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急性呼吸道感染患兒人副流感3型的檢測及臨床研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-23 02:44
【摘要】: 目的 建立套式逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Nested RT-PCR)檢測臨床樣本副流感3型病毒(HPIV3)基因的方法,并進(jìn)一步對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列分析,結(jié)合臨床資料,分析蘭州地區(qū)HPIV3的感染現(xiàn)狀及特征。 方法 1.收集2005年7月~12月,2006年10月~2007年3月蘭州地區(qū)的呼吸道感染患兒的300份鼻咽部分泌物(NPS)標(biāo)本。其中男性162例,女性138例。年齡4天~14歲。 2.根據(jù)HPIV3血凝素蛋白(HN)的基因保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,用套式RT-PCR檢測NPS里的HPIV3基因。 3.對HPIV3在小兒ARI(acute respiratory tract infection)中所占的比例、性別、年齡、季節(jié)分布及臨床特點(diǎn)進(jìn)行分析。 4.隨機(jī)選取11份HPIV3陽性序列,與Genebank上的已知序列進(jìn)行比對,繪制遺傳進(jìn)化樹,從基因進(jìn)化角度對蘭州地區(qū)HPIV3的進(jìn)化特征進(jìn)行初步探討。 結(jié)果 1.300例標(biāo)本用套式RT-PCR檢測出HPIV3陽性46例,占總檢測標(biāo)本的15.33%(46/300)。 2.在HPIV3陽性46例中,男性26例,,感染率為16.04%(26/162),女性20例,,感染率為14.49%(20/138),男性比女性略高。年齡小于3歲的有42例,占總檢出率的91.30%(42/46),其中1歲以下的有17例,占總檢出率的36.96%(17/46)。急性上呼吸道感染(URI)患兒標(biāo)本192例,其中HPIV3檢測陽性標(biāo)本32例,(陽性率為16.67%),急性下呼吸道標(biāo)本108例,其中HPIV3陽性14例(陽性率為12.96%)。 3.在所收集標(biāo)本月份中,每個月份均有HPIV3的檢出,其中2005年11月,2007年1月,2月為高峰期。 4.隨機(jī)選取11份陽性標(biāo)本送檢測序,測得的核苷酸序列經(jīng)過blast軟件比較,與GeneBlank中的已知的HPIV3序列同源性在91.0%~99.6%之間。序列結(jié)果分析提示,隨機(jī)選取的RT-PCR陽性的11例標(biāo)本是HPIV3陽性!  5.基因進(jìn)化樹分析顯示,11份陽性樣本序列屬同一進(jìn)化枝,6份2006年,10月~2007年,3月的樣本序列除145SEQ外屬同一進(jìn)化分枝。而5份2005年的樣本序列除1630SEQ外,與日本分離株同屬同一進(jìn)化分枝。 結(jié)論:   1.HPIV3在蘭州地區(qū)呼吸道感染患兒中占較高的比例,是引起小兒呼吸道感染的重要呼吸道病原之一,其所致呼吸道感染以3歲以下嬰幼兒多見,尤以1歲以下為多,但男女感染比例無顯著性差異(x~2=0.3956 p>0.05),上下呼吸道感染率無顯著差異(x~2=0.7303 P>0.05)!  2.HPIV3在蘭州地區(qū)2005年,7月~12月,2006年,10月~2007年,3月中每個月均有散發(fā),但在冬春季形成流行高峰。   3.套式RT-PCR檢測方法用于HPIV3的基因診斷具有特異性強(qiáng),檢出率高的優(yōu)點(diǎn)!  4.通過基因進(jìn)化樹的分析顯示,2005年樣本序列與2006年樣本序列有很近的親緣關(guān)系,但分屬兩個進(jìn)化分支,說明這兩個時(shí)間段的HPIV3流行株在基因進(jìn)化關(guān)系上存在差異,2005年樣本序列與日本的HPIV3分離株同屬同一進(jìn)化分支,顯示了HPIV3流行株可能存在地域相關(guān)性。
【圖文】:

陽性率


781911311822021761321821524657115225283300465.26%7.69%11.11%10.00%35.29%15.38%11.11%13.33%10.87%21.13%22.73%10.71%15.33%01勺白0

本文編號:2596049

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