2 徐星澈;袁曉鵬;唐立;丁銳;龐立園;劉銀輝;袁杰力;李華軍;李明;郭艷杰;戴曉東;文姝;;不同抗生素對(duì)大鼠上呼吸道菌群定植影響的研究[J];中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志;2015年03期

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5 王艷麗;劉華;姚萍;魯萍;徐靜;周麗芳;黃永坤;;16S rRNA/DNA熒光定量多聚酶鏈反應(yīng)檢測(cè)肺炎嬰幼兒腸道菌群變化[J];實(shí)用兒科臨床雜志;2008年10期

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1 曾本華;建立IHFA小鼠模型研究阿莫西林對(duì)嬰兒腸道菌群的影響[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2012年

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1 劉夢(mèng)昀;嬰兒型雙歧桿菌防治小鼠過(guò)敏性哮喘及食物過(guò)敏的實(shí)驗(yàn)研究[D];遵義醫(yī)學(xué)院;2016年

2 邵華麗;頭孢噻肟鈉對(duì)新生兒腸道菌群的影響[D];浙江大學(xué);2015年



本文編號(hào):2658364

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